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幹細胞分化制御に関わるNotchシグナル伝達系分子群の溶液構造及び高次構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 16570102
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関関西学院大学

研究代表者

山口 宏  関西学院大学, 理工学部, 助教授 (10252719)

研究分担者 木下 勉  関西学院大学, 理工学部, 教授 (30161532)
佐藤 衛  横浜市立大学, 大学院・国際総合科学研究科, 教授 (60170784)
研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
2006年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2005年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2004年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワードNotchシグナル / 発現条件 / 精製 / 結晶化 / 溶液構造 / X線小角散乱 / シグナル伝達系 / 高次構造解析 / 結晶化条件検索
研究概要

Notch情報伝達系は、発生過程の多くのステージにおいて未分化の神経幹細胞の維持や分化を制御している。Notch情報伝達系でヘテロ三量体を形成する、細胞内ドメイン(NICD)、SuppressorofHairless(Su(H))、Mastermind(Mam)に着目し、このシグナル伝達・分化制御機構をタンパク質分子レベルで解明するために研究を遂行した。
X-NICD、X-Su(H)、X-Mamの発現精製条件を検索した結果、大量発現には成功するものの物理化学的に均一な試料として精製する事はできなかった。X-NICD中の機能ドメインである、アンキリンリピート(X-ANK)およびRamドメインに関しては、X-ANKおよび二つのドメインが連続したX-mm-ANKを高純度に精製する事に成功した。X-ANKおよびX-RAM-ANKの溶液状態での会合状態を動的光散乱実験により解析した結果、X-ANKは単分散であるがX-RAM-ANKは非常に大きな多分散度が得られ、多様な会合状態として溶液中に存在している事が明らかになった。そして、CDスペクトルを用いて精製標品のα一ヘリックス含有量を計算したところ、X-RAM-ANKにおけるRAMドメインは二次構造を取っておらず、非天然構造である事が示唆され、濃縮時の非特異的な凝集は、mmメインの非天然構造部位間で相互作用を形成して生じている事が考えられた。さらに、X-ANKの構造学的知見を得るために、X線小角散乱法を用いた実験を行い、慣性半径、分子内最大長を算出し、さらにabinitio法を用いDummyAtomModelを求めた。その結果、X-ANKの二量体を形成しているR値0.13%のモデルを得る事ができた。分子の形状は、最大長105.5Å、幅が約40Å、突出部分の幅が約53Åの凸型が背中合わせで二量体を形成しており、ショウジョウバエ由来ANKモデルを問題なくフィッティングする事ができた。X-ANKの結晶化条件検索も進め、PEG400を沈澱剤として、結晶を得る事に成功した。また、これ分子の機能解析も進め、新たな知見を得ることに成功した。

報告書

(4件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2007 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (29件)

  • [雑誌論文] XSu(H)2 is an essential factor for gene expression and morphogenesis of Xenopus gastrula embryos2007

    • 著者名/発表者名
      M.Ito
    • 雑誌名

      Dev. Biol. 51

      ページ: 27-36

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Xenopus Suppressor of Hairless 2 is involved in the cell fate decision during gastrulation through the transcriptional regulation of Xoct25/91.2007

    • 著者名/発表者名
      M.Ito
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Com. 353

      ページ: 644-649

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] XSu(H)2 is an essential factor for gene expression and morphogenesis of the Xenopus gastrula embryo.2007

    • 著者名/発表者名
      M.Ito
    • 雑誌名

      J.Dev.Biol. 51

      ページ: 27-36

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Xenopus Suppressor of Hairless 2 is involved in the cell fate decision during gastrulation through the transcriptional regulation of Xoct25/91.2007

    • 著者名/発表者名
      M.Ito
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 353

      ページ: 644-649

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] XMaml, Xenopus Mastermind1, induces the neural gene expression in a Notch-independent manner.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Katada
    • 雑誌名

      Mech. Dev. 123

      ページ: 851-859

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Purification of NADPH-P450 reductase (NPR) from Xenopus laevis developmental change in NPR expression.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Mori
    • 雑誌名

      Life Science 79

      ページ: 247-251

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Kinetic and Structural Studies on the Catalytic Role of the Aspartic Acid Residue Conserved in Copper Amine Oxidase.2006

    • 著者名/発表者名
      Yen-Chen Chiu
    • 雑誌名

      Biochemistry 45・13

      ページ: 4105-4120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal Structure of 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase from Comamonas testosteroni Has a Large Tunnel for Substrate and Oxygen Access to the Active Site.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Hiromoto
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 364

      ページ: 878-896

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書 2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of MobR, the 3-Hydroxybenzoate-responsive Transcriptional Regulator for the 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase Gene of Comamonas testosteroni KH122-3s2006

    • 著者名/発表者名
      T.Hiromoto
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 364

      ページ: 863-877

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] XMaml, Xenopus Mastermind1, induces the neural gene expression in a Notch-independent manner.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Katada
    • 雑誌名

      Mech.Dev. 123

      ページ: 851-859

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Purification of NADPH-P450 reductase (NPR) from Xenopus laevis and developmental change in NPR expression. Life Sciences, 79, 247-251. (2006).2006

    • 著者名/発表者名
      T.Mori
    • 雑誌名

      Life Science 79

      ページ: 247-251

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Kinetic and Structural Studies on the Catalytic Role of the Aspartic Acid Residue Conserved in Copper Amine Oxidase.2006

    • 著者名/発表者名
      Yen-Chen.Chiu
    • 雑誌名

      Biochemistry. 45-13

      ページ: 4105-4120

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal Structure of 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase from Comamonas testosteroni Has a Large Tunnel for Substrate and Oxygen Access to the Active Site.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Hiromoto
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 364

      ページ: 878-896

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of MobR, the 3-Hydroxybenzoate-responsive Transcriptional Regulator for the 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase Gene of Comamonas testosteroni KH122-3s.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Hiromoto
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 364

      ページ: 863-877

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of MobR, the 3-Hydroxybenzoate-responsive Transcriptional Regulator for the 3-Hydroxybenzoate Hydroxylase Gene of Comamonastestosteroni KH122-3s.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Hiromoto
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 364

      ページ: 863-877

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] XMam1, Xenopus Mastermind1, induces the neural gene expression in a Notch-independent manner.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Katada
    • 雑誌名

      Mech. Dev. 123

      ページ: 851-859

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Kinetic and Structural Studies on the Catalytic Role of the Aspartic Acid Residue Conserved in Copper Amine Oxidase2006

    • 著者名/発表者名
      Yen-Chen Chiu
    • 雑誌名

      Biochemistry (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Purification of NADPH-P450 reductase (NPR) from Xenopus laevis developmental change in NPR expression.2006

    • 著者名/発表者名
      T.Mori
    • 雑誌名

      Life Science (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Raman and Wide-Angle X-Ray Diffraction Studies on Molecular Structure, Crystallinity, and Morphology of Uncompatibilized and Compaltibilized of High Molecular Weight Polyethylene/Nylon 122005

    • 著者名/発表者名
      H.Sato
    • 雑誌名

      Macromol. Symp. 220

      ページ: 75-84

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reinvestigation of Metal Ion Specificity for Quinone Cofactor Biogenesis in Bacterial Copper Amine Oxidase2005

    • 著者名/発表者名
      T.Okajima
    • 雑誌名

      Biochemistry 44・36

      ページ: 12041-12048

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Raman and Wide-Angle X-Ray Diffraction Studies on Molecular Structure, Crystallinity, and Morphology of Uncompatibilized and Compaltibilized of High Molecular Weight Polyethylene/Nylon 12,2005

    • 著者名/発表者名
      H.Sato
    • 雑誌名

      Macromol.Symp. 220

      ページ: 75-84

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reinvestigation of Metal Ion Specificity for Quinone Cofactor Biogenesis in Bacterial Copper Amine Oxidase.2005

    • 著者名/発表者名
      T.Okajima
    • 雑誌名

      Biochemistry. 44-36

      ページ: 12041-12048

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Raman and Wide-Angle X-Ray Diffraction Studies on Molecular Structure, Crystallinity, and Morphology of Uncompatibilized and Compaltibilized of High Molecular Weight Polyethylene/Nylon 122005

    • 著者名/発表者名
      H.Sato
    • 雑誌名

      Macromol.Symp. 220

      ページ: 75-84

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Chemical rescue of a site-specific mutant of bacterial copper amine oxidase for generation of the topa quinone cofactor.2004

    • 著者名/発表者名
      H.Matsunami
    • 雑誌名

      Biochemistry 43・8

      ページ: 2178-2187

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Thermal Behavior and Molecular Interaction of Poly(3-hydroxybuty-rate-co-3-hydroxyhexanoate) Studied by Wide-Angle X-ray Diffraction2004

    • 著者名/発表者名
      H.Sato
    • 雑誌名

      Macromolecules 37・10

      ページ: 3763-3769

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Chemical rescue of a site-specific mutant of bacterial copper amine oxidase for generation of the topa quinone cofactor.2004

    • 著者名/発表者名
      H.Matsunami
    • 雑誌名

      Biochemistry. 43-8

      ページ: 2178-2187

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Thermal Behavior and Molecular Interaction of Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) Studied by Wide-Angle X-ray Diffraction.2004

    • 著者名/発表者名
      H.Sato
    • 雑誌名

      Macromolecules 37-10

      ページ: 3763-3769

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Thermal Behavior and Molecular Interaction of Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) Studied by Wide-Angle X-ray Diffraction2004

    • 著者名/発表者名
      Sato H, Nakamura M, Padermshoke A., Yamaguchi H, Ozaki Y. et al.
    • 雑誌名

      Macromolecules 37

      ページ: 3763-3769

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Chemical rescue of a site-specific mutant of bacterial copper amine oxidase for generation of the topa quinone cofactor.2004

    • 著者名/発表者名
      Matsunami H, Okajima T, Yamaguchi H, Kuroda S, Tanizawa K et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 43(8)

      ページ: 2178-2187

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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