核内染色体テリトリーの自己組織化と染色体ゲノム進化

• 研究課題/領域番号: 15KT0149
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 特設分野
• 研究分野: 構成的システム生物学
• 研究機関: 総合研究大学院大学
• 研究代表者: 田辺 秀之 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
• 研究期間 (年度): 2015-07-10 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2015年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 染色体テリトリー / 染色体 / FISH法 / 3D-FISH法 / 核内配置 / テナガザル科 / 自己組織化 / 核型進化 / 転座切断点 / 霊長類

研究成果の概要

細胞核内の「染色体テリトリー」がどのような仕組みで核内空間に配置されているのか、テナガザル科における核型高速進化の現象に着目し、進化的転座切断部位（ECBs）の放射状核内配置を3D-FISH法により解析し、検討を行った。ECBsが核内空間にランダムで一様に分布する場合は、自己組織化・ランダム分布モデル、特定の放射状ゾーンで顕著に転座が生じている場合は、制御因子誘導モデルと呼ぶことができるが、実験結果より、前者の「自己組織化・ランダム分布モデル」が適用されるものと考えられた。RバンドとＧバンド領域の放射状分布がわずかに異なること、反復配列のシグナル強度が核中心付近で増強している傾向が見出された。

研究成果

• [国際共同研究] University of Florence(Italy)
• [国際共同研究] Ludwig Maximilians University, Munich(Germany)
• [国際共同研究] Ludwig Maximilians University, Munich(Germany)
• [雑誌論文] 特集 核内イベントの時空間制御 Ⅳ.イメージング解析 3D-FISH法の新たな展開─マウス初期胚への応用 (2017)
  • 著者名/発表者名: 田辺秀之、中家雅隆、三谷 匡
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 68 号: 3 ページ: 237-242
  • DOI: 10.11477/mf.2425200619
  • ISSN: 0370-9531, 1883-5503
  • 年月日: 2017-06-15
• [雑誌論文] Co-Opted Megasatellite DNA Drives Evolution of Secondary Night Vision in Azara’s OwlMonkey (2017)
  • 著者名/発表者名: 1)Koga A, Tanabe H, Hirai Y, Imai H, Imamura M, Oishi T, Stanyon R, Hirai H
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 9 号: 7 ページ: 1963-1970
  • DOI: 10.1093/gbe/evx142
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Visualization of the spatial arrangement of nuclear organization using three-dimensional fluorescence <i>in situ</i> hybridization in early mouse embryos: A new “EASI-FISH chamber glass” for mammalian embryos (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakaya M, Tanabe H, Takamatsu S, Hosokawa M, Mitani T
  • 雑誌名: Journal of Reproduction and Development 巻: 63 号: 2 ページ: 167-174
  • DOI: 10.1262/jrd.2016-172
  • NAID: 130007314628
  • ISSN: 0916-8818, 1348-4400
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A Pair of Maternal Chromosomes Derived from Meiotic Nondisjunction in Trisomy 21 Affects Nuclear Architecture and Transcriptional Regulation (2017)
  • 著者名/発表者名: Sayaka Omori, Hideyuki Tanabe, Kimihiko Banno, Ayumi Tsuji, Nobutoshi Nawa, Katsuya Hirata, Keiji Kawatani, Chikara Kokubu, Junji Takeda, Hidetoshi Taniguchi, Hitomi Arahori, Kazuko Wada, Yasuji Kitabatake1, and Keiichi Ozono
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 号: 1 ページ: 764-764
  • DOI: 10.1038/s41598-017-00714-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 核内ゲノム空間配置からみたテナガザルにおける核型高速進化 (2017)
  • 著者名/発表者名: 田辺秀之
  • 学会等名: 第34回 染色体ワークショップ・第15回 核ダイナミクス研究会合同開催
  • 発表場所: かずさDNA研究所、オークラアカデミアパークホテル
  • 年月日: 2017-01-11
• [学会発表] EVOLUTIONARY CONSIDERATION FOR THE RADIAL DISTRIBUTION OF CHROMOSOME TERRITORIES IN HUMAN AND GIBBON CELL NUCLEI (2017)
  • 著者名/発表者名: Hideyuki Tanabe
  • 学会等名: 4D Nucleome: Cell Nucleus in Space and Time 2017
  • 国際学会
• [学会発表] A NEW “EASI-FISH CHAMBER GLASS” FOR USE BY 3D-FISH TECHNIQUE: VISUALIZATION OF NUCLEAR SPATIAL ORGANIZATION IN EARLY MOUSE EMBRYOS (2017)
  • 著者名/発表者名: Masataka Nakaya, Hideyuki Tanabe, Shingo Takamatsu, Misaki Hosokawa, Tasuku Mitani
  • 学会等名: 4D Nucleome: Cell Nucleus in Space and Time 2017
  • 国際学会
• [学会発表] 染色体テリトリー・クロマチン・DNA構造の細胞核内における空間配置の特性について (2017)
  • 著者名/発表者名: 田辺秀之
  • 学会等名: 第40回 日本分子生物学会年会
• [学会発表] 染色体テリトリー・ゲノム空間配置からみたテナガザルにおける核型高速進化について (2016)
  • 著者名/発表者名: 田辺秀之
  • 学会等名: 第67回 染色体学会年会
  • 発表場所: 東京大学農学部、一条ホール
  • 年月日: 2016-11-03
• [学会発表] Spatial organization of chromosome territories and repetitive DNA sequences in human and gibbon cell nuclei (2016)
  • 著者名/発表者名: Hideyuki Tanabe
  • 学会等名: QBiC Symposium 2016 "Decoding Organisms by Quantitative Cell Profiling"
  • 発表場所: Senri Life Science Center, Osaka
  • 年月日: 2016-09-05
  • 国際学会
• [学会発表] ヒトおよびテナガザルにおける染色体テリトリー・反復配列DNAの細胞核内空間配置について：進化的視点よりの考察 (2016)
  • 著者名/発表者名: 田辺秀之
  • 学会等名: 第68回 日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 京都テルサ、京都
  • 年月日: 2016-06-15
• [学会発表] Global radial distribution of chromosome territories and its characteristics in relation to nuclear architecture (2016)
  • 著者名/発表者名: Hideyuki Tanabe
  • 学会等名: BIT’s 6th Annual World Congress of Molecular and Cell Biology 2016
  • 発表場所: Dalian International Conference Center, Dalian, China
  • 年月日: 2016-04-25
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Global distribution of chromosome territories and nuclear architecture (2015)
  • 著者名/発表者名: Hideyuki Tanabe
  • 学会等名: Invited Lecture for RcMcD
  • 発表場所: RcMcD, Hiroshima University
  • 年月日: 2015-07-17
  • 招待講演
• [備考] 田辺 秀之 准教授 分子細胞遺伝学・染色体ゲノム進化学
  • URL: http://www.esb.soken.ac.jp/research/index.html#hideyuki_tanabe
• [備考] 田辺秀之 研究内容
  • URL: http://www.esb.soken.ac.jp/research/index.html#hideyuki_tanabe