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ハイナン/ルソンメダカ種間雑種をもちいた遺伝子地図作成による比較ゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 16310131
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 基礎ゲノム科学
研究機関東京大学

研究代表者

成瀬 清  東京大学, 大学院・理学系研究科, 講師 (50208089)

研究分担者 酒泉 満  新潟大学, 理学部, 教授 (40175360)
研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
15,600千円 (直接経費: 15,600千円)
2006年度: 4,900千円 (直接経費: 4,900千円)
2005年度: 4,800千円 (直接経費: 4,800千円)
2004年度: 5,900千円 (直接経費: 5,900千円)
キーワードメダカ / ルソンメダカ / インドメダカ / ハブスメダカ / ジャワメダカ / タイメダカ / シンテニー / 比較ゲノム / ゲノムライブラリー / メコンメダカ / ハブシメダカ / フォスミドライブラリー
研究概要

メダカ及びその近縁種をもちいた比較マッピングによって、現在までにメダカ、ハイナンメダカ、ルソンメダカ、メコンメダカ、ジャワメダカ、ハブスメダカ、インドメダカ、タイメダカの性染色体と性決定様式が明らかとなった。
メダカとハイナンメダカは連鎖群1(LG1)が性染色体であり、XX-XY型の性決定様式を持つ。ルソンメダカの性染色体はメダカのLG12と相同であり、その性決定機構はXX-XY型であった。メコンメダカではその性染色体はメダカのLG2と相同であり、その性決定機構はXX-XY型であった。ジャワメダカの性染色体はメダカのLG16に相同であるが、性決定の機構はZZ-ZW型を示した。ハブスメダカの性染色体はメダカのLG5に相同であり、その性決定機構はZZ-ZW型であった。インドメダカではメダカのLG10に相当する染色体が性を決定すると共に、その性決定機構はXX-XY型であった。これらの種の系統関係はメダカ ハイナンメダカ ルソンメダカ メコンメダカが単系統(両腕型染色体グループ)を示す。またジャワメダカ ハブスメダカ インドメダカ及びタイメダカも単系統(単腕型染色体グループ)を示す。インドメダカを除き単腕型染色体グループの種はZZ-ZW型性決定様式をとることや、その姉妹群である両腕型染色体グループの種では、現在知られているすべての種がXX-XY型の性決定機構をもつことを考えると、すくなくとも単腕型と両腕型染色体グループの共通祖先はXX-XY型の性決定機構を持ち、2っのグループが分岐した後、単腕型の中でジャワ-ハブスメダカの系統においてZZ-ZW型の性決定機構を持つ系統が現れ、現在に至るのではないかというシナリオがみえてきた。ハブスメダカ性連鎖マーカーをもちいてフォスミドライブラリーをスクリーニングし、ハブスメダカ性染色体をFISH法で同定したところZ染色体とW染色体は異形性を示すことが明らかとなった。これはメダカ属では初の報告である。グローバルなシンテニーに関してはメダカ属では染色体レベルで良く保たれていた。

報告書

(4件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2007 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (24件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Evolution of Different Y chromosomes in Two medaka species Oryzias dancena and O. latipes2007

    • 著者名/発表者名
      Takehana, Y., Demiyah D., Naruse.K., Hamaguchi, S., Sakaizumi.M.
    • 雑誌名

      Genetics 175

      ページ: 1335-1340

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolution of different Y chromosomes in two medaka species Oryzias dancena and O. latipes2007

    • 著者名/発表者名
      Takehana, Y., Demiyah D., Naruse, K., Hamaguchi, S., Sakaizumi, M.
    • 雑誌名

      Genetics 175

      ページ: 1335-1340

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolutionary history of the calcitonin gene-related peptide family in vertebrates revealed by comparative genomic analyses2006

    • 著者名/発表者名
      Ogoshi, M., Inoue, K., Naruse.K., Takei Y
    • 雑誌名

      Peptide 27(12)

      ページ: 3154-3164

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolution of teleostean hatching enzyme genes and their paralogous genes.2006

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi M, Yasumasu S, Hiroi J, Naruse K, Inoue M, luchi I
    • 雑誌名

      Dev Genes Evol. 216(12)

      ページ: 769-784

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Forebrain gonadotropin-releasing hormone neuronal development : insights from transgenic medaka and the relevance to X-linked Kallmann syndrome.2006

    • 著者名/発表者名
      Okubo K, Sakai F, Lau EL, Yoshizaki G, Takeuchi Y, Naruse K, Aida K, Nagahama Y
    • 雑誌名

      Endocrinology. 147(3)

      ページ: 1076-1084

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolutionary history of the calcitonin gene-related peptide family in vertebrates revealed by comparative genomic analyses2006

    • 著者名/発表者名
      Ogoshi, M., Inoue, K., Naruse, K., Takei Y.
    • 雑誌名

      Peptide 27(12)

      ページ: 3154-3164

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolution of teleostean hatching enzyme genes and their paralogous genes.2006

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi M, Yasumasu S, Hiroi J, Naruse K, Inoue M, Iuchi I.
    • 雑誌名

      Dev Genes Evol 216(12)

      ページ: 769-784

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Forebrain gonadotropin-releasing hormone neuronal development : insights from transgenic medaka and the relevance to X-linked Kallmann syndrome.2006

    • 著者名/発表者名
      Okubo K, Sakai F, Lau EL, Yoshizaki G, Takeuchi Y, Naruse K, Aida K, Nagahama Y.
    • 雑誌名

      Endocrinology 147(3)

      ページ: 1076-1084

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Evolutionary history of the calcitonin gene-related peptide family in vertebrates revealed by comparative genomic analyses2006

    • 著者名/発表者名
      Ogosni, M., Inue, K., Naruse, K., Takei Y
    • 雑誌名

      Peptide 27(12)

      ページ: 3154-64

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Evolution of teleostean hatching enzyme genes and their paralogous genes.2006

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi M, Yasumasu S, Hori J, Naruse K, Inoue M, Iuchi I.
    • 雑誌名

      Dev Genes Evol. 216(12):

      ページ: 769-84

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Forebrain gonadotropin-releasing hormone neuronal development : insights from transgenic medaka and the relevance to X-linked Kallmann syndrome.2006

    • 著者名/発表者名
      Okubo K., Sakai F, Lau EL, Yoshizaki G, Takeuchi Y, Naruse K, Aida K, Nagahama Y
    • 雑誌名

      Endocrinology. 1076-84.2006. 147(3):

      ページ: 1076-84

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Medaka draft genome : toward an understanding of vertebrate development and evolution2005

    • 著者名/発表者名
      Naruse K., Takeda H.
    • 雑誌名

      蛋白質 核酸 酵素 50

      ページ: 2160-2166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 小型魚類の比較ゲノム2005

    • 著者名/発表者名
      堀 寛, 高松尚文, 武田洋幸, 成瀬 清
    • 雑誌名

      細胞工学 20 (11)

      ページ: 1219-1225

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Medaka draft genome : toward an understanding of vertebrate development and evolution2005

    • 著者名/発表者名
      Naruse K., Takeda H.
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu kakusan koso 50

      ページ: 2160-2166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative genomics of teleostian fishes2005

    • 著者名/発表者名
      Hori H., Takamatsu N., Takeda, H.Naruse, K.
    • 雑誌名

      Saiboukougaku 20(11)

      ページ: 1219-1225

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Medaka draft genome : toward an understanding of vertebrate development and evolution2005

    • 著者名/発表者名
      Naruse K., Takeda H.
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu Kakusan Koso 50

      ページ: 2160-2166

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 小型魚類の比較ゲノム2005

    • 著者名/発表者名
      堀, 高松, 武田, 成瀬
    • 雑誌名

      細胞工学 20(11)

      ページ: 1219-1225

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A novel membrane guanylyl cyclase expressed in medaka (Oryzias latipes) intestine.2005

    • 著者名/発表者名
      Iio K, Nakauchi M, Yamagami S, Tsutsumi M, Hori H, Naruse K, Mitani H, Shima A, Suzuki N.
    • 雑誌名

      Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 140(4)

      ページ: 569-578

    • NAID

      120000956741

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A Medaka Gene Map : The Trace of Ancestral vertebrate Proto-Chromosomes Revealed y Comparative Gene Mapping2004

    • 著者名/発表者名
      Naruse K., et al.
    • 雑誌名

      Genome Research 14

      ページ: 820-828

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Medaka genomics : a bridge between mutant phenotype and gene function2004

    • 著者名/発表者名
      Naruse K, et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 619-628

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Large-scale isolation of ESTs from medaka embryo and its application to medaka developmental genetics2004

    • 著者名/発表者名
      Kimura T.et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 915-932

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A first generation physical map of the medaka genome in BACs essential for positional cloning and clone-by-clone based genomic sequence2004

    • 著者名/発表者名
      Zadeh Khorasani M et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 903-914

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A mutation in the gene for aminolevulinic acid dehydrase (ALAD) causes hypochromic anemia in the medaka, Oryzias latipes2004

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto D.et al.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 121

      ページ: 747-752

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Repid chromosomal assignment of medaka mutant by bulkde segregation analysis2004

    • 著者名/発表者名
      Mertinez-Morales, J et. a.
    • 雑誌名

      Gene 329

      ページ: 159-165

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] Medaka genome mapping for functional genomics in "Fish Development and Genetics"(Gong Zhiyuan and Vladimir Korzh ed)2004

    • 著者名/発表者名
      Mitani H.et al.
    • 総ページ数
      637
    • 出版者
      World Scientific Co.Pte.Ltd Singapore
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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