寄生原虫の全長cDNAライブラリを用いた遺伝子発現制御機構の比較生物学的研究

• 研究課題/領域番号: 16310132
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 渡邊 純一 (渡辺 純一) 東京大学, 医科学研究所, 助手 (20201189)
• 研究分担者: 鈴木 穣 東京大学, 新領域創成科学研究科, 助教授 (40323646) ; 山下 理宇 東京大学, 医科学研究所, 特任所手 (10401259) ; 杉本 千尋 北海道大学, 人獣共通感染症リサー, 教授 (90231373)
• 研究期間 (年度): 2004 – 2006
• 研究課題ステータス: 完了 (2006年度)
• 配分額: 15,600千円 (直接経費: 15,600千円); 2006年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円); 2005年度: 6,100千円 (直接経費: 6,100千円); 2004年度: 6,500千円 (直接経費: 6,500千円)
• キーワード: 寄生原虫 / マラリア / トキソプラズマ / 比較ゲノム / 発現遺伝子 / 発現制御 / 全長cDNA / 遺伝子発現制御 / 全長cDNAライブラリ / マラリア原虫 / トキソプラズマ原虫

研究概要

もっとも単純な真核生物である寄生原虫は、医学的重要性のために英米でゲノム解読が早くから進められている。我々は、発現遺伝子の制御機構を解明する目的で、独自に開発したoligo-cap法を利用して、種々の寄生原虫から全長cDNAライブラリを作成し、トランスクリプトームの解析を行った。三日熱マラリア原虫(Plasmodium vivax)、ネズミマラリア原虫(P. berghei)、トキソプラズマ原虫(Toxoplasmagondii),クリプトスポリジウム原虫(Cryptosporidium parvum)、タイレリア原虫(Theileria parva、T. orientalis)、アイメリア原虫(Eimeria tenella)から全長cDNAライブラリを作成し、多数クローンの5'端ワンパスシークエンスを決定した。これらを、ゲノムシークエンスにマップして、ゲノムブラウザーを作成した。また、比較ゲノム解析の目的で、エキノコックス条虫(Echinococcus multilocularis)からも全長cDNAライブラリを作成した。これらの成果は、データベース(Full-Malaria)化し、インターネットで公開した(http://fullmal.ims.u-tokyo.ac.jp)。さらに、比較生物学的研究に利用するため比較ゲノムデータベースComparasite(http://comparasite.hgc.jp/)を作成公開した。これらは、寄生原虫の遣伝子発現制御機構解析のための基礎データとなるものである。また、ネズミマラリア原虫の全長cDNAライブラリを利用した新規マラリアDNAワクチンのスクリーニング法を用いて実験を行ない、有望な結果を得て報告した。本法は、真核病原体一般に応用可能と考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] Comparasite:a database for comparative study of transcriptomes ofparasites defined by full-length cDNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: Junichi Watanabe
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 35
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparasite : a database for comparative study of transcriptomes of parasites defined by full-length cDNAs (2007)
  • 著者名/発表者名: Junichi Watanabe
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 35
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Malaria Research Trends (2007)
  • 著者名/発表者名: Josef Tuda
  • 雑誌名: Nova Publishers ページ: 1-2
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comparasite : a database for comparative study of transcriptomes of parasties defined by full-length cDNAs. (2007)
  • 著者名/発表者名: Junichi Watanabe, Hiroyuki Wakaguri, Masahide Sasaki, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 35(Database issue)
• [雑誌論文] Common inheritance of chromosome Ia associated with clonal expansion of Toxoplasma gondii (2006)
  • 著者名/発表者名: Khan A
  • 雑誌名: Genome Res. 16(9) ページ: 1119-1125
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Common inheritance of chromosome Ia associated with clonal expansion of Toxoplasma gondii. (2006)
  • 著者名/発表者名: Khan A, Bohme U, Kelly KA, Adlem E, Brooks K, Simmonds M, Mungall K, Quail MA, Arrowsith C, Chillingworth T, Churcher C, Harris D, Collins M, Fosker N, Fraser A, Hance Z, Jagels K, Moule S, Murphy L, O'Nel S, Rajandream MA, Saunders D, Seeger K, Whitehead S, Mayr T, Xuan X, Watanabe J, Suzuki Y, Wakaguri H, Mackey AJ, Roos DS, Hall N, Berriman M, Barrell B, Sibley LD, Ajioka JW.
  • 雑誌名: Genome Res. 16(9) ページ: 1119-25
• [雑誌論文] A novel method for development of malaria vaccines using full-length cDNA Iibraries (2005)
  • 著者名/発表者名: Akiko Shibui
  • 雑誌名: Vaccine 23 ページ: 4359-4366
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel method for development of malaria vaccines using full-length cDNA libraries (2005)
  • 著者名/発表者名: Akiko Shibui
  • 雑誌名: Vaccine 23 ページ: 4359-4366
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A novel method for development of malaria vaccines using full-length cDNA libraries (2005)
  • 著者名/発表者名: Akiko Shibui, Takashi Shiibashi, Sadao Nogami, Sumio Sugano, Junichi Watanabe
  • 雑誌名: Vaccine 23 ページ: 4359-4366
• [雑誌論文] Cloning and characterization of cDNA encoding a prohibitin-like protein from Theileria orientalis. (2005)
  • 著者名/発表者名: He W, Ohashi K, Sugimoto C, Tsuji M, Onuma M.
  • 雑誌名: Jpn J Vet Res. 53 ページ: 27-35
  • NAID: 110004665692
• [雑誌論文] Theileria orientalis : cloning a cDNA encoding a protein similar to thiol protease with haemoglobin-binding activity. (2005)
  • 著者名/発表者名: He W, Ohashi K, Sugimoto C, Onuma M.
  • 雑誌名: Exp Parasitol. 111 ページ: 143-153
• [雑誌論文] Evaluation of loop-mediated isothermal amplification (LAMP), PCR and parasitological tests for detection of Trypanosoma evansi in experimentally infected pigs. (2005)
  • 著者名/発表者名: Thekisoe OM, Inoue N, Kuboki N, Tuntasuvan D, Bunnoy W, Borisutsuwan S, Igarashi I, Sugimoto C
  • 雑誌名: Vet Parasitol. 130 ページ: 327-330
• [雑誌論文] Detection of antibodies to Neospora caninum in cattle by enzyme-linked immunosorbent assay with truncated NcSRS2 expressed in Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Gaturaga I, Chahan B, Xuan X, Huang X, Liao M, Fukumoto S, Hirata H, Nishikawa Y, Takashima Y, Suzuki H, Fujisaki K, Sugimoto C.
  • 雑誌名: J Parasitol. 91 ページ: 191-192
• [雑誌論文] Expression of a gene encoding Trypanosoma congolense putative Abc1 family protein is developmentally regulated. (2005)
  • 著者名/発表者名: Baticados WN, Witola WH, Inoue N, Kim JY, Kuboki N, Xuan X, Yokoyama N, Sugimoto C.
  • 雑誌名: J Vet Med Sci. 67 ページ: 157-164
  • NAID: 110003963695
• [雑誌論文] Full-length cDNAs from Plasmodium and Toxoplasma (2005)
  • 著者名/発表者名: Watanabe J, Xuan X, Suzuki Y, Sasaki M, Wakaguri H, Sugimoto C, Sugano S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research (http://www3.oup.co.uk/nar/database/summary/72) 31
• [雑誌論文] A novel method for development of malaria vaccines using full-length cDNA libraries (2005)
  • 著者名/発表者名: Akiko Shibui, Takashi Shiibashi, Sadao Nogami, Sumio Sugano, Junichi Watanabe
  • 雑誌名: Vaccine (発表予定)
• [雑誌論文] Lethal malaria in cytosolic phospholipase A_2-and phospholipase _2IIA-deficient mice (2004)
  • 著者名/発表者名: Shumpei Ishikawa
  • 雑誌名: Am.J.Trop.Med.Hyg 70(6) ページ: 645-650
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lethal malaria in cytosolic phospholipase A2-and phospholipase A2IIA-deficient mice (2004)
  • 著者名/発表者名: Shumpei Ishikawa
  • 雑誌名: Am. J. Trop. Med. Hyg. 70(6) ページ: 645-650
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] LETHAL MALARIA IN CYTOSOLIC PHOSPHOLIPASE A2-AND PHOSPHOLIPASE AIIA-DEFICIENT MICE (2004)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa S, Uozumi N, Shiibashi T, Izumi T, Fukayama M, Shimizu T, Watanabe J, Nogami S
  • 雑誌名: Amer.J.Trop.Med.Hyg. 70 ページ: 645-650
• [図書] Malaria Research Trends (2007)
  • 著者名/発表者名: Josef Tuda
  • 出版者: Nova Publishers
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] Impact of full-length cDNA library to genome sequencing of malaria parasites, Plasmodium Species in Recent Devel. Nucleic Acids Res. (2004)
  • 著者名/発表者名: Junichi Watanabe, Yutaka Suzuki, Hiroyuki Wakaguri Masahide Sasaki, Sumio Sugano
  • 出版者: Transworld Research Network