| 研究課題/領域番号 |
15K14907
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
環境農学(含ランドスケープ科学)
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| 研究機関 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構 |
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研究代表者 |
星野 辰彦 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 高知コア研究所, 主任研究員 (30386619)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2016年度)
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| 配分額 *注記 |
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
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| キーワード | 微生物 / DNA増幅 / 遺伝子解析 / 遺伝子増幅 / シングルセル / 環境微生物学 |
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| 研究成果の概要 |
単一細胞のゲノムDNAを解読するシングルセルゲノミクスは、微生物の系統および機能に関する情報を網羅的に得ることができるため、環境中の微生物生態を解析する上で非常に有効なツールである。しかし、微生物細胞一つに含まれるDNAは非常に微量でありそこから遺伝子解析をするために十分な量のDNAを増幅することは容易ではなく、海底下深部堆積物に生息する微生物への適用は限られいている。本研究では、新たにタンパク質分解酵素を用いた溶菌プロセス、メタルプレートを用いた遺伝子増幅反応を取り入れることで、コンタミネーションを排除するとともに効率的に海底下堆積物中の単一細胞から遺伝子を増幅する新たな方法論を確立した。
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