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NMRによるタンパク質分子複合体の迅速な立体構造決定方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 16570090
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

小椋 賢治  北海道大学, 大学院・薬学研究科, 助手 (50270682)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2005年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2004年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードNMR / タンパク質 / 立体構造
研究概要

本研究課題において,研究代表者は,タンパク質-タンパク質あるいはタンパク質-低分子化合物複合体の立体構造を迅速に決定できるよう,新しい安定同位体標識法を提案することを目的とした.
好中球NADPHオキシダーゼの構成成分,p67phoxのTetratricopeptide repeat(TPR)ドメインは,GTP結合状態のRacと結合することにより,NADPHオキシダーゼを活性化する役割を担っている.研究代表者らは,p67phoxのTPRドメイン(203残基)の主鎖連鎖帰属およびメチル基特異的帰属をおこなった.Val,LeuおよびIleのメチル基のみプロトン化された2H/13C/15NラベルTPRドメインを作成し,NMRスペクトル解析をおこない,連鎖帰属を完了した.さらに,プロトン化されたVal,LeuおよびIleのメチル基についても帰属することができた.さらに,このTPRドメインのグローバルフォールドを迅速に決定することができた(投稿準備中).この手法はタンパク質単体の立体構造決定だけでなく,タンパク質分子複合体においても応用可能である.
Grb2タンパク質のSH2ドメインは乳癌との関連が指摘されている,細胞内シグナル伝達において重要なタンパク質である.近年,米国保健研究所Burke博士より開発された低分子化合物がGrb2 SH2ドメインに対して強い親和性を持つことが示され,薬剤候補化合物として注目が集まっている.研究代表者は,Grb2 SH2ドメイン-この薬剤候補化合物の複合体の立体構造をNMR法を用いて決定した.構造解析過程にて,Grb2 SH2ドメインを重水素標識することにより,タンパク質に結合した低分子化合物のNMR信号を高感度で検出することができ,このタンパク質分子複合体の立体構造を従来よりも短時間かつ高精度で決定することができた(投稿準備中).

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (13件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] NMR solution structure of the tandem Src homology 3 domains of p47phox complexed with a p22phox-derived proline-rich peptide2006

    • 著者名/発表者名
      Ogura, K.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 281

      ページ: 3660-3660

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Activation of the superoxide-producing phagocyte NADPH oxidase requires cooperation between the tandem SH3 domains of p47 phox in recognition of a polyproline type II helix and an adjacent alpha-helix of p22 phox.2006

    • 著者名/発表者名
      Nobuhisa, I.
    • 雑誌名

      Biochemical Journal 396

      ページ: 183-183

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] NMR Study on the Major Mite Allergen Der f 2 : Its Refined Tertiary Structure, Epitopes for Monoclonal Antibodies and Characteristics Shared by ML Protein Group Members.2005

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry (Tokyo) 137

      ページ: 255-255

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Refolding and purification of recombinant OsNifU1A domain II that was expressed by Escherichia coli.2005

    • 著者名/発表者名
      Katoh, S.
    • 雑誌名

      Protein Expression and Purification 43

      ページ: 149-149

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 1H, 13C and 15N resonance assignments of the backbone and methyl groups of the 24 kDa tetratricopeptide repeat domain in p67phox.2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR 32

      ページ: 176-176

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] NMR Study on the Major Mite Allergen Der f2 : Its Refined Tertiary Structure, Epitopes for Monoclonal Antibodies and Characteristics Shared by ML Protein Group Members.2005

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry (Tokyo) 137

      ページ: 255-255

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 好中球活性酸素発生系を制御する蛋白質p47phoxの新規分子認識機構2005

    • 著者名/発表者名
      小椋賢治
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50

      ページ: 1233-1233

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 1H, 13C and 15N resonance assignments of the backbone and methyl groups of the 24 kDa tetratricopeptide repeat domain in p67(phox)2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR 32

      ページ: 176-176

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A molecular mechanism for autoinhibition of the tandem SH3 domains of p47phox, the regulatory subunit of the phagocyte NADPH oxidase.2004

    • 著者名/発表者名
      Yuzawa, S.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 9

      ページ: 443-443

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence-specific Resonance Assignments of the Tandem SH3 Domains in an Autoinhibitory form of p47(phox).2004

    • 著者名/発表者名
      Yuzawa, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR 29

      ページ: 451-451

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Solution Structure of the Tandem Src Homology 3 Domains of p47phox in an Autoinhibited Form.2004

    • 著者名/発表者名
      Yuzawa, S.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 279

      ページ: 29752-29752

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Solution structure of atypical PKC PBI domain and its mode of interaction with ZIP/p62 and MEK5.2004

    • 著者名/発表者名
      Hirano, Y.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 279

      ページ: 31883-31883

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Solution structure of atypical PKC PB1 domain and its mode of interaction with ZIP/p62 and MEK5.2004

    • 著者名/発表者名
      Hirano, Y.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 279

      ページ: 31883-31883

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] 生命秩序を担う生体超分子(蛋白質核酸酵素2005年8月号増刊)(執筆分担)2005

    • 著者名/発表者名
      小椋賢治
    • 総ページ数
      274
    • 出版者
      共立出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] Seimei Chitsujo wo ninau seitai choubunsi2005

    • 著者名/発表者名
      Ogura, K.
    • 総ページ数
      274
    • 出版者
      Kyouritu Shuppan
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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