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多発性肝臓がんの全ゲノム解析による肝臓がん進化の分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K19915
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 消化器外科学
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

古田 繭子  国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 研究員 (00647183)

研究協力者 中川 英刀  国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, チームリーダー (50361621)
藤本 明洋  国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 副チームリーダー (30525853)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2015年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
キーワード肝がん / 多発性 / 再発性 / 全ゲノムシークエンス / 肝臓がん / 多中心性腫瘍 / 転移性腫瘍 / ゲノム変異
研究成果の概要

合計23症例の多発性肝臓がん49サンプルを用いて全ゲノムシークエンスを行った。同一症例由来の複数腫瘍間での点突然変異の共通性から、多発性と再発性の症例を高精度に識別することができた。多発性と再発性の症例はステージや性質が異なるため、特に臨床病理学的に識別困難な症例についてはその有用性が示された。さらに全ゲノムシークエンスにより同時に検出可能なゲノム構造異常やコピー数異常または変異アレル頻度のプロファイリングにより、多発再発の識別に加えてより詳細に腫瘍内不均一性や、腫瘍の進化が観察された。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2017 2015 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Whole genome sequencing discriminates hepatocellular carcinoma with intrahepatic metastasis from multi-centric tumors2017

    • 著者名/発表者名
      Furuta M, Ueno M, Fujimoto A, Hayami S, Yasukawa S, Kojima F, Arihiro K, Kawakami Y, Wardell CP, Shiraishi Y, Tanaka H, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Tokunaga N, Boroevich KA, Abe T, Aikata H, Ohdan H, Gotoh K, Kubo M, Tsunoda T, Miyano S, Chayama K, Yamaue H, Nakagawa H
    • 雑誌名

      J Hepatol

      巻: 66(2) 号: 2 ページ: 363-373

    • DOI

      10.1016/j.jhep.2016.09.021

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 多発性肝臓がんの全ゲノム解析による多発性がん発生と進化の分子機構の解明2015

    • 著者名/発表者名
      古田 繭子
    • 学会等名
      日本癌学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知県・名古屋)
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Whole genome sequencing analysis of multiple liver cancer nodules for determination of causal events for multi-occurrence2015

    • 著者名/発表者名
      Mayuko Furuta
    • 学会等名
      Ametican Association for Cancer Research
    • 発表場所
      Philadelphia (USA)
    • 年月日
      2015-04-18
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [備考] 再発性と多発性肝臓がんのゲノム診断(理化学研究所)

    • URL

      http://www.riken.jp/pr/press/2016/20161124_1/

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2018-03-22  

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