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巨大蛋白質をコードするKIAA遺伝子群の遺伝子欠損法による包括的機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 16310141
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用ゲノム科学
研究機関(財)かずさDNA研究所

研究代表者

中山 学  (財)かずさDNA研究所, ヒト遺伝子研究部, 主任研究員 (30370927)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
11,800千円 (直接経費: 11,800千円)
2005年度: 5,300千円 (直接経費: 5,300千円)
2004年度: 6,500千円 (直接経費: 6,500千円)
キーワード包括的機能解析 / 機能ゲノム / 巨大蛋白質 / KIAA / ノックアウトマウス / ヒトゲノム / 脳特異的 / 初期発生
研究概要

包括的なcDNA研究によって得られた膨大な機能未知遺伝子の機能を効率的に解明するために、巨大な蛋白質をコードするKIAA蛋白質の遺伝子欠損マウスを作製し表現型の解析することが有効であると考えられる。「巨大な蛋白質は蛋白質複合体の中心的働きをするため、KIAA蛋白質の欠損は機能蛋白質複合体の機能全体に影響を与え、遺伝子欠損マウスで明らかな表現型を示す」という仮説の実証のために、ヒトで脳特異的に発現する5種類の機能未知のKIAA遺伝子(KIAA1409,KIAA1440,KIAA1447,KIAA1768,KIAA1276)の遺伝子欠損マウスを作製した結果、3種類のKIAA遺伝子欠損マウスで明確な表現型が得られ、それらのKIAA遺伝子欠損マウスの表現型を詳細に解析することができた。特に、KIAA1440-/-の卵は、2.5日の桑実胚までは正常に発生が進み、コンパクションも正常に行われるが、完全な胚盤胞になることはできない。更にIn Vitro細胞培養系を用いてもKIAA1440-/-のE3.5日胚は初代培養細胞としても増殖することができないことが示された。このためKIAA1440-/-のE3.5日胚をTUNEL法で調べた結果、アポトーシスが引き起こされていることが明らかになった。リアルタイムPCR法でマウスKIAA1440mRNA量を定量したところ、胚盤胞では1細胞期胚の5.7倍に発現量が増加していることから、KIAA1440蛋白質の胚盤胞期の発生過程での積極的な関与が示唆された。また、包括的に多くのKIAA遺伝子欠損マウスを作製するために必要とされるターゲティングベクター構築の迅速化に取り組んだ結果、ラムダファージの組み換え酵素であるRedα,Redβ蛋白質に突然変異を導入させることにより、高い組み換え効率を示すRed組み換え系を開発することができた。このことにより、BACクローンを迅速にターゲティングベクターとして改変することが可能になり、追加的にKIAA0817とKIAA1793遺伝子欠損マウスを作製することができた。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (17件)

  • [雑誌論文] A gene-targeting approach for functional characterization of KIAA genes encoding extremely large proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, M
    • 雑誌名

      FASWB J. In press

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A gene-targeting approach for functional characterization of KIAA genes encoding extremely large proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, M.
    • 雑誌名

      FASEB J. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A gene-targeting approach for functional characterization of KIAA genes encoding extremely large proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, M
    • 雑誌名

      FASEB J. (In press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Inprovement of recombination efficiency by mutation of red proteins2005

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, M.
    • 雑誌名

      Biotechniques 38

      ページ: 917-924

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Preparation of a set of expression-ready clones of mammalian long cDNAs encoding large proteins by the ORF trap cloning method2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, D.
    • 雑誌名

      DNA Research 12

      ページ: 221-233

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Improvement of recombination efficienc by mutation of red proteins2005

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, M.
    • 雑誌名

      Biotechniques Vol38

      ページ: 917-924

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Preparation of a set of expression-ready clones of mammalian long cDNAs encoding large proteinsby the ORF trap cloning method2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, D.
    • 雑誌名

      DNA Research Vol12

      ページ: 221-233

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Improvement of recombination efficiency by mutation of red proteins2005

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, M.
    • 雑誌名

      Biotechniques 38

      ページ: 917-924

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Preparation of a set of expression-ready clones of mammalian long cDNAs encoding large proteins by the ORF trap cloning method2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, D.
    • 雑誌名

      DNA Res. 12

      ページ: 221-233

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] HUGE : a database for human KIAA proteins. a 2004 update integrating HUGEppi and ROUGE2004

    • 著者名/発表者名
      R.Kikuno
    • 雑誌名

      Nocieic Acids Research 32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the genes that are expressed in the upper layers of the neocortex2004

    • 著者名/発表者名
      Y.Zhong
    • 雑誌名

      Cereb Cortex 14

      ページ: 1144-1152

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] The CAP-Gly domain of CYLD associates with the proline-rich sequence in NEMO/IKKgamma2004

    • 著者名/発表者名
      K.Saito
    • 雑誌名

      Structure(Camb) 12

      ページ: 1719-1728

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] HUGE: a database for human KIAA proteins, a 2004 update integrating HUGEppi and ROUGE2004

    • 著者名/発表者名
      R.Kikuno
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research Vol32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of the genes that are expressed in the upper layers of the neocortex2004

    • 著者名/発表者名
      Y.Zhong
    • 雑誌名

      Cereb Cortex Vol14

      ページ: 1144-1152

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The CAP-Gly domain of CYLD associates withthe proline-rich sequence in NEMO/IKKgamma2004

    • 著者名/発表者名
      K.Saito
    • 雑誌名

      Structure (Camb) Vol12

      ページ: 1719-1728

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] HUGE : a database for human KIAA proteins, a 2004 update integrating HUGEppi and ROUGE2004

    • 著者名/発表者名
      R.Kikuno
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 32

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] The Cap-Gly domain of CYLD associates with the proline-rich sequence in NEMO/IKKgamma2004

    • 著者名/発表者名
      K.Saito
    • 雑誌名

      Structure(Camb) 12

      ページ: 1719-1728

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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