ヒストン修飾新規リーダータンパク質による転写機構解析（国際共同研究強化）

• 研究課題/領域番号: 15KK0251
• 研究種目: 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 神吉 康晴 東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)
• 研究協力者: Subramaniam Sriram National Institute of Health, National Cancer Institute・Center for Cell Research・Laboratory of Cell Biology・Biophysics Section・High Resolution Electron Microscopy, Senior Director
• 研究期間 (年度): 2016 – 2017
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 15,600千円 (直接経費: 12,000千円、間接経費: 3,600千円)
• キーワード: クライオ電子顕微鏡 / ピルビン酸キナーゼ / 抗がん剤 / 単粒子解析 / 構造生物学 / 酵素 / ゲノム医科学 / エピジェネティクス

研究成果の概要

ピルビン酸キナーゼ（PK）は解糖系の最後のステップを触媒する酵素であり、糖代謝の律速酵素の一つでもある。哺乳類では4つのアイソフォームが知られているが、PKM2をノックアウトするとがん細胞の増殖は顕著に抑制される。従って、PKM2の酵素活性を決定する部位を原子レベルで解き明かし、その作用原理を明らかにすることは、様々な種類のがんに用いることが可能な抗がん剤の開発に繋がる。本研究では、ヒトPKM2及び家族性がん患者由来のPKM2 mutant (H391Y)の構造をクライオ電子顕微鏡による単粒子解析を用いてそれぞれ2.9Å、3.1Åという原子レベルの解像度で解き明かした。

研究成果

• [国際共同研究] National Institute of Health(米国) (2016)
  • 年月日: 2016-09-01
• [雑誌論文] Genome-wide analysis revealed that DZNep reduces tubulointerstitial fibrosis via down-regulation of pro-fibrotic genes. (2018)
  • 著者名/発表者名: Mimura I, Hirakawa Y, Kanki Y, Nakaki R, Suzuki Y, Tanaka T, Aburatani H, Nangaku M.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 28 号: 1 ページ: 3779-3779
  • DOI: 10.1038/s41598-018-22180-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of Cardiomyocyte-Fated Progenitors from Human-Induced Pluripotent Stem Cells Marked with CD82 (2018)
  • 著者名/発表者名: Takeda Masafumi、Kanki Yasuharu、Masumoto Hidetoshi、Funakoshi Shunsuke、Hatani Takeshi、Fukushima Hiroyuki、Izumi-Taguchi Akashi、Matsui Yusuke、Shimamura Teppei、Yoshida Yoshinori、Yamashita Jun K.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 22 号: 2 ページ: 546-556
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2017.12.057
  • NAID: 120006460050
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Novel lnc RNA regulated by HIF-1 inhibits apoptotic cell death in the renal tubular epithelial cells under hypoxia. (2017)
  • 著者名/発表者名: Mimura I, Hirakawa Y, Kanki Y, Kushida N, Nakaki R, Suzuki Y, Tanaka T, Aburatani H, Nangaku M.
  • 雑誌名: Physiol Rep. 巻: 5 号: 8 ページ: e13203-e13203
  • DOI: 10.14814/phy2.13203
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dynamically and epigenetically coordinated GATA/ETS/SOX transcription is indispensable for endothelial cell differentiation (2017)
  • 著者名/発表者名: Kanki Y, Nakaki R, Shimamura T, Matsunaga T, Yamamizu K, Katayama S, Suehiro JI, Osawa T, Aburatani H, Kodama T, Wada Y, Yamashita JK, Minami T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 印刷中 号: 8 ページ: 4344-4358
  • DOI: 10.1093/nar/gkx159
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [学会発表] ヒストン修飾酵素による動脈硬化関連遺伝子発現制御解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴
  • 学会等名: 第4回血管生物若手研究会
• [学会発表] Single particle analysis by cryo-electron microscopy (2017)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki, Sagar Chittori, Doreen Matthies, Prashant Rao, Alan A. Merk, Sriram Subramaniam
  • 学会等名: ConBio2017
  • 招待講演
• [学会発表] microRNA-histone modification network in TNFa-stimulated inflammatory endothelium (2017)
  • 著者名/発表者名: 東島佳毅、神吉康晴、井上剛、南学正臣、古川哲史、和田洋一郎
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] Lysine Demethylase 6A and 7A REgulated by MicroRNA-3679-5p Mediates TNFa-induced Inflammatory Signaling in Vascular Endotehlium (2017)
  • 著者名/発表者名: Yoshiki HIGASHIJIMA, Tsuyoshi INOUE, Masaomi NANGAKU, Youichiro WADA, Tetsushi FURUKAWA, Yasuharu KANKI
  • 学会等名: American Heart Association 2017
  • 国際学会
• [図書] 実験医学2017年8月号 (2017)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: 羊土社
• [備考] 血管分化を導く遺伝プログラムの一部を解明 ―血管分化におけるヒストンと転写のはたらきを同定―
  • URL: http://www.ric.u-tokyo.ac.jp/res/res20170328.htm