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T4ファージの粒子形成に関わる分子間相互作用の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16041213
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東京工業大学

研究代表者

有坂 文雄  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80133768)

研究分担者 金丸 周司  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (50376951)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2005年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2004年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
キーワードバクテリオファージ / 分子集合 / 超遠心分析 / ウイルス / 分子間相互作用 / リゾチーム / テイルリゾチーム / 収縮姓尾部 / 感染機構 / X線結晶構造解析
研究概要

本研究は、蛋白質複合体のモデル系としてバクテリオファージに注目し、分子集合の過程における水溶液中の分子間相互作用を明らかにしようとするものである。本年度は特に基盤蛋白質gp13,gp14,gp16,gp17,gp48,gp54に焦点を合わせて実験を行い、以下の結果を得た。
1.gp13及びgp14の単離・精製と性状解析
gp13とgp14はネックを構成する蛋白質で頭部形成の最終段階で結合し、尻尾との結合部に存在すると考えられる。両蛋白質は超遠心分析の結果、単独では単量体として存在すること、また両者を混合するとgp13:gp14=1:2の比率で結合することが分かった。
2.DNAパッケージング蛋白質gp16とgp17の単離・精製と性状解析
2本鎖DNAファージには共通して大小2種のパッケージング蛋白質が必要である。T4ファージでは大サブユニットがgp17、小サブユニットがgp16で、後者にはATPaseはないが、前者のATPaseを50倍以上促進する。両蛋白質を単離精製し、超遠心分析を行ったところ、gp17が単量体であるのに対して、gp16は20量体と思われる分子種が主要成分で、少量の10量体と思われる分子種と平衡にあることが分かった。一方、gp16とgp17の間には弱い相互作用しか見られなかった。
3.基盤形成の最終ステップに結合するgp48とgp54の単離・精製と性状解析
gp48とgp54は基盤形成の最終段階で結合する蛋白質で、gp54は尾管イニシエーターを呼ばれる。両蛋白質遺伝子をクローニングし、単離精製することを試みたが、良く発現はするものの、不溶性画分に入り、発現温度、IPTG濃度など発現条件を検討したほか、コールドショックプロモーターを試みたが、可溶性画分として精製することができなかった。しかし、gp48については発現温度22℃、15時間で半分以上を可溶性画分に回収することができた。現在、結晶化の準備を進めている。

報告書

(2件)
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2005 2004

すべて 雑誌論文 (10件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Control of Bacteriophage T4 Tail Lysozyme Activity During the Infection Process2005

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kanamaru
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 346

      ページ: 1013-1020

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The tail structure of bacteriophage T4 and its mechanism of contraction2005

    • 著者名/発表者名
      Victor A.Kostychenko
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol. 12

      ページ: 810-813

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Stalk region of kinesin-related protein Unc104 has moderate ability to form coiled-coil dimer2005

    • 著者名/発表者名
      Youske Shimizu
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Rres.Comm. 337

      ページ: 868-874

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Assembly and Infection Process of Bacteriophage T42005

    • 著者名/発表者名
      Fumio Arisaka
    • 雑誌名

      Chaos 15

      ページ: 47502-47502

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Single step purification, characterization and N-terminal sequences of a mannose specific lectin from mulberry seeds2005

    • 著者名/発表者名
      Nurul Absar
    • 雑誌名

      Protein J. 24(6)

      ページ: 367-377

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] バクテリオファージの構造と感染機構2005

    • 著者名/発表者名
      金丸周司
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1341-1348

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Control of bacteriophage T4 tail lysozyme activity during the infection process2005

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kanamaru
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. (in press)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Structure and implications for the thermal stability of phosphopantetheine adenylyltransferase from Thermus thermophilus2004

    • 著者名/発表者名
      Hitomi Takahashi
    • 雑誌名

      Acta Ciyst. D60

      ページ: 97-104

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] The bacteriophage T4 DNA injection machine2004

    • 著者名/発表者名
      Michael G.Rossmann
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology 14

      ページ: 171-180

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Mapping of functional sites on the primary structure of the contractile tail sheath protein of bacteriophage T4 by mutation analysis2004

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Takeda
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta 1699(1-2)

      ページ: 163-171

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] タンパク質科学2005

    • 著者名/発表者名
      有坂文雄(共著)
    • 総ページ数
      579
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] バイオサイエンスのための「蛋白質科学入門」2004

    • 著者名/発表者名
      有坂 文雄
    • 総ページ数
      265
    • 出版者
      裳華房
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2018-03-28  

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