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シロイヌナズナ完全長cDNA高発現システムを用いた植物機能遺伝子の統合的解析

研究課題

研究課題/領域番号 16011264
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

松井 南  独立行政法人理化学研究所, 植物変異探索研究チーム, チームリーダー (80190396)

研究分担者 市川 尚斉  独立行政法人理化学研究所, 植物変異探索研究チーム, 研究員 (30221766)
黒田 浩文  独立行政法人理化学研究所, 植物変異探索研究チーム, 研究員 (00332297)
研究期間 (年度) 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,900千円)
2004年度: 3,900千円 (直接経費: 3,900千円)
キーワードシロイヌナズナ / 完全長cDNA / 形質転換植物 / F-BOXタンパク質 / 細胞内局在 / Comuter Tomograhy
研究概要

1.独立したシロイヌナズナ完全長cDNAクローン約10,000クローンを植物発現ベクターに挿入したシロイヌナズナ完全長cDNA発現ライブラリーを作成した。このライブラリーをアグロバクテリアによりシロイヌナズナ個体に導入して、個々に完全長cDNAが高発現する形質転換ライン(シロイヌナズナFOXライン)を約10,000系統作成した。約50のラインを無作為に抽出して挿入されたcDNAの個数と長さについて調べた。平均して1.5コピーのcDNAが導入されており、導入に用いたライブラリーのcDNAの分布との比較からcDNAの長さによる挿入効率の差は、ほとんどないことが分かった。これらのライン作成中に種々の形態観察を行い、形態に関しての変異情報と変異の原因となる導入したcDNAの情報をデータベースに登録した。作成したシロイヌナズナFOXラインについて、紫外線耐性、光形態形成について選抜を行なった。
2.10,000系統のFOXラインの植物種子についての形状を詳細に観察するために、レーザーレンジファインダーの代わりにμCTによる形状の計測を行った。
3.約600あるうちの500種類のシロイヌナズナF-BOXタンパク質についてRT-PCR法によって全コーディング領域を増幅し、ゲートウェイのEntryベクターへ挿入を完了した。予備的に10種類のF-BOXタンパク質についてGFPと結合して、パーティクルガンによりシロイヌナズナの胚軸に導入して細胞内局在を観察した。細胞質、核等の局在について観察することで、局在によるタンパク質の分類ができることを確かめた。局在の安定した情報を得るために500種類について個々のF-BOX::GFP融合遺伝子の作成を行った。

報告書

(1件)
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2005 2004

すべて 雑誌論文 (2件)

  • [雑誌論文] shk1-D, a dwarf Arabidopsis mutant caused by activation of the CYP72CJ gene, has altered brassinosteroid levels.2005

    • 著者名/発表者名
      高橋直紀, 中澤美紀, 柴田京美, 横田孝雄, 石川明苗, 鈴木久美子, 川島美香, 他3名
    • 雑誌名

      Plant Journal (印刷中)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Automatic Quantification of Morphological Traits via 3-Dimensional Measurement of Arabidopsis2004

    • 著者名/発表者名
      神沼絵理, 平田直彦, 津本裕子, 山本直樹, 後藤伸治, 岡本直紀, 他3名
    • 雑誌名

      Plant Journal 38

      ページ: 358-365

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2018-03-28  

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