レトロトランスポゾン転写制御機構の解析

• 研究課題/領域番号: 15K18578
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 遺伝・染色体動態
• 研究機関: 岡山大学
• 研究代表者: 池田 陽子 岡山大学, 資源植物科学研究所, 特任助教 (80467688)
• 研究協力者: Mathieu Olivier クレルモンフェラン大学, Principal investigator
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: トランスポゾン / エピジェネティクス / サイレンシング

研究成果の概要

レトロトランスポゾンの転写制御機構を明らかにするため、シロイヌナズナを用いトランスポゾンサイレンシングに異常がみられる変異体を単離解析し、トランスポゾン抑制に関わる新規因子KUMONOSU(KUN)を明らかにした。KUNは植物に特有のトランスポゾン関連ドメインであるPlant mobile domainを有し、DNAメチル化や主要なクロマチン修飾とは異なる新規の機構でペリセントロメア領域の凝集に関わることでサイレンシングを制御することを明らかにした。

研究成果

• [国際共同研究] Universite Clermont Auvergne/CNRS/Inserm(フランス)
• [国際共同研究] Max planck institute/Universitat Hamburg(ドイツ)
• [国際共同研究] Universite Clermont Auvergne/CNRS/Inserm(フランス)
• [国際共同研究] Max Planck Institute/Universitat Hamburg(ドイツ)
• [国際共同研究] CNRS, UMR 6293/INSERM U1103(Olivier Mathieu)
• [雑誌論文] Arabidopsis proteins with a transposon-related domain act in gene silencing. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y., Pelissier, T., Bourguet, P., Becker, C., Pouch-Pelissier, M. N., Pogorelcnik, R., Weingartner, M., Weigel, D., Deragon, J. M. and Mathieu, O.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 8 号: 1 ページ: 15122-15122
  • DOI: 10.1038/ncomms15122
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive quantification and genome survey reveal the presence of novel phytohormone action modes in red seaweeds (2016)
  • 著者名/発表者名: Mikami, K., Mori, I.C., Matsuura, T., Ikeda, Y., Kojima, M., Sakakibara, H., Hirayama, T.
  • 雑誌名: J. Applied Phycology 巻: 未定 号: 4 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1007/s10811-015-0759-2
  • NAID: 120006329010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenome confrontation triggers immediate reprogramming of DNA methylation and transposon silencing in Arabidopsis thaliana F1 epihybrids. (2016)
  • 著者名/発表者名: Rigal M, Becker C, Pélissier T, Pogorelcnik R, Devos J, Ikeda Y, Weigel D, Mathieu O.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 巻: 113 号: 14 ページ: 2083-2092
  • DOI: 10.1073/pnas.1600672113
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Light inhibition of shoot regeneration is regulated by endogenous abscisic acid level in calli derived from immature barley embryos. (2015)
  • 著者名/発表者名: Rikiishi K., Matsuura T., Ikeda Y., Maekawa M.
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: オンライン雑誌のためなし 号: 12 ページ: e0145242-e0145242
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0145242
  • 査読あり
• [学会発表] KUMONOSU protein harboring a transposon-related domain act in gene silencing in Arabidopsis (2017)
  • 著者名/発表者名: 池田陽子 他
  • 学会等名: 第58回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 鹿児島大学
  • 年月日: 2017-03-16
• [学会発表] Epigenetic response to various environments in plants and its mechanism. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ikeda
  • 学会等名: 第33回資源植物科学シンポジウム・第9回植物ストレス科学研究シンポジウム
  • 発表場所: 倉敷
  • 年月日: 2017-03-06
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] トランスポゾン関連ドメインをもつ新規遺伝子サイレンシング因子の同定 (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y., Pelissier, T., Bourguet, P., Becker, C., Pouch-Pelissier, M. N., Pogorelcnik, R., Weingartner, M., Weigel, D., Deragon, J. M. and Mathieu, O.
  • 学会等名: 日本植物学会第81回大会
• [学会発表] トランスポゾン関連ドメインをもつ新規遺伝子サイレンシング因子の同定 (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y., Pelissier, T., Bourguet, P., Becker, C., Pouch-Pelissier, M. N., Pogorelcnik, R., Weingartner, M., Weigel, D., Deragon, J. M. and Mathieu, O.
  • 学会等名: 日本遺伝学会第89回大会
• [学会発表] The role of plant mobile domain family protein in gene silencing. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y.
  • 学会等名: 国立遺伝学研究所 研究集会
  • 招待講演
• [学会発表] DNA methylation is necessary for maintaining differentiated cells in Marchantia polymorpha. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yoko Ikeda 他
  • 学会等名: The EMBO Workshop: New model systems for early land plant evolution.
  • 発表場所: Vienna, Austria
  • 年月日: 2016-06-22
  • 国際学会
• [学会発表] ゼニゴケにおけるDNAメチル化の機能解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 池田陽子, 西浜竜一, 山岡尚平, 河内孝之, 平山隆志
  • 学会等名: 日本植物生理学会第５７回年会
  • 発表場所: 岩手大学
  • 年月日: 2016-03-18
• [学会発表] シロイヌナズナKUMONOSU遺伝子はヘテロクロマチンサイレンシングに関与する. (2015)
  • 著者名/発表者名: 池田陽子・Olivier Mathieu
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会ワークショップ「植物エピゲノム研究の最前線」
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] Identification of a new heterochromatic silencing related factor in Arabidopsis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y.
  • 学会等名: 国立遺伝学研究所 研究集会
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2015-07-29
• [図書] Chapter 2. The role of DNA methylation in transposable element silencing and genomic imprinting. Nuclear Functions in Plant Transcription, Signaling and Development. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y., Nishimura, T.
  • 総ページ数: 18
  • 出版者: Springer