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分子構造の動的および静的側面から見た転写制御機構に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 16370051
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

緒方 一博  横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (90260330)

研究分担者 佐藤 光  横浜市立大学, 医学部, 助手 (90300962)
椎名 政昭  横浜市立大学, 医学部, 助手 (30347299)
浜田 恵輔  横浜市立大学, 医学部, 助手 (00344052)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
15,300千円 (直接経費: 15,300千円)
2005年度: 7,400千円 (直接経費: 7,400千円)
2004年度: 7,900千円 (直接経費: 7,900千円)
キーワード核磁気共鳴法 / 表面プラズモン共鳴 / 構造的揺らぎ / Runx1 / CBFβ / Ets1 / リン酸化 / 協調的DNA結合活性 / 転写制御因子 / 急性白血病 / 磁気緩和時間測定 / 揺らぎ / 転写制御因子高次複合体 / c-Myb / C / EBP / プロモーター / アロステリック
研究概要

本研究では、血球分化に関わる転写制御因子Runx1,CBFβおよびEts1等を中心に、これらの標的プロモーター(エンハンサー)における活性制御機構を解析するために、X線結晶構造解析、核磁気共鳴法による分子の揺らぎの解析、および表面プラズモン法や培養細胞による転写活性化実験等の機能実験を行った。
DNA結合性の転写制御因子Runx1の活性は、DNA非結合性の転写制御因子CBFβによってアロステリックに制御されている。CBFβ存在下および非存在下におけるRunx1-DNA複合体中でのRunx1の揺らぎをNMRを用いて解析した。また、動的構造解析から、制御にとって重要であると予想される残基に変異を導入し、生化学的機能を解析した。その結果、Runx1の分子の揺らぎの変化が、転写制御因子の機能制御と密接に関連することを見出した。
複数の転写制御因子による協調的DNA結合活性制御機構および転写制御因子の化学修飾による転写制御因子複合体形成への影響を解析するため、T細胞抗原受容体α鎖のエンハンサーに形成される、Runx1-CBFβ-Ets1-DNA複合体およびRunx1-CBFβ-リン酸化Ets1-DNA複合体の形成機構について、X線結晶構造解析による静的構造解析と、ゲルシフトアッセイおよび転写活性化実験による機能解析を行い、Runx1およびEts1の転写制御領域と制御様式を詳細に決定した。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2007 2005 2004

すべて 雑誌論文 (7件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Distant N-terminal and C-terminal domains are required for intrinsic kinase activity of SMG-1, a critical component of nonsense-mediated mRNA decay2007

    • 著者名/発表者名
      Morita T
    • 雑誌名

      J Biol Chem (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cyclin-dependent kinase (CDK) phosphorylation destabilizes somatic Weel via multiple pathways2005

    • 著者名/発表者名
      Nobumoto Watanabe
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102

      ページ: 11663-11668

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 特集 転写制御と疾患 タンパク質の分子構造異常と癌化.2005

    • 著者名/発表者名
      緒方 一博
    • 雑誌名

      Molecular Medicine 42

      ページ: 64-75

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cyclin-dependent kinase (CDK) phosphorylation destabilizes somatic Weel via multiple pathways2005

    • 著者名/発表者名
      Nobumoto Watanabe
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102

      ページ: 11663-11668

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cyclin-dependent kinase (CDK) phosphorylation destabilizes somatic Weel via multiple pathways2005

    • 著者名/発表者名
      Nobumoto Watanabe, Harumi Arai, Jun-ichi Iwasaki, Masaaki Shiina, Kazuhiro Ogata, Tony Hunter, Hiroyuki Osada
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102

      ページ: 11663-11668

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Assembly of transcriptional regulatory factors, c-Myb and C/EBP β, from separated sites on a promoter2004

    • 著者名/発表者名
      Tahirov, T.H., Sato, K., Ogata, K.
    • 雑誌名

      SPring-8 Research Frontiers

      ページ: 10-11

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] ポストゲノム時代の生化学、構造生物学〜生体分子の機能発現機構の解明を目指して〜2004

    • 著者名/発表者名
      緒方 一博
    • 雑誌名

      生化学 76

      ページ: 1305-1319

    • NAID

      10013732766

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] 分子生物学実験シリーズ「図・写真で観るタンパク構造・機能解析実験実践ガイド」タンパク質の立体構造解析を行うために-分子構造解析のためのタンパク質試料調整法.2005

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭
    • 出版者
      メディカル ドゥ
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] 分子生物学実験シリーズ「図・写真で観るタンパク構造・機能解析実験実践ガイド」タンパク質の立体構造解析を行うために-分子構造解析のためのタンパク質試料調整法.2005

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 浜田恵輔, 緒方一博
    • 出版者
      メディカル ドゥ
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] c-Myb DNA-binding domain : from molecular structure to functions "Myb Transcription Factors : Their Role in Growth, Differentiation and Diseases" (ed.by J.Frampton)2004

    • 著者名/発表者名
      Ogata, K., Tahirov, T.H., Ishii, S.
    • 出版者
      Kluwer Academic Publishers B.V.
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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