アカパンカビゲノム防御機構RIP可視化システムの構築

• 研究課題/領域番号: 15K14916
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 応用分子細胞生物学
• 研究機関: 福井大学
• 研究代表者: 本田 信治 福井大学, 学術研究院医学系部門, 助教 (90632167)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2016年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2015年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
• キーワード: ゲノム防御 / ゲノム編集 / 染色体動態 / ライブイメージング / アカパンカビ

研究成果の概要

糸状菌のアカパンカビはRIPと呼ばれる独特のゲノム防御機構を持つ。RIPは生殖期に重複配列を検出し、両配列とも変異させ、究極的には遺伝子を破壊する。しかし、この分子機構はまったくわかっていない。本研究では、このRIPを可視化するシステムの構築を目指した。まず、青、緑、赤、近赤外の蛍光蛋白質をアカパンカビに最適化し、これらを用いて異なる核内領域を可視化することに成功した。更に、蛍光蛋白質の検出を高めるために、透明化させた子嚢殻（生殖器）を効率よく作製する手法を確立した。現在、改良した蛍光蛋白質を重複配列へ繋ぎ止めさせて検出する手法の最適化を行っている。

研究成果

• [雑誌論文] Normal chromosome conformation depends on subtelomeric facultative heterochromatin Neurospora crassa (2016)
  • 著者名/発表者名: Klocko AD, Ormsby T, Galazka JM, Leggett N, Uesaka M, Honda S, Freitag M, and Selker EU
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 113 号: 52 ページ: 15048-15053
  • DOI: 10.1073/pnas.1615546113
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Dual chromatin recognition by the histone deacetylase complex HCHC is required for proper DNA methylation in Neurospora crassa (2016)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Bicocca VT, Gessaman JD, Rountree MR, Yokoyama A, Yu EY, Selker JM, and Selker EU
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 113 号: 41
  • DOI: 10.1073/pnas.1614279113
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Neurospora chromosomes are organized by blocks of importin alpha-dependent heterochromatin that are largely independent of H3K9me3 (2016)
  • 著者名/発表者名: Galazka JM, Klocko AD, Uesaka M, Honda S, Selker EU, Freitag M
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 26 号: 8 ページ: 1069-1080
  • DOI: 10.1101/gr.203182.115
  • 査読あり / 国際共著
• [学会発表] Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa (2016)
  • 著者名/発表者名: Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
  • 学会等名: EMBO conference
  • 発表場所: Liege, Belgium
  • 年月日: 2016-04-26
  • 国際学会
• [学会発表] Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa (2016)
  • 著者名/発表者名: Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
  • 学会等名: Neurospora meeting 2016
  • 発表場所: California, USA
  • 年月日: 2016-03-10
  • 国際学会
• [備考] 福井大学 学術研究院医学系部門 生命情報医科学講座 染色体機能学領域
  • URL: http://chromosome.med.lab.u-fukui.ac.jp