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p53遺伝子多型解析による動物種の分子系統進化に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 16590543
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 法医学
研究機関旭川医科大学

研究代表者

安積 順一  旭川医科大学, 医学部, 助教授 (00045551)

研究分担者 浅利 優  旭川医科大学, 医学部, 助手 (40360979)
松本 博志  札幌医科大学, 医学部, 教授 (60263092)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2005年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2004年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワードp53遺伝子 / DNA多型 / 動物種の識別 / 分子系統進化 / 霊長類 / イントロン7 / 動物種の鑑別 / 民族特異性 / アリル頻度 / 連鎖不平衡
研究概要

1)p53遺伝子解析によるヒトと非ヒト霊長類の識別および進化、分岐:p53遺伝子第5エクソン、第5イントロンおよび第6エクソンの378bpの塩基配列を決定し、ヒトと15種類のサル類の塩基配列およびアミノ酸配列とを比較した。チンパンジー、ピグミーチンパンジーにおいて第5エクソンの81番目(G→A)と84番目(C→T)の2ヵ所に塩基置換があり、ゴリラでは第5エクソンの10番目(G→A)と114番目(C→T)の2ヵ所に塩基置換がありコドン129にアミノ酸置換(Ala→Thr)があった。上記の3種類を除く12種類のサル類においても塩基置換が6ヵ所から63ヵ所あり、ヒトとの鑑別は可能であった。今回決定したヒトとサル類におけるp53遺伝子の塩基配列の相同性を比較したところ、ヒトと類人猿の平均相同性は約98.8%であった。ヒトと旧世界ザルでは平均約96.4%、新世界ザルでは平均約94.1%、原猿類では平均約86.2%の相同性を示した。平均距離法(UPGMA)で分子系統樹を作成して、霊長類16種類の系統関係を解析したところ、従来の分類とは矛盾しなかった。
2)p53遺伝子イントロン7の多型と霊長類の進化:ヒトp53遺伝子14181番目とその20bp下流の14201番目に相等する第7イントロンの72番目(C→T)と92番目(T→G)の塩基に多型が認められた。72番目でC/Tは92番目でT/Gであり、C/CはT/T、T/TはG/Gであった。この事から72番目と92番目は完全連鎖不平衡の状態にあり、ハプロタイプはC-T;T-Gであった。その頻度はC-Tホモが57.14%、T-Gホモが7.62%、C-T/T-Gヘテロが35.24%であり、アリルの頻度はC-T:0.744、T-G:0.245であった。ヒトに多型が認められる第7イントロンの72番目の塩基は6種類の類人猿はすべてにおいてC/Cホモであり、また92番目はT/Tホモであった。この事からヒトでみつかったC→TおよびT→Gの塩基置換は、類人猿からヒトに進化、分岐した後に起こったものと考えられる。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (12件)

  • [雑誌論文] ヒトp53遺伝子解析による法医試料からの動物種の鑑別2006

    • 著者名/発表者名
      浅利優, 安積順一, 清水恵子, 塩野寛
    • 雑誌名

      DNA多型 14

      ページ: 241-244

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Species identification from forensic specimen using p53 gene analysis.2006

    • 著者名/発表者名
      Azumi, J., Asari, M., Shimizu, K., Shiono, H.
    • 雑誌名

      DNA Polymorphism 14

      ページ: 241-244

    • NAID

      10017571785

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ヒトp53遺伝子プライマーを用いた動物種の鑑別2005

    • 著者名/発表者名
      安積順一, 浅利優, 塩野寛
    • 雑誌名

      DNA多型 13

      ページ: 201-203

    • NAID

      10015685569

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] AmpF/STR Identifiler Kitを用いた炭化およびミイラ化した死体からの個人識別の2例2005

    • 著者名/発表者名
      浅利優, 安積順一, 清水恵子, 塩野寛
    • 雑誌名

      犯罪学雑誌 71・4

      ページ: 111-114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ABOトランスポーターABCG2/BCRPの遺伝子多型解析2005

    • 著者名/発表者名
      浅利優, 安積順一, 塩野寛, 松原和夫
    • 雑誌名

      DNA多型 13

      ページ: 232-235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Species identification using human p53 gene primer.2005

    • 著者名/発表者名
      Azumi, J., Asari, M., Shiono, H.
    • 雑誌名

      DNA Polymorphism 13

      ページ: 201-203

    • NAID

      10015685569

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Two paternity tests from a severely burned and a mummified corpse using AmpFlSTR identifiler kit.2005

    • 著者名/発表者名
      Asari, M., Azumi, J., Shimizu, K., Shiono, H.
    • 雑誌名

      Acta Crim.Japon 71(4)

      ページ: 111-114

    • NAID

      40006892959

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variation in ABC transporter ABCG2/BCRP.2005

    • 著者名/発表者名
      Asari, M., Azumi, J., Shimizu, K., Shiono, H.
    • 雑誌名

      DNA Polymorphism 13

      ページ: 232-235

    • NAID

      10015685633

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ヒトp53遺伝子プライマーを用いた動物種の鑑別2005

    • 著者名/発表者名
      安積順一, 浅利優, 塩野寛
    • 雑誌名

      DNA多型 13(印刷中)

    • NAID

      10015685569

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] ABCトランスポーターABCG2/BCRPの遺伝子多型解析2005

    • 著者名/発表者名
      浅利優, 安積順一, 松原和夫, 塩野寛
    • 雑誌名

      DNA多型 13(印刷中)

    • NAID

      10015685633

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 日本人集団におけるp53遺伝子のDNA多型解析-第7イントロンの多型性-2004

    • 著者名/発表者名
      安積順一, 魏慧玲, 藤井裕人, 松本博志, 玉木敬二
    • 雑誌名

      DNA多型 12

      ページ: 111-113

    • NAID

      10013660864

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of DNA polymorphism of p53 gene in the Japanese population.2004

    • 著者名/発表者名
      Azumi, J., Gi, E., Fujii, H., Matsumoto, H., Tamaki, K.
    • 雑誌名

      DNA Polymorphism 12

      ページ: 111-113

    • NAID

      10013660864

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要

URL: 

公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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