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エンハンサーの標的決定を超えて:クロマチン基本高次構造の機能的多様性を探る

研究課題

研究課題/領域番号 15K18454
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ゲノム生物学
研究機関東京大学

研究代表者

辻村 太郎  東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (90741893)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2015年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードゲノム / エンハンサー / クロマチン高次構造 / マウス / ゲノム編集 / 片アリル欠失ES細胞 / 腎系統分化誘導
研究成果の概要

Tfap2c-Bmp7遺伝子座において、ゲノムの基本高次構造がどのような様態によりどのような役割を果たすのかを探った。まず、網羅的なゲノム変異導入(欠失または逆位)により、基本高次構造の形成原理を詳細に解明した。さらに、その中で、細胞種特異的なエンハンサー様領域が、クロマチン高次構造の形成にアクティブに寄与する様相を示した。そして、基本高次構造を変換する変異導入により、このエンハンサー様領域の相互作用の様態が変化することが示唆され、基本高次構造とエンハンサー制御の関係について、新規知見を得ることができた。その他、in vitro、in vivoで複数の細胞種におけるエンハンサー解析を進めた。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Roles and regulation of bone morphogenetic protein-7 in kidney development and diseases.2016

    • 著者名/発表者名
      Tsujimura T, Idei M, Yoshikawa M, Takase O, Hishikawa K.
    • 雑誌名

      World J Stem Cells.

      巻: 8 号: 9 ページ: 288-296

    • DOI

      10.4252/wjsc.v8.i9.288

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Spatially differentiated expression of quadruplicated green-sensitive RH2 opsin genes in zebrafish is determined by proximal regulatory regions and gene order to the locus control region2015

    • 著者名/発表者名
      Taro Tsujimura, Ryoko Masud, Ryuichi Ashino, Shoji Kawamura
    • 雑誌名

      BMC Genetics

      巻: 16 号: 1 ページ: 130-130

    • DOI

      10.1186/s12863-015-0288-7

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 効率的ゲノム領域欠失・逆位導入によるクロマチン高次構造形成原理の解析2017

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、出射真奈、吉川真弘、南学正臣、高戸毅、菱川慶一
    • 学会等名
      第16回日本再生医療学会総会
    • 発表場所
      仙台国際センター, 仙台
    • 年月日
      2017-03-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 網羅的なゲノム欠失・逆位導入による、Tfap2c-Bmp7領域のクロマチン高次構造形成メカニズムの解析2016

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、出射真奈、吉川真弘、南学正臣、高戸毅、菱川慶一
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜、横浜
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Differential Usage of Enhancers for Bmp7 in Different Lineages of Kidney Development In Vitro2016

    • 著者名/発表者名
      Taro Tsujimura, Osamu Takase, Masaomi Nangaku, Keiichi Hishikawa
    • 学会等名
      Annual Meeting of American Society of Nephrology KIDNEY WEEK
    • 発表場所
      Chicago, IL, USA
    • 年月日
      2016-11-15
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] in vitroでのBmp7腎臓発生特異的エンハンサーの効率的探索2016

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、南学正臣、菱川慶一
    • 学会等名
      第59回日本腎臓学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜、横浜
    • 年月日
      2016-06-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] マウスES細胞のゲノム編集による、Tfap2c-Bmp7遺伝子座の階層的ドメイン構造の解析2016

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、出射真奈、南学正臣、高戸毅、菱川慶一
    • 学会等名
      第10回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      第10回日本エピジェネティクス研究会
    • 年月日
      2016-05-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] クロマチン構造と遺伝子発現 - 疾患研究への応用を見据えて2016

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎
    • 学会等名
      第60回再生医療カンファレンス
    • 発表場所
      東京大学医学部附属病院
    • 年月日
      2016-04-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 片アリル欠失ES細胞株を用いたBmp7の腎系統分化誘導特異的エンハンサー領域の効率的探索2016

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、出射真奈、南学正臣、高戸毅、菱川慶一
    • 学会等名
      第15回日本再生医療学会総会
    • 発表場所
      大阪国際会議場
    • 年月日
      2016-03-17
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Functional dissection of enhancers for Bmp7 in kidney development2015

    • 著者名/発表者名
      Taro Tsujimura, Osamu Takase, Mana Idei, Francois Spitz, Masaomi Nangaku, Takeshi Takato, Keiichi Hishikawa
    • 学会等名
      Annual Meeting of American Society of Nephrology KIDNEY WEEK
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      2015-11-03
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 腎臓発生におけるBmp7の特異的発現を制御するクロマチン高次構造2015

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎
    • 学会等名
      第45回 日本腎臓学会東部学術大会「よくわかるシリーズ」
    • 発表場所
      東京ミッドタウン
    • 年月日
      2015-10-02
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Linking the hierarchical structure of chromosome domains to functions in gene regulation2015

    • 著者名/発表者名
      Taro Tsujimura
    • 学会等名
      THE 40th NAITO CONFERENCE ON “Epigenetics―From Histone Code to Therapeutic Strategy”
    • 発表場所
      CHATERAISE Gateaux Kingdom SAPPORO
    • 年月日
      2015-09-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 腎臓発生におけるBmp7発現のシス制御機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎, 高瀬敦, 南学正臣, 菱川慶一
    • 学会等名
      第58回日本腎臓学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2015-06-05
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] マウスTfap2c-Bmp7遺伝子座における階層的ドメイン構造の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      辻村太郎、高瀬敦、南学正臣、高戸毅、Francois Spitz, 菱川慶一
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      東京一ツ橋学術総合センター
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Generation of a "semi-haploid" ES cell line for comprehensive characterization of cis-regulatory regions in the Tfap2c-Bmp7 locus.2015

    • 著者名/発表者名
      Taro Tsujimura, Osamu Takase, Mana Idei, Masaomi Nangaku, Takeshi Takato, Keiichi Hishikawa
    • 学会等名
      The 11th International Workshop on Advanced Genomics
    • 発表場所
      Hitotsubashi Hall, Tokyo
    • 年月日
      2015-05-20
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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