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慢性的低酸素環境において遺伝子発現を決定する選択的転写機構の解明(国際共同研究強化)

研究課題

研究課題/領域番号 15KK0298
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化)

配分区分基金
研究分野 医化学一般
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

中山 恒  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (10451923)

研究協力者 Misteli Tom  国立がん研究所, NIH Distinguished Investigator
研究期間 (年度) 2016 – 2017
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
14,300千円 (直接経費: 11,000千円、間接経費: 3,300千円)
キーワード低酸素応答 / 遺伝子発現 / 転写 / 染色体構造 / CREB / 遺伝子配置 / 転写因子
研究成果の概要

低酸素応答の急性期と慢性期に働く遺伝子の発現を制御する分子機序を、それらの核内のポジションに着目して解析した。急性期と慢性期の低酸素応答で発現が誘導される遺伝子約200個を、HIFの標的遺伝子、および、CREBの標的遺伝子の中から選抜して、その核内ポジションを、共同研究者が開発したHIPMap法を用いて決定した。その結果、低酸素下で発現変動する複数の遺伝子が、核内ポジションを変化させていることが明らかになった。このことから、低酸素環境は、遺伝子の核内での位置も変化させることで、ダイナミックな遺伝子発現を調節していることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 2件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] アメリカ国立衛生研究所(米国)2017

    • 年月日
      2017-04-08
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] SpotLearn: Convolutional Neural Network for Detection of Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) Signals in High-Throughput Imaging Approaches.2018

    • 著者名/発表者名
      Gudla PR., Nakayama K., Pegoraro G., Misteli T.
    • 雑誌名

      Cold Spring Harb Symp Quant Biol.

      巻: - ページ: 57-70

    • DOI

      10.1101/sqb.2017.82.033761

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] HIFプロリン水酸化酵素Phd3が形成するタンパク質複合体を介した細胞内エネルギー代謝機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      中山 恒
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 低酸素環境における解糖系に依存したエネルギー代謝を制御する新たな分子機構の解析2016

    • 著者名/発表者名
      中山 恒
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 東京医科歯科大学 低酸素生物学HP

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/section/advanced/oxy/labo/index.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 東京医科歯科大学 低酸素生物学研究室HP

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/section/advanced/oxy/labo/index.html

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-10-04   更新日: 2019-03-29  

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