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SureSelectシステムを用いた歯からの遺伝子解析による個人識別

研究課題

研究課題/領域番号 15K15776
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 社会系歯学
研究機関日本大学

研究代表者

堤 博文  日本大学, 歯学部, 講師 (30188594)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2015年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードABO式血液遺伝子型 / ミトコンドリアDNA型 / HaloPlex / NGS・Miseq / SureSelect / 異同識別 / ミトコンドリアDNA / 次世代シーケンサー
研究成果の概要

キャプチャライブラリキットSureSelectQXTを用いてNGS・MiseqでABO式血液遺伝子型、mtDNA型およびHaloPlex遺伝性不整脈関連心疾患リサーチパネル19遺伝子領域のSNP解析(遺伝性心疾患)の同時解析について検討した。
結果、ABO式血液遺伝子型、mtDNA型および19遺伝子領域の同時解析はすべて可能であった。 ABO式血液遺伝子型判定では、エクソン6および7以外の領域にも変異を認めた。また、mtDNA型を解析したところ、13系統に分類され、遺伝性疾患におけるSNP数は193~245認められた。3種の同時解析により変異プロファイルが多く検出され、識別精度の向上が確認した。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] SureSelectシステムを用いたmtDNA型およびABO式血液遺伝子型の同時 解析2016

    • 著者名/発表者名
      堤 博文,丸山 澄,伊澤 光,小室歳信
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.24

      巻: 24

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] SureSelectシステムを用いた遺伝子解析(第3報)2017

    • 著者名/発表者名
      堤 博文、丸山 澄、伊澤 光、小室歳信
    • 学会等名
      第101次法医学会学術全国集会
    • 発表場所
      長良川国際会議場(岐阜県岐阜市)
    • 年月日
      2017-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Simultaneous analysis of ABO blood genotype, mtDNA and HaloPlex hereditary2016

    • 著者名/発表者名
      Tsutsumi H ,Maruyama S ,Izawa H,Komuro T
    • 学会等名
      The 58th Annual Meeting of Japanese Association for Oral Biolgy
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-08-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] SureSelectシステムを用いた遺伝子解析(第2報)2016

    • 著者名/発表者名
      堤 博文、丸山 澄、伊澤 光、小室歳信
    • 学会等名
      第100次日本法医学会学術全国集会
    • 発表場所
      きゅりあん(東京都品川区)
    • 年月日
      2016-06-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] SureSelectシステムを用いた遺伝子解析2015

    • 著者名/発表者名
      堤 博文、丸山 澄、伊澤 光、小室歳信
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第24回学術集会
    • 発表場所
      岡山大学創立五十周年記念館(岡山県岡山市)
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] NGSシステムを用いたABO式血液遺伝子型およびmtDNA型の同時解析2015

    • 著者名/発表者名
      堤 博文、丸山 澄、伊澤 光、小室歳信
    • 学会等名
      第99次日本法医学会学術全国集会
    • 発表場所
      高知市文化プラザ かるぽーと(高知県高知市)
    • 年月日
      2015-06-10
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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