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肝発癌例での次世代シークエンサーを用いたHBV遺伝子変異と宿主遺伝子多型の解析

研究課題

研究課題/領域番号 15K19345
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 消化器内科学
研究機関大阪市立大学

研究代表者

小塚 立蔵  大阪市立大学, 大学院医学研究科, 病院講師 (10726657)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2015年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードB型肝炎 / 核酸アナログ / 肝発癌 / 次世代シークエンス / ウイルス遺伝子変異 / 宿主遺伝子多型 / 肝硬変 / 肝線維化マーカー / 次世代シークエンサー / 遺伝子変異 / SNP
研究成果の概要

核酸アナログ開始後の肝発癌例の特徴を、1)臨床的要因、2)ウイルス側要因、3)宿主側要因の観点から検討した。1)臨床的要因は、肝硬変例や肝線維化マーカー(APRI)高値例で肝発癌が多いことが示された。2)ウイルス側要因は、次世代シークエンサーでHBV遺伝子変異を網羅的に解析した。全ゲノムのうち、polymerase領域のアミノ酸変異が、肝発癌に関与していることが示唆された。3)宿主側要因は、リアルタイムPCR法で宿主遺伝子多型(SNP)を網羅的に解析した。18種類のSNPのうち、HLAにおけるSNPが肝発癌に関係していることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2015

すべて 学会発表 (1件)

  • [学会発表] 肝線維化マーカーから見たエンテカビル開始後の肝発癌危険因子の検討2015

    • 著者名/発表者名
      小塚 立蔵
    • 学会等名
      日本肝臓学会西部会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2015-12-04
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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