イヌのリンパ腫におけるDNAメチル化のゲノムワイド解析―機序解明と臨床応用―

• 研究課題/領域番号: 15K18789
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 獣医学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 山崎 淳平 北海道大学, 獣医学研究科, 助教 (20732902)
• 研究期間 (年度): 2015-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2016年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2015年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: DNAメチル化 / エピジェネティクス / リンパ腫 / エピゲノム / 臨床 / 癌 / ゲノム

研究成果の概要

イヌリンパ腫細胞株5株に関し、次世代シークエンサーによる解析を行ったところ、約100,000CpGサイトのDNAメチル化の定量的な解析が可能であった。また、正常血液サンプルとリンパ腫細胞株の区別が可能であった。さらに、各々のリンパ腫細胞株において1000～4000個の高メチル化部位、および3000~10,000個の低メチル化部位が発見された。これらのうち、特に高メチル化部位の近傍には腫瘍に関連すると考えられる遺伝子が認められた。
イヌのリンパ腫自然発症例24例についても同様の解析・検討を行ったところ、DNAメチル化のグループ分けが予後因子となる可能性が示された。

研究成果

• [雑誌論文] A CpG island methylator phenotype in acute myeloid leukemia independent of IDH mutations and associated with a favorable outcome. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kelly AD, Kroeger H, Yamazaki J, Taby R, Neumann F, Yu S, Lee JT, Patel B, Li Y, He R, Liang S, Lu Y, Cesaroni M, Pierce SA, Kornblau SM, Bueso-Ramos CE, Ravandi F, Kantarjian HM, Jelinek J, Issa JP
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 印刷中 号: 10 ページ: 2011-2019
  • DOI: 10.1038/leu.2017.12
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Hypomethylation of TET2 target genes identifies a curable subset of acute myeloid leukemia. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki J, Taby R, Jelinek J, Raynal NJ, Cesaroni M, Pierce SA, Kornblau SM, Bueso-Ramos CE, Ravandi F, Kantarjian HM, Issa JP
  • 雑誌名: J. Natl. Cancer Inst. 巻: 108 号: 2
  • DOI: 10.1093/jnci/djv323
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Mutation spectrum of TP53 gene predicts clinicopathological features and survival of gastric cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tahara T, Shibata T, Okamoto Y, Yamazaki J, Kawamura T, Horiguchi N, Okubo M, Nakano N, Ishizuka T, Nagasaka M, Nakagawa Y, Ohmiya N
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 7 号: 27 ページ: 42252-42260
  • DOI: 10.18632/oncotarget.9770
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] TET2 mutations affect non-CpG island DNA methylation at enhancers and transcription factor binding sites in chronic myelomonocytic leukemia. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki J, Jelinek J, Lu Y, Cesaroni M, Madzo J, Neumann F, He R, Taby R, Vasanthakumar A, Macrae T, Ostler KR, Kantarjian HM, Liang S, Estecio MR, Godley LA, Issa JP
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: 75 号: 14 ページ: 2833-43
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-14-0739
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Methylome sequencing for fibrolamellar hepatocellular carcinoma depicts distinctive features. (2015)
  • 著者名/発表者名: Malouf GG, Tahara T, Paradis V, Fabre M, Guettier C, Yamazaki J, Long H, Lu Y, Raynal NJ, Jelinek J, Mouawad R, Khayat D, Brugieres L, Raymond E, Issa JP
  • 雑誌名: Epigenetics 巻: 10 号: 9 ページ: 872-81
  • DOI: 10.1080/15592294.2015.1076955
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] 犬のリンパ腫における微小残存病変（MRD) (2015)
  • 著者名/発表者名: 山崎淳平
  • 雑誌名: Veterinary Oncology 巻: 5 ページ: 34-43
• [学会発表] イヌにおけるDNAメチル化のゲノムワイド解析法の樹立 (2017)
  • 著者名/発表者名: 久本 真也, 山崎 淳平, 稲葉 睦
  • 学会等名: 第13回 日本獣医内科学アカデミー（JCVIM）学術大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜 横浜市
  • 年月日: 2017-02-17
• [学会発表] Identification of TET2-specific differentially methylated CpG sites that define a curable subset of acute myeloid leukemia. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki J, Jelinek J, Cesaroni M, Madzo J, Taby R, Kantarjian HM, Godley LA and Issa JP
  • 学会等名: 40th The Naito Conference
  • 発表場所: Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo
  • 年月日: 2015-09-15
  • 国際学会