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遺伝子核内配置-転写同時ライブイメージングを利用した多能性幹細胞不均一性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K18467
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 システムゲノム科学
研究機関広島大学

研究代表者

落合 博  広島大学, 理学研究科, 特任講師 (60640753)

研究協力者 Liu Zhe  Howard Hughes Medical Institute, Janelia Research Campus, Group Leader
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードクロマチン動態 / 転写 / ライブイメージング / 染色体 / ゲノムDNA / 転写発現 / 遺伝子発現
研究成果の概要

細胞核内では各染色体が完全に混ざり合うこと無く個々の領域を保ち、DNAや核内タンパク質から成る核内構造体が不均一に分布している。また、特定の遺伝子の発現には、プロモーターと遠方の転写調節領域の相互作用が影響することが知られている。しかし、染色体や核内構造体の空間配置は細胞分裂ごとにランダムに決まり、また間期において動的に揺らいでおり、細胞間で遺伝子発現制御能の多様性を生む要因となり得るが、技術的困難が多く、詳細は不明である。本研究では、内在遺伝子の転写と核内配置の同時可視化システムを確立し、本システムを利用してマウス胚性幹細胞における遺伝子発現量の不均一性の発生メカニズムの解明をめざす。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件、 招待講演 6件) 備考 (4件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] HHMI Janelia Campus(米国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Janelia Research Campus, HHMI(米国)

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Howard Hughes Medical Institute(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University College London(英国)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Oslo University Hospital(ノルウェー)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Simultaneous live imaging of the transcription and nuclear position of specific genes2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ochiai, Takeshi Sugawara, Takashi Yamamoto
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 43 号: 19 ページ: e127-e127

    • DOI

      10.1093/nar/gkv624

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Single-Base Pair Genome Editing in Human Cells by Using Site-Specific Endonucleases2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ochiai
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 16 号: 9 ページ: 21128-21137

    • DOI

      10.3390/ijms160921128

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 特定内在遺伝子の転写活性および核内局在のライブイメージング2017

    • 著者名/発表者名
      落合 博
    • 学会等名
      産総研 中国センター シンポジウム ~生命科学の革新的展開~
    • 発表場所
      ホテルセンチュリー21広島 (広島県、広島市)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Relationship between nuclear dynamics and gene expression noise in pluripotent stem cell2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ochiai
    • 学会等名
      第68回日本細胞生物学会
    • 発表場所
      かずさアカデミアホール (千葉県、木更津市)
    • 年月日
      2016-06-15
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Active nuclear dynamics promotes heterochromatin clustering2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ochiai
    • 学会等名
      The 4th International Symposium of the Mathematics on Chromatin Live Dynamics
    • 発表場所
      広島アステールプラザ (広島県・広島市)
    • 年月日
      2015-12-07
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Simultaneous live imaging of a specific gene's transcription and dynamics2015

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H., Sugawara T. & Yamamoto T.
    • 学会等名
      日本分子生物学会・日本生化学会合同大会BMB2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド (兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 間期細胞核ダイナミクスとヘテロクロマチン領域の集合2015

    • 著者名/発表者名
      落合 博
    • 学会等名
      平成27年度遺伝研研究会 「クロマチン・細胞核構造の形成とダイナミクスによるゲノム機能制御」
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所 (静岡県・三島市)
    • 年月日
      2015-10-29
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Simultaneous live imaging of the transcription and nuclear position of specific genes2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ochiai
    • 学会等名
      2015 TIC (Transcription Imaging Consortium) meeting
    • 発表場所
      Janelia Research Campus (VA), USA
    • 年月日
      2015-09-10
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 遺伝子の転写活性と各内局在の同時ライブイメージング2015

    • 著者名/発表者名
      落合 博
    • 学会等名
      第七回 光イメージング若手の会「光塾」
    • 発表場所
      広島大学 (広島県・東広島市)
    • 年月日
      2015-09-05
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Simultaneous Live Imaging of the Transcription and Nuclear Position of Specific Genes2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Ochiai
    • 学会等名
      International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
    • 発表場所
      淡路夢舞台 (兵庫県・淡路市)
    • 年月日
      2015-08-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [備考] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/HiroshiOchiai/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] researchmap

    • URL

      http://researchmap.jp/HiroshiOchiai/

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [備考] Researchmapページ

    • URL

      https://researchmap.jp/HiroshiOchiai/

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] Researchgateページ

    • URL

      https://www.researchgate.net/profile/Hiroshi_Ochiai3

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [産業財産権] 細胞の作製方法および該作製方法で作製された細胞2015

    • 発明者名
      落合 博, 山本 卓
    • 権利者名
      国立大学法人広島大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2015-080648
    • 出願年月日
      2015-04-10
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2022-06-07  

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