腫瘍形成に求められるゲノム多様性の検証

• 研究課題/領域番号: 15K15024
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生理学一般
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 中山 啓子 東北大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60294972)
• 研究分担者: 舟山 亮 東北大学, 大学院医学系研究科, 助教 (20452295) ; 中川 直 東北大学, 大学院医学系研究科, 助教 (30707013) ; 細金 正樹 東北大学, 大学院医学系研究科, 助手 (30734347)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2015年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
• キーワード: 腫瘍形成 / CRISPR/Cas9 / 次世代シークエンサー / 乳癌細胞株 / 免疫不全マウス

研究成果の概要

がんゲノムの解析によって、固形腫瘍を構成している細胞は様々な細胞が共生していることが知られるようになった。本研究ではがんはどのような細胞によって構成されているかを探索した。CRISPR/Cas9ライブラリーによってゲノムに多様な変異を導入した細胞から抽出したゲノムDNAのシークエンスを行い、ライブラリーDNAと比較した。その結果、細胞のゲノムDNAライブラリーの多様性は、導入ライブラリーより低下していることが判明した。in vitroで細胞死が誘導や、細胞増殖が抑制されるクローンが存在し、そのような細胞は、他の細胞に比しin vitroでの生存が不利であることを表していると考えている。

研究成果

• [雑誌論文] Genomic analysis identifies candidate pathogenic variants in 9 of 18 patients with unexplained West syndrome. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hino-Fukuyo N, Kikuchi A, Arai-Ichinoi N, Niihori T, Sato R, Suzuki T, Kudo H, Sato Y, Nakayama T, Kakisaka Y, Kubota Y, Kobayashi T, Funayama R, Nakayama K, Uematsu M, Aoki Y, Haginoya K, Kure S.
  • 雑誌名: Hum Genet. 巻: 134 号: 6 ページ: 649-658
  • DOI: 10.1007/s00439-015-1553-6
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mutations in PIGL in a patient with Mabry syndrome. (2015)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara I, Murakami Y, Niihori T, Kanno J, Hakoda A, Sakamoto O, Okamoto N, Funayama R, Nagashima T, Nakayama K, Kinoshita T, Kure S, Matsubara Y, Aoki Y.
  • 雑誌名: Am J Med Genet A. 巻: in press 号: 4 ページ: 777-785
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.36987
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Protein monoubiquitylation: targets and diverse functions (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Nakayama K
  • 雑誌名: Genes to cells 巻: 7 号: 7 ページ: 543-562
  • DOI: 10.1111/gtc.12250
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Role of the Atg9a gene in intrauterine growth and survival of fetal mice. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kojima T, Yamada T, Akaishi R, Furuta I, Saitoh T, Nakabayashi K, Nakayama KI, Nakayama K, Akira S, Minakami H
  • 雑誌名: Reprod.Biol. 巻: 15 号: 3 ページ: 131-138
  • DOI: 10.1016/j.repbio.2015.05.001
  • NAID: 120005828503
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The artificial loss of Runx1 reduces the expression of quiescence-associated transcription factors in CD4(+) T lymphocytes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wong WF, Kohu K, Nagashima T, Funayama R, Matsumoto M, Movahed E, Tan GM, Yeow TC, Looi CY, Kurokawa M, Osato M, Igarashi K, Nakayama K, Satake M.
  • 雑誌名: Mol Immunol. 巻: 68 号: 2 ページ: 223-33
  • DOI: 10.1016/j.molimm.2015.08.012
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Rho-kinase inhibition during early cardiac development causes arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy in mice (2015)
  • 著者名/発表者名: Ellawindy A, Satoh K, Sunamura S, Kikuchi N, Suzuki K, Minami T, Ikeda S, Tanaka S, Shimizu T, Enkhjargal B, Miyata S, Taguchi Y, Handoh T, Kobayashi K, Kobayashi K, Nakayama K, Miura M, Shimokawa H.
  • 雑誌名: Arterioscler Thromb Vasc Biol. 巻: 35 号: 10 ページ: 2172
  • DOI: 10.1161/atvbaha.115.305872
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] S6 Kinase- and beta-TrCP2-Dependent Degradation of p19Arf Is Required for Cell Proliferation (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Araki T, Nakagawa M, Hirao A, Unno M, Nakayama K
  • 雑誌名: Molecular and cellular biology 巻: 20 号: 20 ページ: 3517-3527
  • DOI: 10.1128/mcb.00343-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] セルトリ細胞特異的β-TrCPノックアウトマウスの解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 諸星茜、中川直、中野星児、中山啓子
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸コンベンションセンター（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] TGF-β刺激によるTFIID構成因子TAF7の分解とその役割の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中川直、細金正樹、舟山亮、中山啓子
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸コンベンションセンター（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] がん原遺伝子RASによる遺伝子サイレンシングの分子機構の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮、細金正樹、長嶋剛史、中山啓子
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸コンベンションセンター（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [備考] がん医学コアセンター 細胞増殖制御分野
  • URL: http://www.devgen.med.tohoku.ac.jp/index.html