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しらが病菌によるアワの穂の葉化メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K18650
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 植物保護科学
研究機関公益財団法人岩手生物工学研究センター

研究代表者

小林 光智衣  公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 研究員 (10751539)

研究協力者 平賀 幸江  (公財)岩手生物工学研究センター, 技術員
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2015年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード植物病原菌ゲノム / 病原性エフェクター / 感染生理 / エフェクター / べと病菌 / アワ / 植物病原菌のゲノム解析 / 植物病原菌の全ゲノム解読 / 花成抑制因子
研究成果の概要

アワしらが病菌の全ゲノム解読とRNA-seq解析を行った結果、ゲノムサイズは約360Mbであり、推定の遺伝子数は16736個だった。推定の分泌タンパク質は1220個あり、既知のエフェクター様タンパク質に加えてJacalin様タンパク質を多くコードしていた。Jacalin様タンパク質は感染初期に遺伝子発現が誘導され、感染時のアポプラスト画分に検出されたことから、感染初期に植物の防御応答を抑制することが示唆された。
罹病した穂では花成の負の制御因子であるMADS47の発現が増加していた。一方、正の制御因子の一部はタンパク質の蓄積が減少することがわかり、これが葉化病徴の引き金になっていると考えられた。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Genome analysis of the foxtail millet pathogen Sclerospora graminicola reveals the complex effector repertoire of graminicolous downy mildews2017

    • 著者名/発表者名
      Michie Kobayashi, Yukie Hiraka, Akira Abe, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Hideko Kikuchi, Hiroki Takagi, Hiromasa Saitoh, Joe Win, Sophien Kamoun, Ryohei Terauchi
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 18 号: 1

    • DOI

      10.1186/s12864-017-4296-z

    • NAID

      120006645322

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] アワしらが病菌新規エフェクター候補の解析2018

    • 著者名/発表者名
      小林光智衣・平賀幸江・阿部陽・八重樫弘樹・夏目俊・菊池秀子・寺内良平
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] アワしらが病菌ではJacalin様レクチンが独自に進化している2017

    • 著者名/発表者名
      小林光智衣・平賀幸江・阿部陽・八重樫弘樹・夏目俊・菊池秀子・齋藤宏昌・寺内良平
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学 郡元キャンパス
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] アワしらが病菌の全ゲノムシーケンス解析2016

    • 著者名/発表者名
      小林光智衣
    • 学会等名
      農学中手の会
    • 発表場所
      雄琴温泉 湯の宿 木もれび
    • 年月日
      2016-11-10
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Whole genome sequencing of the oomycete pathogen Sclerospora graminicola and prediction of effector candidates2016

    • 著者名/発表者名
      Michie Kobayashi, Yukie Hiraka, Akira Abe, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Hideko Kikuchi, Hiroki Takagi, Hiromasa Saitoh, Joe Win, Sophien Kamoun, Ryohei Terauchi
    • 学会等名
      2016 IS-MPMI XVII Congress
    • 発表場所
      the Oregon Convention Center
    • 年月日
      2016-07-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] アワしらが病菌の全ゲノムシーケンス解析によるエフェクター候補遺伝子の探索2016

    • 著者名/発表者名
      小林光智衣・平賀幸江・植村亜衣子・阿部陽・高木宏樹・齋藤宏昌・寺内良平
    • 学会等名
      平成28年度日本植物病理学会大会
    • 発表場所
      岡山コンベンションセンター
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] アワしらが病ゲノムの解析2015

    • 著者名/発表者名
      小林光智衣・平賀幸江・八重樫弘樹・夏目俊・阿部陽・高木宏樹・齋藤宏昌・寺内良平
    • 学会等名
      平成27年度植物感染生理談話会
    • 発表場所
      メルパルク松山
    • 年月日
      2015-08-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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