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ペプチドを用いたタンパク質の構造形成と構造-機能相関の研究

研究課題

研究課題/領域番号 16550149
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関京都薬科大学

研究代表者

廣田 俊  京都薬科大学, 薬学部, 助教授 (90283457)

研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2006年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2005年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2004年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワード蛋白質 / ペプチド / 構造-機能相関 / シトクロムc / プラストシアニン / チロシン含有ペプチド / 電子移動 / 構造形成 / 構造ー機能相関 / シトオクロムc
研究概要

生体内では、タンパク質はお互いに相互作用して存在している。本研究では、オリゴペプチドをタンパク質の部位モデルとして用い、ペプチドとタンパク質の相互作用を詳細に調べることにより、タンパク質の分子認識様式、他分子との相互作用による構造変化及びその機能への影響、タンパク質とペプチドとの反応性を解明することを目的とし、以下の成果を得た。
1.チロシルチロシルフェニルアラニン(YYF)によるcyt cの還元反応において、初期段階における反応速度定数kintを求めたところ、kintはYYF濃度、水素イオン濃度、イオン強度、反応温度に依存した。この還元反応には、チロシン残基のプロトン引き抜きが必要であり、弱い静電的相互作用でcyt cとYYFが相互作用していることが判明した。
2.酸化型cyt cとYYFの反応によって生じた反応生成物はYYFと反応し、cyt cの還元反応を阻害していることが示唆された。質量分析により、反応生成物は数種類のキノンやラジカル反応による生成物の混合物であることが解り、cyt cが還元されるとともに、未反応のペプチドのチロシン残基が酸化されることが示唆された。
3.トリチロシン(YYY)によるPCの還元反応の速度定数も、水素イオン濃度、イオン強度に依存した。このことより、静電的に不利ではあるが、脱プロトン化したYYY^-がPCと相互作用して、PCが還元されることが解った。また、正イオンをこの反応系に共存させると、この正イオンがPCやYYY^-と相互作用することによりPCとYYY^-の反発を抑え、PCの還元速度が速くなることが解った。
以上の結果より、中性からアルカリ条件下において、金属タンパク質がチロシン含有ペプチドによって還元されることが見出された。このとき、脱プロトン化したチロシン含有オリゴペプチドは金属タンパク質と相互作用し、生じたチロシルラジカルが未反応のチロシンペプチドと反応することにより、金属タンパク質の還元反応が促進させることが解った。

報告書

(4件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (18件)

  • [雑誌論文] Conformational changes during apoplastocyanin folding observed by photocleavable modification and transient grating2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 128・23

      ページ: 7551-7558

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reduction of plastocyanin by tyrosine-containing oligopeptides2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Inorg. Biochem. 100・11

      ページ: 1871-1878

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Conformational changes during apoplastocyanin folding observed by photocleavable modification and transient grating2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J Am. Chem. Soc. 128

      ページ: 7551-7558

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reduction of plastocyanin by tyrosine-containing oligopeptides2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Inorg. Biochem. 100

      ページ: 1871-1878

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Conformational changes during apoplastocyanin fokding observed by photocleavable modification and transient grating2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota, Y.Fujimoto, J.Choi, N.Baden, N.Katagiri, M.Akiyama, R.Hulsker, M.Ubbink, T.Okajima, T.Takabe, N.Funasaki, Y.Watanabe, M.Terazima
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 128・23

      ページ: 7551-7558

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Reduction of plastocyanin by tyrosine-containing oligopeptides2006

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota, H.Okumura, T.Kondoh, N.Funasaki, T.Takabe, Y.Watanabe
    • 雑誌名

      Journal of Inorganic Biochemistry 100・11

      ページ: 1871-1878

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Reduction of ferricytochrome c by tyrosyltyrosylphenylalanine2005

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Biol. Inorg. Chem. 10・4

      ページ: 355-363

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Heme reduction by intramolecular electron transfer in cysteine mutant myoglobin under carbon monoxide atmosphere2005

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44・30

      ページ: 10322-10327

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Activation process of [NiFe] hydrogenase elucidated by high-resolution X-ray analyses : Conversion of the ready to the unready state2005

    • 著者名/発表者名
      H.Ogata et al.
    • 雑誌名

      Structure 13・11

      ページ: 1635-1642

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Oxygen binding to tyrosinase from Streptomyces antibioticus studied by laser flash photolysis2005

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 127・51

      ページ: 17966-17967

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reduction of ferricytochrome c by tyrosyltyrosylphenylalanine2005

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J Biol. Inorg. Chem. 10

      ページ: 355-363

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Heme reduction by intramolecular electron transfer in cysteine mutant myoglobin under carbon monoxide atmosphere2005

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 10322-10327

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Activation process of [NiFe] hydrogenase elucidated by high-resolution X-ray analyses : Conversion of the ready to the unready state2005

    • 著者名/発表者名
      H.Ogata et al.
    • 雑誌名

      Structure 13

      ページ: 1635-1642

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Oxygen binding to tyrosinase from Streptomyces antibioticus studied by laser flash photolysis2005

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J Am. Chem. Soc. 127

      ページ: 17966-17967

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reduction of Ferricytochrome c by Tyrosyltyrosylphenylalanine2005

    • 著者名/発表者名
      Hirota, S., Okumura, H., Kuroiwa, S., Funasaki, N., Watanabe, Y.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Inorganic Chemistry 10・4

      ページ: 355-363

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Interaction of plastocyanin with oligopeptides : effect of lysine distribution within the peptide2004

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Inorg. Biochem. 98・5

      ページ: 849-855

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Interaction of plastocyanin with oligopeptides : effect of lysine distribution within the peptide2004

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota et al.
    • 雑誌名

      J. Inorg. Biochem 98

      ページ: 849-855

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Interaction of plastocyanin with oligopeptides : effect of lysine distribution within the peptide2004

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota, H.Okumura, S.Arie, K.Tanaka, M.Shionoya, T.Takebe, N.Funasaki, Y.Watanabe
    • 雑誌名

      J.Inorg.Biochem. 98

      ページ: 849-855

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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