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タンパク質のコンホメーション変化を指標にするプロテオーム解析

研究課題

研究課題/領域番号 16590033
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理系薬学
研究機関城西大学

研究代表者

白幡 晶  城西大学, 薬学部, 教授 (50150107)

研究分担者 杉田 義昭 (杉田 義明)  城西大学, 薬学部, 講師 (20255029)
池口 文彦  城西大学, 薬学部, 助教授 (00364711)
高尾 浩一  城西大学, 薬学部, 助手 (70337484)
研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2006年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2005年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2004年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワードコンホメーション変化 / 蛍光SH基標識試薬 / C末端標識法 / MALDI-TOF MS / PSD / ポリアミン / グアニジン / 蛍光検出HPLC / アミノ酸配列分析
研究概要

本研究ではまず、モデルタンパク質を用いて、化学試薬の標識量の変化を指標にして、MALDI-TOF MSにおいて低分子結合に基づくタンパク質のコンホメーション変化の検出が可能であることが分かった。次に、蛍光SH基標識を合成し、蛍光強度の変化による評価によりタンパク質のコンポメーション変化解析を可能とした。続いて、その蛍光標識タンパク質を酵素消化後、蛍光検出逆相HPLCピーク画分をMALDI-TOF MS及びMALDI-PSD TOF MSにて分析したところ、蛍光標識システインを含めたペプチドのアミノ酸配列解析ができることがわかった。そして、タンパク質のコンホメーション変化の網羅的解析の基礎検討実験として、コンホメーションの異なる同一のタンパク質を分子量の異なる2種類のSH基蛍光標識試薬によりそれぞれ蛍光標識し、酵素消化後、蛍光検出逆相HPLCに供し、そのピーク画分をMALDI-TOF MSにより解析した。その結果、シグナル強度の相対比較を指標に用いることにより、コンホメーション変化の評価系を開発した。
一方、タンパク質のシステイン残基のN残基で切断する試薬により、タンパク質の構造解析に極めて有用になる切断に伴うC末端の標識法を開発した。本標識法では、種々の電荷の異なるアルキルアミンによる標識に応用できることを見出し、かつタンパク質の構造解析に有用であることを示したのみならず、更に比較定量法への応用にも拡げることができた。
また、先述のポリアミン修飾ペプチドを化学的に作製する一方で、プロテアーゼ消化によって断片化されたペプチドがポリアミンにより修飾されることを見出した。これは、食事中に含まれるタンパク質は、消化され吸収される際、食品中に大量に存在するポリアミンが消化や吸収過程に何らかの影響を与える可能性を示唆することを示した。

報告書

(4件)
  • 2006 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2007 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (22件)

  • [雑誌論文] Formation of polyamine-modified peptides during protein digestion.2007

    • 著者名/発表者名
      Ito, T.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 356

      ページ: 159-162

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synergistic apoptosis of MCF-7 breast cancer cells by 2-methoxyestradiol and bis(ethyl)norspermine2007

    • 著者名/発表者名
      Nair, S. K.
    • 雑誌名

      Cancer Lett. 250

      ページ: 311-322

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Formation of polyamine-modified peptides during protein digestion2007

    • 著者名/発表者名
      Ito, T.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 356

      ページ: 159-62

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synergistic apoptosis of MCF-7 breast cancer cells by 2-methoxyestradiol and bis(ethyl)norspermine2007

    • 著者名/発表者名
      Nair, S.K.
    • 雑誌名

      Cancer Lett. 250

      ページ: 311-22

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bending of the estrogen response element by polyamines and estrogen receptors alpha and beta : a fluorescence resonance energy transfer study2006

    • 著者名/発表者名
      Vijayanathan, V.
    • 雑誌名

      Int. J. Biochem. Cell Biol. 38

      ページ: 1191-1206

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Aminopropyltransferases : function, structure and genetics2006

    • 著者名/発表者名
      Ikeguchi, Y.
    • 雑誌名

      J. Biochem. 139

      ページ: 1-9

    • NAID

      10018848033

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Inhibition of putrescine aminopropyltransferase influences rat liver regeneration2006

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, M.
    • 雑誌名

      Biol Pharm Bull. 29

      ページ: 863-867

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Induction of apoptotic cell death by putrescine2006

    • 著者名/発表者名
      Takao, K.
    • 雑誌名

      Int. J. Biochem. Cell Biol. 38

      ページ: 621-628

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bending of the estrogen response element by polyamines and estrogen receptors alpha and beta : a fluorescence resonance energy the usfer study2006

    • 著者名/発表者名
      V.Vijayanathan et al.
    • 雑誌名

      Int. J. Biochem. Cell Biol. 38

      ページ: 1191-1206

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Bis(ethyl)norspermine potentiates the apoptotic activity of the pure antiestrogen ICI 182780 in breast cancer cells2005

    • 著者名/発表者名
      Balabhadrapathruni, S.
    • 雑誌名

      Oncol. Rep. 13

      ページ: 101-108

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Independent roles of eIF5A and polyamines in cell proliferation2005

    • 著者名/発表者名
      Nishimura, K.
    • 雑誌名

      Biochem. J. 385

      ページ: 779-785

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Antisense recognition of the HER-2 mRNA : effects of phosphorothioate substitution and polyamines on DNA. RNA, RNA. RNA, and DNA. DNA duplex stability2005

    • 著者名/発表者名
      Venkiteswaran, S.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 303-312

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Control of spermidine and spermine levels in rat tissues by trans-4-methylcyclohexylamine, a spermidine-synthase inhibitor2005

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, M.
    • 雑誌名

      Biol. Pharm. Bull. 28

      ページ: 569-573

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Ionic, structural, and temperature effects on DNA nanoparticles formed by natural and synthetic polyamines2005

    • 著者名/発表者名
      Vijayanathan, V.
    • 雑誌名

      Biomacromolecules 6

      ページ: 1097-1103

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Antisense recognition of the HER-2 mRNA : effects of phosphorothioate substitution and polyamines on DNA.RNA, RNA.RNA, and DNA.DNA duplex stability2005

    • 著者名/発表者名
      Venkiteswaran, S.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 303-12

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Ionic, structural, and temperature effects on DNA nanoparticles formed by natural and synthetic polyamines2005

    • 著者名/発表者名
      Vijayanathan, V.
    • 雑誌名

      Biomacromolecules. 6

      ページ: 1097-1103

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural and functional relationship among diamines in terms of inhibition of cell growth2004

    • 著者名/発表者名
      Higashi, K.
    • 雑誌名

      J. Biochem. 136

      ページ: 533-539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mammalian spermidine synthase-identification of cysteine residues and investigation of the putrescine binding site-2004

    • 著者名/発表者名
      Goda, H.
    • 雑誌名

      Biol. Pharm. Bull. 27

      ページ: 1327-1332

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Spermine synthesis is required for normal viability, growth, and fertility in the mouse2004

    • 著者名/発表者名
      Wang, X.
    • 雑誌名

      J Biol Chem. 279

      ページ: 51370-51375

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of transgenic mice with widespread overexpression of spermine synthase2004

    • 著者名/発表者名
      Ikeguchi, Y.
    • 雑誌名

      Biochem J. 381

      ページ: 701-707

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mammalian spermidine synthase-identification of cysteine residues and investigation of the putrescine binding site--2004

    • 著者名/発表者名
      Goda, H.
    • 雑誌名

      Biol. Pharm. Bull. 27

      ページ: 1327-32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2006 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synergistic apoptosis of MCF-7 breast cancer cells by 2-methoxyestradiol and bis(ethyl) norspermme

    • 著者名/発表者名
      S.K.Nair et al.
    • 雑誌名

      Cancer Lett. (in press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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