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エピジェネティック修飾に関わる自然選択の検出

研究課題

研究課題/領域番号 15K18585
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 進化生物学
研究機関総合研究大学院大学

研究代表者

宅野 将平  総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 助教(特定有期雇用) (20547294)

研究協力者 Gaut Brandon S.  University of California, Irvine, Department of Ecology and Evolutionary Biology, Professor
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2017年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2016年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワードゲノム進化 / エピジェネティクス / 自然選択
研究成果の概要

ゲノム進化学にエピジェネティクスを取り入れ、ゲノムーエピゲノム間の進化的インタラクションと新たな自然選択の検出を目指して研究を行った。エピゲノムのうち、DNAメチル化に着目して研究を行った。陸上植物のDNAメチル化、特に遺伝子内メチル化に焦点を当てて、解析を行った。遺伝子内メチル化は自然選択により、長期間植物種のオーソログで保存されていた。遺伝子内メチル化レベルは、トランスポゾン増加によるDNAメチル化レベルの影響を受け進化していた。さらに、遺伝子内メチル化を保護するため、そのメチル化を持つ遺伝子のDNA配列への自然選択が検出された。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 3件、 査読あり 4件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of California, Irvine(米国)

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Univerisity of California, Irvine(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] The evolutionary dynamics of orthologs that shift in gene body methylation between Arabidopsis species.2017

    • 著者名/発表者名
      S. Takuno, D. K. Seymour, B. S. Gaut
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 1479-1491

    • DOI

      10.1093/molbev/msx099

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Evolutionary patterns of genic DNA methylation vary across land plants.2016

    • 著者名/発表者名
      S. Takuno, J. H. Ran, B. S. Gaut
    • 雑誌名

      Nature Plants

      巻: 2 号: 2 ページ: 15222-15222

    • DOI

      10.1038/nplants.2015.222

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A role for palindromic structures in the cis-region of maize Sirevirus LTRs in transposable element evolution and host epigenetic response.2016

    • 著者名/発表者名
      A. Bousios, C. M. Diez, S. Takuno, V. Bystry, N. Darzentas, B. S. Gaut
    • 雑誌名

      Genome Research

      巻: 26 号: 2 ページ: 226-237

    • DOI

      10.1101/gr.193763.115

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Epigenetic regulation of intragenic transposable elements impacts gene transcription in Arabidopsis thaliana.2015

    • 著者名/発表者名
      Le Tu N., Miyazaki Y., Takuno S., Saze H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 43 号: 8 ページ: 3911-21

    • DOI

      10.1093/nar/gkv258

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 陸上植物における遺伝子領域のDNAメチル化の進化パターン.2016

    • 著者名/発表者名
      宅野将平, J. H. Ran, B. S. Gaut
    • 学会等名
      日本遺伝学会第88大会
    • 発表場所
      日本大学
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 陸上植物におけるゲノムサイズとDNAメチル化レベルの共進化.2016

    • 著者名/発表者名
      宅野将平, J. H. Ran, B. S. Gaut
    • 学会等名
      第10回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2016-05-19
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Evolutionary patterns of genic DNA methylation across a broad taxonomic sample of Land Plants.2016

    • 著者名/発表者名
      S. Takuno, J. H. Ran & B. S. Gaut
    • 学会等名
      Plant & Animal Genome Conference XXIV
    • 発表場所
      San Diego, California
    • 年月日
      2016-01-14
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 植物における遺伝子内メチル化の進化パターン.2016

    • 著者名/発表者名
      宅野将平
    • 学会等名
      木原生物学研究所ミニ研究集会
    • 発表場所
      木原生物学研究所
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNAメチル化と塩基配列の共進化2015

    • 著者名/発表者名
      宅野将平
    • 学会等名
      日本遺伝学会
    • 発表場所
      東北大学、宮城
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 進化遺伝学とエピジェネティクス2015

    • 著者名/発表者名
      宅野将平
    • 学会等名
      日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      学術総合センター一橋講堂、東京
    • 年月日
      2015-05-25
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] Takuno Lab

    • URL

      https://sites.google.com/site/shoheitakuno/

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書 2015 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2022-02-16  

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