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非共鳴ラマン分光法によるタンパク質全体の構造変化の追跡

研究課題

研究課題/領域番号 16570131
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関東北大学

研究代表者

海野 雅司  東北大学, 多元物質科学研究所, 助手 (50255428)

研究分担者 山内 清語  東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 (10127152)
徳永 史生  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80025452)
徳富 哲  大阪府立大学, 大学院・理学研究科, 教授 (90142009)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2005年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2004年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワードラマン分光法 / 振動分光法 / 光受容タンパク質 / 密度汎関数理論 / 信号伝達 / 密度汎関数法
研究概要

タンパク質が機能する上で重要な動的構造を解析する研究手段にラマン分光法がある。ラマン分光法によるタンパク質研究のほとんどは励起光の波長と分子の吸収波長が一致するとラマン信号が増大する共鳴効果を用い、発色団など特定部位の振動スペクトルを測定している。しかし共鳴効果は吸収帯が200nm以下の鎖状アミノ酸残基には応用できず、タンパク質全体の構造解析には限界がある。また蛍光を発する試料の場合、しばしば蛍光によって微弱なラマン信号の観測が妨げられるという問題もある。そこで本研究では光受容タンパク質を題材に非共鳴ラマン分光を中心にした研究から機能発現に伴うタンパク質全体の構造変化の追跡を試み、以下の成果を得た。
1.フラビンを発色団として有する新規青色光受容タンパク質、BLUFタンパク、について、アミノ酸残基を一部改変した変異タンパク質についてラマンスペクトルの測定を行った。また結晶構造を基に密度汎関数理論に基づいた基準振動解析を行った。これらの結果から暗状態ならびにシグナル状態について活性部位の構造を明らかにすることができた。
2.紅色光合成細菌由来の青色光受容タンパク質であるイエロープロテインについて、同位体ラベルした発色団を再構成した試料について共鳴および非共鳴のラマンスペクトルを測定した。更に密度汎関数理論に基づいた基準振動解析を行い、主なラマンバンドの帰属に成功した。
3.BLUFタンパク質と同様にフラビンを発色団として有する青色光受容タンパク質であるフォトトロピンについて、暗状態とシグナル状態のラマンスペクトルの測定を行った。フォトトロピンはBLUFタンパク質とは異なり、発色団の大きな構造変化が観測された。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2007 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (8件)

  • [雑誌論文] Vibrational Assignment of the 4-Hydroxycinnamyl Chromophore in Photoactive Yellow Protein2007

    • 著者名/発表者名
      M.Unno et al.
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 110(印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Orientation of a Key Glutamine Residue in the BLUF Domain from AppA Revealed by Mutagenesis, Spectroscopy, and Quantum Chemical Calculations2006

    • 著者名/発表者名
      M.Unno et al.
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society 128

      ページ: 5638-5639

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Light-Induced Structural Changes in the Active Site of the BLUF Domain in AppA by Raman Spectroscopy2005

    • 著者名/発表者名
      M.Unno et al.
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 109

      ページ: 12620-12626

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Time and Frequency Domain Investigations on Ultra fast Photoisomerization Reaction Dynamics of Photoactive Yellow Protein2005

    • 著者名/発表者名
      H.Chosrowjan et al.
    • 雑誌名

      Ultra Fast Phenomena XIV 79

      ページ: 604-606

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dual Raman Features of Double Coaxial Carbon Nanotubes with N-Doped and B-Doped Multiwalls2005

    • 著者名/発表者名
      Q.-H.Yang et al.
    • 雑誌名

      Nano Letter 5

      ページ: 2465-2469

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural Changes during the Photocycle of Photoactive Yellow Protein Monitored by Ultraviolet Resonance Raman Spectra of Tyrosine and Tryptophan2005

    • 著者名/発表者名
      S.El-Mashtoly et al.
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 109

      ページ: 23666-23673

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Resonance Raman Evidence for Two Conformations Involved in the L Intermediate of Photoactive Yellow Protein2004

    • 著者名/発表者名
      M.Unno et al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 279

      ページ: 23855-23858

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Vibrational Assignment of the 4-Hydroxycinnamyl Chromophore in Photoactive Yellow Protein

    • 著者名/発表者名
      M.Unno et al.
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 110, (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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