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効率的な離散最適化手法を用いた化合物の自動立体構造推定法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K15944
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 数理情報学
研究機関南山大学

研究代表者

小市 俊悟  南山大学, 理工学部, 准教授 (50513602)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2017年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2016年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード離散最適化 / 化合物構造推定 / データベース / 核磁気共鳴分析法 / グラフアルゴリズム / 分子構造推定
研究成果の概要

本研究では,構造とNMRスペクトルが既知の化合物データベースを利用して,新規化合物の構造を,そのNMRスペクトルから計算機により自動で推定する方法の確立を最終目的として,その実現のために解くことが必要な様々な組合せ最適化問題を,効率的な離散最適化手法を中心に応用することで解決することを具体的な課題とした.はじめに,グラフ推定問題の効率的な離散最適化解法を応用して,推定法の適用範囲を高い対称性を持つ構造にまで広げることに成功した.また,検索された部分構造について,それらを推定構造として重ねていく際に必要となる順番の生成法の改良に取り組み,最大木問題の解法を応用して新たな生成法を開発した.

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Why do the Togni reagent and some of its derivatives exist in the high-energy hypervalent iodine form? New insight into the origins of their kinetic stability2017

    • 著者名/発表者名
      Koichi Shungo, Leuthold Benjamin, Luethi Hans P.
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 19 号: 48 ページ: 32179-32183

    • DOI

      10.1039/c7cp05943d

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Handling of Highly Symmetric Molecules for Chemical Structure Elucidation in a CAST/CNMR System2016

    • 著者名/発表者名
      Shungo Koichi, Hiroyuki Koshino, Hiroko Satoh
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 14 号: 6 ページ: 193-195

    • DOI

      10.2477/jccj.2015-0067

    • NAID

      130005122723

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] CAST/CNMRシステムを用いたClerodane型ジテルペンの13C NMRの帰属と構造の評価2017

    • 著者名/発表者名
      越野広雪,栗澤尚暎,木村賢一,小市俊悟,佐藤寛子
    • 学会等名
      第56回NMR討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] CAST/CNMRシステムを用いたプレニル化されたフェノール類の構造訂正2017

    • 著者名/発表者名
      越野広雪,小市俊悟,佐藤寛子
    • 学会等名
      第61回香料・テルペンおよび精油化学に関する討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Development of a data-centric stability test for iodanes by using the support vector machine2017

    • 著者名/発表者名
      Shungo Koichi, Hans Peter Luethi
    • 学会等名
      Competence Center for Computational Chemistry (C4) Workshop
    • 発表場所
      Zurich
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] CAST/CNMRシステムを用いた13C NMRシフト値による様々な有機化合物の構造訂正2016

    • 著者名/発表者名
      越野広雪,小市俊悟,佐藤寛子
    • 学会等名
      第55回NMR討論会
    • 発表場所
      広島国際会議場
    • 年月日
      2016-11-16
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] CAST/CNMRシステムを用いたcis-デカリン骨格を有するテルペノイドの立体化学の評価2016

    • 著者名/発表者名
      越野広雪,小市俊悟,佐藤寛子
    • 学会等名
      第60回香料・テルペンおよび精油化学に関する討論会
    • 発表場所
      東京農業大学オホーツクキャンパス
    • 年月日
      2016-10-29
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Structural Revision of Pyrone-related Natural Products by Using CAST/CNMR System2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Koshino, Shungo Koichi, Hiroko Satoh
    • 学会等名
      EUROMAR 2016
    • 発表場所
      Aarhus
    • 年月日
      2016-07-03
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] NMR分子構造解析システムCAST/CNMRにおける対称性が高い構造の自動構造推定について2015

    • 著者名/発表者名
      小市俊悟, 越野広雪, 佐藤寛子
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2015秋季年会
    • 発表場所
      函館市地域交流まちづくりセンター(北海道函館市)
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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