カンキツのゲノム情報を利用したわい化関連遺伝子座の同定

• 研究課題/領域番号: 15K18643
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 園芸科学
• 研究機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
• 研究代表者: 後藤 新悟 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹茶業研究部門, 主任研究員 (60433215)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2017年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
• キーワード: カンキツ / SSRマーカー / ゲノム情報 / わい化 / マイクロアレイ / DNAマーカー / ゲノム

研究成果の概要

ヒリュウとウンリュウはカラタチのわい化系統であるが、ヒリュウはカラタチの変異系統、ウンリュウは自殖後代であることがわかっている。そこで、ヒリュウとウンリュウをマイクロアレイ解析によって、わい化関連遺伝子を特定し、カラタチとウンリュウの遺伝子型をゲノムワイドに比較することによって、ウンリュウ特異的ホモ化領域、すなわち、わい化関連領域を特定した。ヒリュウ自殖後代に出現した極度のわい化系統においてわい化関連遺伝子とわい化関連領域が重なり合った領域を同定することによって、最終的にEY717552遺伝子がわい化の原因である可能性が示された。

研究成果

• [雑誌論文] Ectopic accumulation of linalool confers resistance to Xanthomonas citri subsp. citri in transgenic sweet orange plants (2017)
  • 著者名/発表者名: T. Shimada, T. Endo, A. Rodriguez, H. Fujii, S. Goto, T. Matsuura, Y. Hojo, Y. Ikeda, I. Mori, T. Fujikawa, L. Pena, M. Omura
  • 雑誌名: Tree Physiology 巻: 印刷中
  • DOI: 10.1093/treephys/tpw134
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Hybrid origins of citrus varieties inferred from DNA marker analysis of nuclear and organelle genomes (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Shimizu, A. Kitajima, K. Nonaka, T. Yoshioka, S. Ohta, S. Goto, A. Toyoda, A. Fujiyama, T. Mochizuki, H. Nagasaki, E. Kaminuma, Y. Nakamura
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 11 号: 11 ページ: e0166969-e0166969
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0166969
  • NAID: 120005947172
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Segregation and heritability of male sterility in populations derived from progeny of Satsuma mandarin. (2016)
  • 著者名/発表者名: S Goto, T Yoshioka, S Ohta, M Kita, H Hamada, T Shimizu
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 11 号: 9 ページ: e0162408-e0162408
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0162408
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 温州ミカン後代集団におけるカンキツ雄性不稔性QTLの検出とその効果の検証 (2017)
  • 著者名/発表者名: 後藤新悟、吉岡照高、太田智、喜多正幸、濱田宏子、清水徳朗
  • 学会等名: 日本育種学第131回講演会
  • 発表場所: 名古屋大学（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2017-03-29
• [学会発表] 高精度DNAマーカー分析による在来カンキツ品種の類縁関係の推定 (2016)
  • 著者名/発表者名: 清水徳朗、野中圭介、吉岡照高、太田智、後藤新悟、北島宣、神沼英里、中村保一
  • 学会等名: 園芸学会
  • 発表場所: 東京農業大学農学部（神奈川県厚木市）
  • 年月日: 2016-03-26
• [学会発表] カンキツの高密度連鎖地図の構築と参照ゲノム配列との比較 (2016)
  • 著者名/発表者名: 清水徳朗、神沼英里、野中圭介、吉岡照高、後藤新悟、松本敏美、片寄裕一、望月孝子、谷澤靖洋、豊田敦、藤山秋佐夫、中村保一
  • 学会等名: 育種学会
  • 発表場所: 横浜市立大学（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-03-21