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枯草菌と大腸菌におけるトランス・トランスレーションの標的タンパク質の解析

研究課題

研究課題/領域番号 16013201
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関弘前大学

研究代表者

姫野 俵太  弘前大学, 農学生命科学部, 助教授 (80208785)

研究分担者 武藤 あきら  弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (80034635)
研究期間 (年度) 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
5,800千円 (直接経費: 5,800千円)
2004年度: 5,800千円 (直接経費: 5,800千円)
キーワードトランストランスレーション / tmRNA / TreP / CcpA / Cre配列 / PerR / MetE / YfiA
研究概要

トランストランスレーションは、翻訳が中断したmRNAからtmRNAへとリボソームが翻訳を切替えることで二つの分断された情報から一本のキメラペプチドを作り出す、変則的翻訳である。本研究ではまず、トランストランスレーション産物を特異的に検出、単離するシステムを開発した。この方法を用いてまず、枯草菌のtmRNAが仲介するトランストランスレーションの標的タンパク質が通常の温度(37℃)と高温(50℃)では大きく異なること、また全体として高温のときほど、トランストランスレーションが盛んに起こっていることを明らかにした。次にN末端アミノ酸配列分析により、それぞれの温度における標的タンパク質のうちのいくつかを同定した。それらの中にはストレス応答遺伝子産物(PerR)、カタボライト抑制を受ける遺伝子産物(TreP)など興味深いものが含まれていた。TrePのトランストランスレーション産物は、プロテアーゼで消化した後、MALDI TOF MASを用いてアミノ酸配列を解析し、TrePからタグペプチドへの切り替え位置を調べた。その結果、切り替えはTrePの内部に存在するCre配列(カタボライト抑制に関わるリプレッサータンパク質CcpAの認識配列)のすぐ上流から起こっていることが明らかになった。CcpAの欠損株を作成したところ、そこではTrePのトランストランスレーション産物も消失していた。CcpA欠損株においては、TreP以外のトランストランスレーション産物の多くが消失していた。以上のように、トランストランスレーション反応がCcpAを介したカタボライト抑制全般に関与する可能性が示唆された。現在、並行してPerRのトランストランスレーション産物の解析を行っているところである。
一方、大腸菌のトランストランスレーションの標的タンパク質についてもそのいくつかを明らかにすることができた。その中で、現在MetEおよびYfiAについてトランストランスレーション反応産物の詳しい解析を行っているところである。MetEに関しては、coding領域の途中数カ所において、YfiAに関してはC末端ごく近傍において、トランストランスレーションが起こっているというデータを得ている。

報告書

(1件)
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2004

すべて 雑誌論文 (4件)

  • [雑誌論文] 翻訳と共役した蛋白質品質管理システム:トランストランスレーション2004

    • 著者名/発表者名
      姫野俵太, 武藤 あきら
    • 雑誌名

      細胞における蛋白質の一生(蛋白質核酸酵素増刊) 49(7)

      ページ: 1062-1066

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A minimum structure of aminoglycosides that causes an initiation shift of trans-translation.2004

    • 著者名/発表者名
      Konno, T., Takahashi, T., Kurita, D., Muto, A., Himeno, H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 32

      ページ: 4119-4126

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A novel GTPase activated by the small subunit of ribosome.2004

    • 著者名/発表者名
      Himeno, H., Hanawa-Suetsugu, K., Kimura, T., Takagi, K., Sugiyama, W., Shirata, S., Mikami, T., Odagiri, F., Osanai, Y., Watanabe, D., Goto, S., Kalachnyuk, L., Ushida, C., Muto, A.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 32

      ページ: 5303-5309

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Initiation shift of trans-translation by aminoglycosides.2004

    • 著者名/発表者名
      Konno, T., Kurita, D., Takahashi, T., Muto, A., Himeno, H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp.Ser. 48

      ページ: 299-300

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2018-03-28  

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