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圧力軸実験によるアミロイド形成機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16370054
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関近畿大学

研究代表者

赤坂 一之  近畿大学, 生物理工学部, 教授 (50025368)

研究分担者 藤澤 雅夫  近畿大学, 生物理工学部, 講師 (20258065)
安東 由喜雄  熊本大学, 医学部, 講師 (20253742)
橘 秀樹  神戸大学, 理学部, 助教授 (70126118)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
13,700千円 (直接経費: 13,700千円)
2005年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2004年度: 11,600千円 (直接経費: 11,600千円)
キーワードアミロイドプロトフィブリル / ニワトリリゾチーム / 圧力ジャンプNMR / 高圧蛍光 / プロトフィブリルの圧力解離 / 解離の活性化体積 / 変異型トランスサイレチン / トランスサイレチンの熱力学安定 / ニワトリリゾチームのS-S / 圧力によるプロトフィブリルの解 / プロトフィブリル解離の活性化体 / トランスサイレチンの変異型 / 高圧NMR / ニワトリリゾチーム変異体 / 圧力解離 / 原子間顕微鏡 / 活性化体積
研究概要

1.ニワトリリゾチームのS-S欠損変異体は、常温常圧下では3次元立体構造は形成せず、塩存在下で速やかに会合し、数ヶ月の間に安定なプロトフィブリルを形成する。30-2000気圧への圧カジャンプNMR測定から、2000気圧では数日の間にプロトフィブリルがモノマーに解離し、圧力を30気圧に戻すと再び会合が始まる。プロトフィブリルの形成は完全に可逆的であり、モノマー-オリゴマー間の平衡が、圧力により完全に制御可能であることを明らかにした。
2.さらにアミロイドプロトフィブリル解離のキネティックスを、高圧下のトリプトファン蛍光とAFMを用いて初めて詳しく研究した。自然に変性状態にあるニワトリリゾチームのS-S欠損変異体がつくるプロトフィブリルについて、圧力により加速される解離反応をトリプトファンの蛍光によりモニターした。蛍光の時間変化の解析とプロトフィブリルの線維長分布の解析から、プロトフィブリルの成長と消滅は、線維の端にモノマーが付加するのと線維の端からモノマーが解離するのとよりなるlinear polymerization mechanismにより進行することを明らかにした。さらに、解離の活性化体積が負でありΔV^<o‡>=-50.5±1.60ml mol^<-1>)、活性化圧縮率も負であることを示した。これらの結果は、今後アミロイド線維の形成と解離機構の基本的情報となるものと考えられる。
3.家族性アミロイド病のもととなる蛋白質ヒトトランスサイレチンに関して、野生型と病原性の変異型(V30M)の熱力学的安定性を、体温以下の低温領域で高圧蛍光実験に基づいて解析した。両蛋白質とも温度低下とともに熱力学安定性は低下するが、どの温度においても野生型に比べて変異型が顕著に不安定である。これにより、V30M変異による熱力学的安定性の低下が、トランスサイレチンのアミロイド形成を促進する直接の原因であると考えられる。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (16件)

  • [雑誌論文] Probing Conformational Fluctuation of Proteins by Pressure Perturbation2006

    • 著者名/発表者名
      K.Akasaka
    • 雑誌名

      Chemical Reviews Thematic Issue "Protein Dynamics and Folding" (印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The Use of High Pressure NMR to Study Ptotein Folding2006

    • 著者名/発表者名
      M.Lassalle
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology (edited by Yawen Bai and Ruth Nussinov) (印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Conformational fluctuations of proteins revealed by variable pressure NMR2006

    • 著者名/発表者名
      H.Li
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta, Special Issuue (edited by R.Range) 1764

      ページ: 331-345

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Probing Conformational Fluctuation of Proteins by Pressure Perturbation2006

    • 著者名/発表者名
      K.Akasaka
    • 雑誌名

      Chemical Reviews Thematic Issue "Protein Dynamics and Folding" (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The Use of High Pressure NMR to Study Protein Folding Biology2006

    • 著者名/発表者名
      M.Lassalle
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology (edited by Y.Bai and R.Nussinov) (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Conformational fluctuations of proteins revealed by variable pressure NMR2006

    • 著者名/発表者名
      H.Li
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta Special Issue (edited by R.Range) 1764

      ページ: 331-345

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pressure-jump NMR Study of Dissociation and Association of Amyloid Protofibrils2006

    • 著者名/発表者名
      Y.O.Kamatari
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 349

      ページ: 916-921

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 可変圧力NMR法による新しい蛋白質構造パラダイムの構築。2006

    • 著者名/発表者名
      北原 亮, 横山茂之, 赤坂一之
    • 雑誌名

      分光研究 55・1

      ページ: 10-20

    • NAID

      10016735137

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Conformational fluctuations of proteins revealed by variable pressure NMR.2006

    • 著者名/発表者名
      Hua, L., Akasaka, K.
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta (Special issue) (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The use of high pressure NMR to study protein folding.2006

    • 著者名/発表者名
      Lassalle, M.W., Akasaka, K.
    • 雑誌名

      Method in Molecular Biology (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Pressure-jump NMR Study of Dissociation and Association of A myloid Protofibrils2005

    • 著者名/発表者名
      Y.O.Lamatari
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 349

      ページ: 916-921

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pressure-jump NMR study of dissociation and association of amyloid protofibrils.2005

    • 著者名/発表者名
      Kamatari, Y.O., Yokoyama, S., Tachibana, H., Akasaka, K.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 349

      ページ: 916-921

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Pressure-dissociable reversible assembly of naturally denatured lysozyme is a precursor for amyloid fibrils.2004

    • 著者名/発表者名
      Tara N.Niraula, Takashi Konno, Hua Li, Hiroaki Yamada, Kazuyuki Akasaka, Hideki Tachibana
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101

      ページ: 4089-4093

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Slow conformational dynamics in the Hamster prion protein.2004

    • 著者名/発表者名
      Kazuo Kuwata, Yuji O.Kamatari, Kazuyuki Akasaka, Thomas L.James
    • 雑誌名

      Biochemistry 43

      ページ: 4439-4446

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 可変圧力NMRが明かす蛋白質の新しい概念2004

    • 著者名/発表者名
      赤坂一之
    • 雑誌名

      高圧力の科学と技術 13

      ページ: 328-334

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] High pressure NMR spectroscopy for characterizing non-native conformers of proteins2004

    • 著者名/発表者名
      Y.O.Kamatari, R.Kitahara, H.Yamada, S.Yokoyama, K.Akasaka
    • 雑誌名

      Methods 34

      ページ: 133-143

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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