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真正細菌の翻訳後アセチル化による翻訳制御機構の構成的な理解

研究課題

研究課題/領域番号 15K18469
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 システムゲノム科学
研究機関東京理科大学

研究代表者

楳原 琢哉  東京理科大学, 基礎工学部生物工学科, 助教 (00415548)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード翻訳後修飾 / アセチル化 / アミノアシル-tRNA合成酵素 / 翻訳制御 / アミノアシルtRNA合成酵素
研究成果の概要

本研究は真正細菌におけるリジンのアセチル化による翻訳制御を理解することを目的とした。大腸菌アラニル-tRNA合成酵素(AlaRS)の74番目のリジンのアセチル化は活性を大きく減弱させた。大腸菌の脱アセチル化酵素(CobB)はin vivoではこのアセチル化を除去できたが、in vitroではわずかであった。CobBがリボソームと相互作用するという報告に基づき、「AlaRS K74Acはリボソーム上で脱アセチル化される」という仮説を立てた。しかし、リボソームと相互作用しないCobB変異体の解析から仮説とは異なる結果が得られ、脱アセチル化に関わる新たな分子の存在が示唆された。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] The Kiss Switch Brings Inactive R3C Ligase Ribozyme Back to Life2018

    • 著者名/発表者名
      Kana Tanizawa, Sayuri Uchida, Eri Kurihara, Takuya Umehara, Koji Tamura
    • 雑誌名

      Biology

      巻: 7 号: 1 ページ: 7-7

    • DOI

      10.3390/biology7010007

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A step into the RNA world: Conditional analysis of hydrogel formationof adenosine 5'2017

    • 著者名/発表者名
      Takumi Yokosawa, Ryota Enomoto, Sho Uchino, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Koji Tamura
    • 雑誌名

      BioSystems

      巻: 162 ページ: 53-58

    • DOI

      10.1016/j.biosystems.2017.09.004

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Binding Properties of Split tRNA to the C-terminal Domain of Methionyl-tRNA Synthetase of Nanoarchaeum equitans2017

    • 著者名/発表者名
      Hidemichi Suzuki, Akihiro Kaneko, Taro Yamamoto, Mahoko Nambo, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Hisashi Yoshida, Sam-Yong Park, Koji Tamura
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Evolution

      巻: 84 号: 5-6 ページ: 267-278

    • DOI

      10.1007/s00239-017-9796-6

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA-dependent cysteine biosynthesis in bacteria and archaea.2017

    • 著者名/発表者名
      Takahito Mukai, Ana Crnkovic, Takuya Umehara, Natalia Ivanova, Nikos Kyrpides and Dieter Soll
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A genomically modified Escherichia coli strain carrying an orthogonal E. coli histidyl-tRNA synthetase / tRNA(His) pair.2017

    • 著者名/発表者名
      Markus Englert, Oscar Vargas-Rodriguez, Noah M. Reynolds, Yane-Shih Wang, Dieter Soll and Takuya Umehara
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta General Subjects

      巻: 印刷中 号: 11 ページ: 3009-3015

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2017.03.003

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] テトラグリシン結合RNAの試験管内選択2016

    • 著者名/発表者名
      菊地大輔、楳原琢哉、田村浩二
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-12-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌アラニル-tRNA合成酵素の翻訳後アセチル化修飾による機能制御機構の解明2016

    • 著者名/発表者名
      根本隆作、田村浩二、楳原琢哉
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-12-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌アラニル-tRNA合成酵素におけるアラニン活性化最小領域の探索2016

    • 著者名/発表者名
      小山美樹、楳原琢哉、田村浩二
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2016-12-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 二酸化炭素存在下におけるアミノ酸の重合2015

    • 著者名/発表者名
      田丸綾子、楳原琢哉、田村浩二
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-03
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 原始アミノ酸を用いたβシートの形成と遺伝暗号の起源2015

    • 著者名/発表者名
      澤田理沙、小松令奈、楳原琢哉、田村浩二
    • 学会等名
      東京理科大学 総合研究院 アグリ・バイオ工学研究部門 公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京理科大学葛飾キャンパス
    • 年月日
      2015-07-17
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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