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変異ヒトγδ型T細胞受容体の立体構造解析による非ペプチド性抗原認識機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 16590402
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 免疫学
研究機関京都大学

研究代表者

田中 義正  京都大学, 生命科学研究科, 助手 (90280700)

研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2005年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2004年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードγδ型T細胞 / T細胞受容体 / 結晶化 / リフォールディング / クローニング / 精製 / X線 / 発現 / 大腸菌 / カラムクロマトグラフィー / 分子動力学 / 分子篩 / 非ペプチド性抗原 / ピロリン酸モノエステル / アルキルアミン / 結核菌 / 病原性大腸菌 / マラリア
研究概要

本研究課題においては、ヒトγδ型T細胞受容体の細胞外領域をそれぞれ大腸菌で発現させ、リフォールディング後、結晶化し、その構造を2.2Åの解像度で決定した。具体的には、まず、γ鎖およびδ鎖の細胞外領域をそれぞれクローニングし、T7プロモーターを有する発現ベクターに組み入れた。原配列のままでは全く発現が見られなかったため、分子動力学的手法を用いてステムループの除去を行った。さらに、大腸菌コドンインデックスが0.65以上になるようにコドン置換を行い、また、プリファレンスインデックスにより大腸菌型コドン置換も行った。このようにして、γ鎖およびδ鎖を大腸菌1リットル培養で100mg以上の収率で発現させることが可能になった。ここで得られた封入体をグアニジン溶液に溶解し、DTT処理後、アルギニンベースの緩衝液に迅速希釈してリフォールディングを行った。透析後、タンパクの精製を行ったが、その際、pIから判断してpHを5.5に調製し陽イオン交換カラムクロマトグラフィーに供した。さらに、分子篩により最終的な精製を行い、結晶化用タンパク標品とした。結晶化のスクリーニングは、市販のキットと当研究室で作製したキットを用いて行った。その結果、PEG4000ベースの緩衝液でタンパク質が結晶化することが明らかになった。この結晶をインハウスのX線発生装置で解析した結果、3Å程度の回折点が得られたため、SPring8で高解像度のデータを採取した。データ解析はワークステーションで行い、次のような統計値を得た。空間群:P21、格子:60.82、77.35、100.12、90.00、95.00、90.00、回折点:314,713、独立回折点:65,401、解像度:1.90、完全性:91.4、重複性:4.8、リファインメント:15-1.90。以上のようにヒトγδ型T細胞受容体の構造を高解像度で決定することができた。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (23件)

  • [雑誌論文] Involvement of CD166 in the activation of human γδ T cells by tumor cells sensitized with nonpeptide antigens2006

    • 著者名/発表者名
      Yu Kato, et al.
    • 雑誌名

      The Journal of Immunology (In press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human γδ T cells and tumor immunity2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Tanaka
    • 雑誌名

      Journal of Clinical and Experimental Hematopathology 46

      ページ: 11-23

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Negative regulation of activation-induced cytidine deaminase in B cells2006

    • 著者名/発表者名
      Taro Muto, et al.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 130

      ページ: 2752-2757

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure and some properties of a major house dust mite allergen, Derf22006

    • 著者名/発表者名
      Masashi Suzuki, et al.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications 339

      ページ: 679-686

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Involvement of CD166 in the activation of human γδ T cells by tumor cells sensitized with nonpeptide antigens2006

    • 著者名/発表者名
      Yu Kato, Yoshimasa Tanaka, Mikihito Hayashi, Katsuya Okawa, Nagahiro Minato
    • 雑誌名

      J.Immunol. (In press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human γδ T cells and tumor immunotherapy2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Tanaka
    • 雑誌名

      J.Clin.Exp.Hematopathol. 46

      ページ: 11-23

    • NAID

      10018113675

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Negative regulation of activation-induced cytidine deaminase in B cells2006

    • 著者名/発表者名
      Taro Muto, II-mi Okazaki, Shuichi Yamada, Toshimasa Tanaka, Kazuo Kinoshita, Masamichi Muramatsu, Hitoshi Nagaoka, Tasuku Honjo
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acd Sci.U.S.A. 130

      ページ: 2752-2757

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure and some properties of a major house dust allergen, Derf 22006

    • 著者名/発表者名
      Masashi Suzuki, Yoshimasa Tanaka, Seigo Korematsu, Bunzo Mikami, Nagahiro Minato
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 339

      ページ: 679-686

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Human gd T cells and tumor immunotherapy2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Tanaka, et al.
    • 雑誌名

      J.Clin.Exp.Hematopathol. (In press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Negative regulation of activation-induced cytidine deaminase in B cells2006

    • 著者名/発表者名
      Taro Muto, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acd.Sci.U.S.A. 130

      ページ: 2752-2757

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure and some properties of a major house dust allergen, Derf 22006

    • 著者名/発表者名
      Masashi Suzuki, et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 339

      ページ: 679-686

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Recognition and function of human γδ T cells : Application for tumor immunotherapy2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Tanaka, et al.
    • 雑誌名

      Current Immunology Reviews 1

      ページ: 275-285

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Enhanced expression of programmed death-1 (PD-1)/PD-L1 in salivary glands of patients with Sjogren's syndrome2005

    • 著者名/発表者名
      Masaya Kobayashi, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Rheumatology 32

      ページ: 2156-2163

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of mechanism for human γδ T cell recognition of nonpeptide antigens2005

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamashita, et al.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications 334

      ページ: 349-360

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recognition and function of human γδ T cells : Application for tumor immunotherapy2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Tanaka, Yu Kato, Shoichi Kita, Nagahiro Minato
    • 雑誌名

      Cur.Immunol.Rev. 1

      ページ: 275-285

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Enhanced expression of programmed death-1(PD-1)/PD-L1 in salivary glands of patients with Sjogren's syndrome2005

    • 著者名/発表者名
      Masaya Kobayashi, Seiji Kawano, Saori Hatachi, Chiyo Kurimoto, Taku Okazaki, Yoshiko Iwai, Tasuku Honjo, Yoshimasa Tanaka, Nagahiro Minato, Takahide Komori, Saken Maeda, Shunichi Kumagai
    • 雑誌名

      J.Rheumatol. 32

      ページ: 2156-2163

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of mechanism for human γδ T cell recognition of nonpeptide antigens2005

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamashita, Yoshimasa Tanaka, Shunichi Tsutsumi, Hiroyuki Aburatani, Nagahiro Minato, Sigeo Ihara
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 334

      ページ: 349-360

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recognition and function of human gd T cells : Application for tumor immunotherapy2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshimasa Tanaka
    • 雑誌名

      Cur.Immunol.Rev. 1

      ページ: 275-285

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Enhanced expression of programmed death-1 (PD-1)/PD-L1 in salivary glands of patients with Sjogren's syndrome2005

    • 著者名/発表者名
      Masaya Kobayashi, et al.
    • 雑誌名

      J.Rheumatol. 32

      ページ: 2156-2163

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of mechanism for human gd T cell recognition of nonpeptide antigens2005

    • 著者名/発表者名
      Seiji Yamashita, et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 334

      ページ: 349-360

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] ヒトγδ型T細胞と抗腫瘍免疫2005

    • 著者名/発表者名
      田中義正
    • 雑誌名

      臨床免疫 43巻・2号

      ページ: 181-188

    • NAID

      10013117895

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Analyses of peripheral blood mononuclear cells in operational tolerance after pediatric living donor liver transplantation2004

    • 著者名/発表者名
      Ying Li, et al.
    • 雑誌名

      American Journal of Transplantation 4

      ページ: 2118-2125

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] ヒトγδ型T細胞の役割2004

    • 著者名/発表者名
      田中義正
    • 雑誌名

      BIO Clinica 19巻・5号

      ページ: 59-64

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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