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含硫有機化合物の代謝に関与する酵素について-蛋白質工学的改変と新規機能の検索-

研究課題

研究課題/領域番号 16580058
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関鳥取大学

研究代表者

大城 隆  鳥取大学, 工学部, 講師 (00233106)

研究分担者 和泉 好計  鳥取大学, 工学部, 教授 (40026555)
研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
2006年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2005年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2004年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
キーワードMicrobial desulfurization / Desulfinase / Flavin reductase / Indigo / Dibenzothiophene / Monooxygenase / dibenzothiophene / desulfinase / flavin reductase
研究概要

常温性脱硫細菌であるRhodococcus erythropolis由来の脱硫酵素2'-ヒドロキシビフェニル2-スルフィン酸デスルフィナーゼ(DszB)の立体構造および、基質2-ヒドロキシビフェニル2-スルフィン酸(HBPSi)との酵素-基質複合体の立体構造を明らかにした。これはジベンゾチオフェン脱硫に関与する酵素としては、初めての高次構造を解析した成果である。本酵素は、基質であるHBPSiを取り込むことにより、構造が変化し、酵素タンパク質の表面に位置していたHis60が活性部位近傍へと移動し、Cys27、Arg70とともに活性中心を形成することが明らかになった。今回明らかにした立体構造を基に、変異酵素DszB(Q65H)をコードする遺伝子を構築し、その特性を検討したところ、至適反応温度および熱安定性が大幅に上昇していることが判明した。
Bacillus subtilis WU-S2Bは、50℃でも生育可能な好熱性脱硫細菌である。本菌株由来のジベンゾチオフェン(DBT)代謝に関与する酵素、BdsC、BdsA、BdsBをそれぞれ単一にまで精製し、大腸菌での高発現株を作成し、その酵素化学的諸性質を明らかにした。
精製したBdsCを用い、インドールあるいは他のヘテロ環芳香族化合物に対する活性を評価したところ、いくつかの化合物の変換活性を確認することができた。これらの結果は、BdsCがDBT骨格を有していない芳香族化合物への酸素添加反応を触媒できることを示しており、脱硫酵素の新規機能を見い出すことができたと考えている。
高温域での微生物脱硫の実施を目的として、好熱性のBacillus sp.DSM411からフラビンレダクターゼ(FR)の精製を行い、単一な標品を得て、酵素化学的性質を明らかにした。野生株における本酵素の発現量は非常に低かったが、酵素遺伝子のクローニングを実施して、大腸菌内での高発現化を行ったところ、野生株に比べて440倍高い生産性の向上を実現することができた。また、本酵素と脱硫酵素DszCのカップリング反応がスムースに進行することを酵素レベルで確認した。

報告書

(4件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (16件)

  • [雑誌論文] Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase2006

    • 著者名/発表者名
      W.C.Lee, T.Ohshiro, T.Matsubara, Y.Izumi, M.Tanokura
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 281

      ページ: 32534-32539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase2006

    • 著者名/発表者名
      W.C.Lee, T.Ohshiro, T.Matsubara, Y.Izumi, M.Tanokura
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 281

      ページ: 32534-32539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybipheny1-2-sulfinic acid desulfinase2006

    • 著者名/発表者名
      W.C.Lee, T.Ohshiro, T.Matsubara, Y.Izumi, M.Tanokura
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 281

      ページ: 32534-32539

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Dibenzothiophene desulfurizing enzymes from moderately thermophilic bacterium Bacillus subtilis WU-S2B : Purification, characterization and overexpression2005

    • 著者名/発表者名
      T.Ohshiro, Y.Ishii, T.Matsubara, K.Ueda, Y.Izumi, K.Kino, K.Kirimura
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng. 100

      ページ: 266-273

    • NAID

      210000130368

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Reaction of serine-glyoxylate aminotransferase with the alternative substrate ketomalonate indicates rate-limiting protonation of a quinonoid intermediate2005

    • 著者名/発表者名
      W.E.Karsten, T.Ohshiro, Y.Izumi, P.F.Cook
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 15930-15936

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Enhancing effect of calcium and vanadium ions on thermal stability of bromoperoxidase from Corallina pilulifera2005

    • 著者名/発表者名
      E.Garcia-Rodriguez, T.Ohshiro, T.Aibara, Y.Izumi, J.Littlechild
    • 雑誌名

      J. Biol. Inorg. Chem. 10

      ページ: 275-282

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dibenzothiophene desulfurizing enzymes from moderately thermophilic bacterium Bacillus subtilis WU-S2B : Purification, characterization and overexpression2005

    • 著者名/発表者名
      T.Ohshiro, Y.Ishii, T.Matsubara, K.Ueda, Y.Izumi, K.Kino, K.Kirimura
    • 雑誌名

      J.Biosci.Bioeng. 100

      ページ: 266-273

    • NAID

      210000130368

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要 2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Enhancing effect of calcium and vanadium ions on thermal stability of bromoperoxidase from Corallina pilulifera2005

    • 著者名/発表者名
      E.Garcia-Rodriguez, T.Ohshiro, T.Aibara, Y.Izumi, J.Littlechild
    • 雑誌名

      J.Biol.Inorg.Chem. 10

      ページ: 275-282

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Enhancing effect of calcium and vanadium ions on thermal stability of bromoperoxidase from Corallina pilulifera2005

    • 著者名/発表者名
      E.Garcia-Rodriguez, T.Ohshiro, T.Aibara, Y.Izumi, J.Littlechild
    • 雑誌名

      J.Biol.Inorg.Chem., 10

      ページ: 275-282

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analyses of desulfurization enzyme DszB and its C27S mutant complexed with biphenyl-2-sulfinic acid2004

    • 著者名/発表者名
      W.C.Lee, T.Ohshiro, T.Matsubara, Y.Izumi, M.Tanokura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D D60

      ページ: 1636-1638

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Thermostable flavin reductase that couples with dibenzothiophene monooxygenase, from thermophilic Bacillus sp. DSM411 : Purification, characterization, and gene cloning2004

    • 著者名/発表者名
      T.Ohshiro, H.Yamada, T.Shimoda, T.Matsubara, Y.Izumi
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 68

      ページ: 1712-1721

    • NAID

      10013520851

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analyses of desulfurization enzyme DszB and its C27S mutant complexed with biphenyl-2-sulfinic acid2004

    • 著者名/発表者名
      W.C.Lee, T.Ohshiro, T.Matsubara, Y.Izumi, M.Tanokura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D 60

      ページ: 1636-1638

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Thermostable flavin reductase that couples with dibenzothiophene monooxygenase, from thermophilic Bacillus sp. DSM411 : Purification, characterization, and gene cloning2004

    • 著者名/発表者名
      T.Ohshiro, H.Yamada, T.Shimoda, T.Matsubara, Y.Izumi
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 68

      ページ: 1712-1721

    • NAID

      10013520851

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analyses of desulfurization enzyme Dsz B and its C27S mutant complexed with biphenyl-2-sulfinic acid2004

    • 著者名/発表者名
      W.C.Lee., T.Ohshiro, T.Matsubara, Y.Izumi., M.Tanokura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D 1636-1638 D60

      ページ: 1636-1638

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Thermostable flavin reductase that couples with dibenzothiophene monooxygenase, from thermophilic Bacillus sp.DSM411 : Purification characterization, and gene cloning2004

    • 著者名/発表者名
      T.Ohshiro, H.Yamada, T.Shimoda, T.Matsubara, Y.Izumi
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 68

      ページ: 1712-1721

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Modification of halogen specificity of a vanadium-dependent brom operoxidase2004

    • 著者名/発表者名
      T.Ohshiro, J.Littlechild, E.Garcia-Rodriguez, M.N.Isupov, Y.Iida, T.Kobayashi, Y.Izumi
    • 雑誌名

      Protein Science 13

      ページ: 1566-1571

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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