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NF-kB活性の振動とスイッチライク応答における制御メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 15K21624
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生命・健康・医療情報学
システムゲノム科学
研究機関宮崎大学 (2016-2017)
国立研究開発法人理化学研究所 (2015)

研究代表者

井上 健太郎  宮崎大学, 工学部, 助教 (80708529)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードシグナル伝達 / 数理モデリング / シミュレーション / NF-kB / システム生物学 / モデリング
研究成果の概要

NF-kBは転写因子のひとつで、細胞運命決定に重要であることが知られている。NF-kB活性化の分子レベルの制御メカニズムの全容はいまだ解明されていない。私たちはNF-kB活性化に関わる分子ネットワークを数理モデルで表現し、NF-kB活性が示す振動とスイッチライク応答に焦点をあてて解析を行い、その結果を生物実験で検証した。振動とスイッチライク応答という2つの性質は、制御メカニズムがすべて同じというわけではないが、活性化に関わる分子の量や反応速度のバランスによって、補間可能であることが数値解析と理論解析で示された。また、それを生物実験でも証明した。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2018 2017 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Oscillation Dynamics Underlies Functional Switching of NF-κB for B Cell Activation.2016

    • 著者名/発表者名
      Inoue K, Shinohara H, Behar M, Yumoto N, Tanaka G, Hoffmann A, Aihara K, Okada-Hatakeyama M.
    • 雑誌名

      npj Systems Biology and Applications

      巻: 2 号: 1 ページ: 16024-16024

    • DOI

      10.1038/npjsba.2016.24

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Mathematical model and experiments for canonical NF-kB signaling2018

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara
    • 学会等名
      新学術領域「数理シグナル」 第2回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シグナル伝達系の数理モデル解析2017

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎
    • 学会等名
      JSBi九州地域部会セミナー
    • 発表場所
      海峡メッセ下関(山口県・下関市)
    • 年月日
      2017-03-10
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] シグナル伝達系の大規模数理モデルにおけるパラメタ推定法2017

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎
    • 学会等名
      情報処理学会第51回バイオ情報学研究会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] シグナル伝達系における大規模モデルのシミュレーションに向けた研究2017

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Mathematical model for NF-κB signal transduction system2016

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Gouhei Tanaka, Kazuyuki Aihara, Mariko Okada-Hatakeyama
    • 学会等名
      The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology (JSMB2016)
    • 発表場所
      九州大学(福岡県・糸島市)
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Cooperative Mechanisms in Signaling Pathway for Switch-like Nuclear Translocation of NF-κB2016

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Kazunari Iwamoto, Michio Hiroshima, Yasushi Sako, Mariko Okada-Hatakeyama
    • 学会等名
      Single Molecule Approaches to Biology Gordon Research Conference
    • 発表場所
      The Chinese University of Hong Kong (China)
    • 年月日
      2016-07-03
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 実験と数理モデルによるNF-kappaBシグナル伝達システムの解析2016

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎
    • 学会等名
      第38回BMIRC研究会
    • 発表場所
      九州工業大学(福岡県・飯塚市)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 定量的実験と数学モデルによるNF-kappaB活性化システムの統合解析2015

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子
    • 学会等名
      第38回分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Dynamic modeling for oscillatory and switch-like behavior of NF-κB activity2015

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama
    • 学会等名
      International Conference of Systems Biology (ICSB2015)
    • 発表場所
      BioPolis (Singapore)
    • 年月日
      2015-11-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamic model and experimental validation for oscillation and switch-like response of NF-κB activity2015

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会2015
    • 発表場所
      京都大学宇治キャンパス(京都府・宇治市)
    • 年月日
      2015-10-29
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] Integrated Cellular Systems Lab.

    • URL

      http://csb.rcai.riken.jp/?page_id=37

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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