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レシオ変化型核磁気共鳴プローブによる核酸の同時並列的検出法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K16560
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関和歌山大学 (2016)
北陸先端科学技術大学院大学 (2015)

研究代表者

坂本 隆  和歌山大学, システム工学部, 准教授 (80423078)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード同時一斉計測 / 核酸 / 19F NMR / 分子プローブ / フッ素核磁気共鳴 / 同時一斉検出 / 核酸検出
研究成果の概要

複雑な生命現象における分子ネットワークを紐解くには、複数の標的生体分子を同時一斉に定量解析可能な新たな生体分子検出手法の開発が必要である。そこで本研究ではDNAを標的分子とし、単一の分子プローブで複数の標的DNAを検出可能な新たなDNA検出プローブの開発に挑戦した。検出法として複数の信号分離が容易な19F NMR法を採用し、オリゴDNA、並びにDNA結合性低分子を基本骨格とする数種類の分子プローブを合成し、その標的DNA検出能力を評価した結果、配列の異なる4種類の1本鎖DNA並びに2本鎖DNAを同時一斉に検出可能であることが明らかとなった。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Simultaneous detection of single-nucleotide polymorphisms in a DNA bulge structure using fluorine-modified bisbenzimide derivative2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Analyst

      巻: 141 号: 4 ページ: 1214-1217

    • DOI

      10.1039/c5an02389k

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Disassembly-driven signal turn-on probe for multimodal detection of DNAs using 19F NMR and fluorescence2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2016)
    • 発表場所
      100th Anniversary Hall, Kumamoto University
    • 年月日
      2016-09-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 蛍光・19F NMRデュアルモードDNA検出を可能とするOFF/ON型分子プローブの開発2016

    • 著者名/発表者名
      坂本隆、長谷川大策、藤本健造
    • 学会等名
      第10回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      石川県立音楽堂
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] フッ素標識ヘキストプローブを用いた 19F NMR による DNA 検出2016

    • 著者名/発表者名
      坂本隆、長谷川大策、藤本健造
    • 学会等名
      第26回バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス 西9号館ディジタル多目的ホール
    • 年月日
      2016-07-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 19F NMRを用いたDNA1塩基多型の同時一斉解析2016

    • 著者名/発表者名
      坂本隆、長谷川大策、藤本健造
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学 京田辺キャンパス(京都府京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] フッ素修飾ビスベンズイミド誘導体を用いた19F NMRによるDNAのOFF/ON検出2016

    • 著者名/発表者名
      長谷川大策、坂本 隆、藤本健造
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学 京田辺キャンパス(京都府京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of molecular probes for 19F NMR/fluorescence bimodal detection of DNAs in living cells2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2015
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 19F NMR-based analysis of the local sequence and structure of DNAs using fluorine-modified bisbenzimide derivative2015

    • 著者名/発表者名
      Daisaku Hasegawa, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2015
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] フッ素修飾ベンズイミド誘導体を用いたDNA構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      長谷川大策、坂本 隆、藤本健造
    • 学会等名
      平成 27年度北陸地区講演会と研究発表会
    • 発表場所
      金沢大学 角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-11-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Fluorine-modified bisbenzimide derivative as a molecular probe for simultaneous detection of DNAs by 19F NMR2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      The 42th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2015)
    • 発表場所
      イーグレ姫路(兵庫県姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] フッ素修飾ヘキストプローブを用いたDNA構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      長谷川大策、坂本 隆、藤本健造
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学 工学部黒髪南地区キャンパス(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 異なる核酸の同時検出を可能にする新規核酸検出プローブの開発2015

    • 著者名/発表者名
      坂本隆、長谷川大策、藤本健造
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学 工学部黒髪南地区キャンパス(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 19F核磁気共鳴による核酸検出を可能とする新規分子プローブの開発2015

    • 著者名/発表者名
      坂本隆、長谷川大策、藤本健造
    • 学会等名
      第 25 回バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス(東京都目黒区)
    • 年月日
      2015-07-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛍光および19F核磁気共鳴によるDNA検出を可能にする新たな分子プローブの開発2015

    • 著者名/発表者名
      坂本隆、長谷川大策、藤本健造
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会第10回年会
    • 発表場所
      東北大学 川内キャンパス(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-06-12
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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