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タンパク質結晶成長素過程の1分子その場観察による格子欠陥取り込み機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16360001
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用物性・結晶工学
研究機関東北大学

研究代表者

佐崎 元  東北大学, 金属材料研究所, 講師 (60261509)

研究分担者 塚本 勝男  東北大学, 大学院・理学研究科, 助教授 (60125614)
樋口 秀男  東北大学, 先進医工学研究機構, 教授 (90165093)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
15,400千円 (直接経費: 15,400千円)
2005年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2004年度: 13,100千円 (直接経費: 13,100千円)
キーワードタンパク質 / 結晶成長 / 格子欠陥 / その場観察 / 単位成長ステップ / 表面拡散 / レーザー共焦点顕微法 / 1分子観察 / レーザー共焦点顕微鏡
研究概要

リゾチーム正方晶系結晶表面上の単位成長ステップ,個々のタンパク質分子,および結晶中の格子欠陥を,新規に作製したレーザー共焦点微分干渉顕微鏡,近接場1分子観察蛍光顕微鏡,および光散乱トモグラフィー顕微鏡を用いてその場観察し,下記の成果を得た.
1.流れの効果:強制流下で結晶表面の成長ステップの挙動をその場観察し,流れが結晶表面への不純物の輸送を促進し,ステップを顕著に束化することを見いだした.
2.結晶上での表面拡散:結晶表面近傍での蛍光ラベル化リゾチーム分子の拡散運動をその場観察,結晶表面近傍ではバルク溶液中に比べて拡散係数が4桁小さいこと,および結晶方位に応じて拡散係数に異方性が見られることを初めて明らかにした.
3.不純物タンパク質の吸着機構:リゾチームおよび共有結合性リゾチーム・ダイマーを蛍光ラベル化し,結晶表面への吸着過程をその場観察した.その結果,蛍光ラベル化リゾチームは選択的にステップに,そして蛍光ラベル化ダイマーはテラスにランダムに吸着すること,および吸着機構に応じてステップ前進速度の過飽和度依存性が異なることを見出した.
4.結晶中の格子欠陥:結晶を溶解させることなく,結晶中の転位のその場観察に成功した.また,結晶表面に付着した微結晶が母結晶中へ固相インクルージョンとして取り込まれると転移の発生源となり,インクルージョン直上に渦巻成長丘が発達することを見出した.さらに,結晶中の空孔や不純物粒子を起源とするマイクロ欠陥と考えられるコントラストのその場観察にも成功した.
5.総括:結晶表面でのタンパク質分子の表面拡散・吸着・脱離過程を初めて明らかにした.また,高品質結晶を成長させるためには,不純物タンパク質の吸着サイトに応じて最適過飽和度が異なること,流れは抑制した方がよいことを見いだした.さらに,成長している結晶中の主な格子欠陥のその場観察技術を確立した.

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (32件) 図書 (6件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Structural consequences of hen egg-white lysozyme orthorhombic crystal growth in a high magnetic field : validation of X-ray diffraction intensity, conformational energy searching and quantitative analysis of B factors and mosaicity2005

    • 著者名/発表者名
      S.Saijo
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D61

      ページ: 207-217

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Kinetic acceleration of the growth rate of glucose isomerase crystals under high pressure2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Suzuki
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B109

      ページ: 3222-3226

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Investigations on electromigration phenomena for protein crystallization using crystal growth cells with multiple electrode : Effect of the potential control2005

    • 著者名/発表者名
      E.Nieto-Mendoza
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth 275

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In situ observation of dislocations in protein crystals during growth by advanced optical microscopy2005

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      Crystal Growth and Design 5

      ページ: 1729-1735

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 格子欠陥発生機構の解明に向けたタンパク質結晶表面の高分解光学観察2005

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 雑誌名

      応用物理 74

      ページ: 608-612

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Kinetic acceleration of the growth rate of glucose isomerase crystals under high pressure2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Suzuki
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.B 109

      ページ: 3222-3226

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Investigations on electromigration phenomena for protein crystallization using crystal growth cells with multiple electrode : Effect of the potential control2005

    • 著者名/発表者名
      E.Nieto-Mendoza
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 275

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Surface observation of protein crystals by high-resolution optical microscopy2005

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      Oyo Butsuri 74

      ページ: 608-612

    • NAID

      10015722624

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In situ observation of dislocations in protein crystals during growt by advanced optical microscopy2005

    • 著者名/発表者名
      Sazaki, et al.
    • 雑誌名

      Crystal Growth & Design 5

      ページ: 1729-1735

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 格子欠陥発生機構の解明に向けたタンパク質結晶表面の高分解光学観察2005

    • 著者名/発表者名
      左崎 元ら
    • 雑誌名

      応用物理 74

      ページ: 608-612

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Kinetic acceleration of the growth rate of glucose isomerase crystal under high pressure2005

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 109

      ページ: 3222-3226

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A unique dye-decolorizing peroxidase, DyP, from Thanatephorus cucumeris Dec 1 : heterologous expression, crystallization and preliminary X-ray analysis2004

    • 著者名/発表者名
      T.Sato
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D60

      ページ: 149-152

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel coupling effects of the magnetic and electric fields of protein crystallization2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth 262

      ページ: 499-502

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In-situ observation of elementary growth steps on the surface of protein crystals by laser confocal microscopy2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth 262

      ページ: 536-542

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The Use of a new ad hoc growth cell with parallel electrode for the nucleation control of lysozyme2004

    • 著者名/発表者名
      A.Moreno
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth 264

      ページ: 438-444

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of high pressure on the solubility and growth kinetic of monoclinic lysozyme crystals2004

    • 著者名/発表者名
      T.Asai
    • 雑誌名

      Cell. Mol. Biol. 50

      ページ: 329-334

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] タンパク質結晶化への新たなアプローチ : 磁場および高圧力の利用2004

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 雑誌名

      生物物理 44

      ページ: 58-63

    • NAID

      110001158630

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] タンパク質の結晶化に及ぼす圧力効果2004

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 46

      ページ: 152-158

    • NAID

      10012907347

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel coupling effects of the magnetic and electric fields on protein crystallization2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 262

      ページ: 499-502

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In-situ observation of elementary growth steps on the surface of protein crystals by laser confocal microscopy2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 262

      ページ: 536-542

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The Use of a new ad hoc growth cell with parallel electrodes for the nucleation control of lysozyme2004

    • 著者名/発表者名
      A.Moreno
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 264

      ページ: 438-444

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of high pressure an the solubility and growth kinetics of monoclinic lysozyme crystals2004

    • 著者名/発表者名
      T.Asai
    • 雑誌名

      Cell.Mol.Biol. 50

      ページ: 329-334

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel approach to protein crystallization : Use of a magnetic field and high pressure2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      Seibutsu Butsuri 44

      ページ: 58-63

    • NAID

      110001158630

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of high pressure on protein crystallization2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki
    • 雑誌名

      J.Jpn.Assoc.Cryst.Growth 46

      ページ: 152-158

    • NAID

      10012907347

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel coupling effects of the magnetic and electric fields on protein crystllization2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki, et al.
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 262

      ページ: 499-502

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] In-situ observation of elementary growth steps on the surface of protein crstals by laser confocal microscopy2004

    • 著者名/発表者名
      G.Sazaki, et al.
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 262

      ページ: 536-542

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] The Use of a new ad hoc growth cell with parallel electrodes for the nucleaion control of lysozyme2004

    • 著者名/発表者名
      A.Moreno, et al.
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 264

      ページ: 438-444

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Effects of high pressure on the solubility and growth kinetics of monoclini lysozyme crystals2004

    • 著者名/発表者名
      T.Asai, et al.
    • 雑誌名

      Cell.Mol.Biol. 50

      ページ: 329-334

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質結晶化への新たなアプローチ:磁場および高圧力の利用2004

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元ら
    • 雑誌名

      生物物理 44

      ページ: 58-63

    • NAID

      110001158630

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質の結晶化に及ぼす圧力効果2004

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元ら
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 46

      ページ: 152-158

    • NAID

      10012907347

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Step velocity in tetragonal lysozyme growth as a function of impurity concentration and mass transport conditions

    • 著者名/発表者名
      P.Dold
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth (印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Step velocity in tetragonal lysozyme growth as a function of impurity concentration and mass transport conditions

    • 著者名/発表者名
      P.Dold
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] 高圧力下の生物科学 : タンパク質結晶表面のステップ前進速度に及ぼす圧力効果2006

    • 著者名/発表者名
      鈴木良尚
    • 出版者
      さんえい出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] 高圧力下の生物科学:タンパク質結晶表面のステップ前進速度に及ぼす圧力効果2006

    • 著者名/発表者名
      鈴木良尚ら
    • 出版者
      さんえい出版(投稿中)
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] タンパク質の結晶化 : 第11章2節 磁場中で結晶をつくる2005

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      京都大学学術出版会
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] タンパク質の結晶化 : 12章2節 タンパク質結晶の光学顕微鏡を用いた表面観察2005

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      京都大学学術出版会
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] タンパク質の結晶化:第11章2節 磁場中で結晶をつくる2005

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      京都大学学術出版会
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] タンパク質の結晶化:12章2節 タンパク質結晶の光学顕微鏡を用いた表面観察2005

    • 著者名/発表者名
      佐崎 元
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      京都大学学術出版会
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [産業財産権] 光学顕微鏡と光学的観察方法2005

    • 発明者名
      小林 茂
    • 権利者名
      小林 茂
    • 産業財産権番号
      2005-086550
    • 出願年月日
      2005-03-24
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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