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細菌のキチン分解系に関与する遺伝子の発現調節機構

研究課題

研究課題/領域番号 16580066
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関大阪薬科大学

研究代表者

辻坊 裕  大阪薬科大学, 薬学部, 教授 (90175464)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2005年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2004年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワード海洋細菌 / 放線菌 / キチン / キチン分解 / キチナーゼ / 遺伝子発現
研究概要

我々は、海洋細菌Alteromonas sp.O-7株および好熱性放線菌Streptomyces thermoviolaceus OPC-520株のキチン分解系に関与する遺伝子の発現調節機構を明らかにする目的で研究を行っている。特異的塩基配列を含むキチナーゼA遺伝子の上流域のDNA断片をプローブとするゲルシフトアッセイを用い、Alteromonas sp.O-7株の細胞内タンパク質を各種クロマトグラフィーにより分画したところ、複数のタンパク質がプローブを認識することを認めた。これらのうち、細菌のシグナル伝達系であるレスポンスレギュレーターArcAがキチン分解系に関与する遺伝子の発現調節機構に関与するタンパク質として同定された。そこで、センサータンパク質であるArcB遺伝子およびArcA遺伝子のクローニングを行うとともに、大腸菌による発現系を構築した。リン酸化ArcAは、キチン分解系に関与する複数のキチナーゼ、プロテアーゼ遺伝子の特異的塩基配列を認識することをフットプリンティング法により確認した。さらに、キチンの構成糖であるN-アセチルグルコサミンおよび関連糖によりArcBからArcAへのリン酸転移が促進されることを認めた。したがって、ArcA、ArcBは糖代謝系に関与し、N-アセチルグルコサミン過剰供給下において、キチン分解系に関与する遺伝子の発現を負に制御しているものと思われる。現在、ゲルシフトアッセイで陽性の結果を示した分画を2次元電気泳動により分離後、トリプシン消化を行いMALDI-TOF/MSおよびMASCOTを用いて、網羅的にタンパク質の同定および機能解析を行っているところである。一方、S.thermoviolaceus OPC-520株においても、Alteromonas sp.O-7株と同様の方法により特異的塩基配列を認識するタンパク質の特定を進めている。現在、N-アセチルグルコサミンおよびキトビオースの輸送系であるABCトランスポーター遺伝子の上流域に転写調節タンパク質をコードする遺伝子が存在することを認めている。今後、この遺伝子の発現系を大腸菌で構築し、ゲルシフトアッセイおよびフットプリンティング法を用いて特異的塩基配列を認識するか否かを確認する予定である。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2005

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] Roles of four chitinases (ChiA, ChiB, ChiC, and ChiD) in the chitin degradation system of marine bacterium Alteromonas sp. strain 0-7.2005

    • 著者名/発表者名
      辻坊 裕
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology 71・4

      ページ: 1811-1815

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Role of the N-terminal polycystic kidney disease domain in chitin degradation by chitinase A from a marine bacterium, Alteromonas sp. strain 0-7.2005

    • 著者名/発表者名
      辻坊 裕
    • 雑誌名

      Journal of Applied Microbiology 99・3

      ページ: 551-557

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Roles of four chitinases (chiA, chiB, chiC, and chiD) in the chitin degradation system of marine bacterium Alteromonas sp. strain O-7.2005

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Tsujibo, et al.
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology 71(4)

      ページ: 1811-1815

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Role of the N-terminal polycystic kidney disease domain in chitin degradation by chitinase A from a marine bacterium, Alteromonas sp. strain O-7.2005

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Tsujibo, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Applied Microbiology 99(3)

      ページ: 551-557

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Roles of four chitinases (ChiA, ChiB, ChiC, and ChiD) in the chitin degradation system of marine bacterium Alteromonas sp. strain 0-7.2005

    • 著者名/発表者名
      辻坊 裕
    • 雑誌名

      Applied and Environmental microbiology 71・4

      ページ: 1811-1815

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Roles of four chitinases (ChiA, ChiB, ChiC, and ChiD) in the chitin degradation system of marine bacterium Alteromonas sp.strain O-7.2005

    • 著者名/発表者名
      辻坊 裕
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology 71・4

      ページ: 1811-1815

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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