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人工呼吸誘発多臓器不全メカニズムの遺伝子発現解析とシステム論的解明

研究課題

研究課題/領域番号 16650112
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 医用生体工学・生体材料学
研究機関北里大学

研究代表者

野城 真理  北里大学, 医療衛生学部, 教授 (80014231)

研究分担者 小林 弘祐  北里大学, 医療衛生学部, 教授 (70153632)
原田 芳照  北里大学, 医療衛生学部, 教授 (20050677)
佐藤 雄一  北里大学, 医療衛生学部, 助教授 (30178793)
根武谷 吾  北里大学, 医療衛生学部, 講師 (00276180)
福岡 豊  東京医科歯科大学, 大学院・疾患生命科学研究部, 助教授 (30242217)
氏平 政伸  北里大学, 医療衛生学部, 講師 (70286392)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2005年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2004年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワード人工呼吸 / VALI / 伸展刺激 / 肺動脈内皮細胞 / 網羅的遺伝子発現解析 / IL-8 / 肺損傷 / アポトーシス / サイトカイン / 二酸化炭素 / pH
研究概要

正常ヒト肺動脈内皮細胞(normal human pulmonary endothelial cells:HPAEC)を培養細胞伸縮装置(Flexercell, Tension Plus System : FX-4000T)によって24時間伸展し、伸展しない細胞を対照として用いて、網羅的遺伝子発現解析を行った。同解析にはAffymetrix社製のDNAマイクロアレイ(GeneChip, Human Genome Focus Array)および、解析システムGeneChipR Scanner 3000 with Workstationを用いた。
伸展刺激の有無によって生存細胞数に変化はなかった。しかし、伸展刺激負荷の細胞から抽出できたmRNAの量が刺激なしの細胞より少なかったことから、伸展刺激負荷によって細胞に影響があったと考えられる。また、伸展によってIL-8が有意に増加した。
DNAマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析では、伸展刺激を加えた細胞では細胞周期に関連するmRNAの発現が特に増加した。具体的には、細胞周期のコントロールに関与するcyclinやcyclin dependent kinase(CDK)、細胞周期の調節に大きな役割を持ちアポトーシスを促進するtumor protein p53(TP53)などの増加が見られた。またKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG:http://www.genome.jp/kegg)のパスウエイデータベースを用い発現変化を解析すると、伸展刺激によって変化の生じたmRNAはCell Cycle、Calcium signaling pathway、Apoptosis、Regulation of actin cytoskeletonなどのパスウエイに多く含まれることがわかった。これらより、伸展刺激によってDNAになんらかの障害が生じ、それを排除・修復する方向に遺伝子の発現が変化していることが考えられる。

報告書

(2件)
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (9件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] A rapid and highly sensitive in situ mRNA hybridization method with digoxigenin labeled cRNA probes2006

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Tsuchiya B, Nagashio R, Jiang S-X, Okayasu I.
    • 雑誌名

      J Histotechnol in press

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Lower expression of genes near microRNA in C.elegans germline2006

    • 著者名/発表者名
      H.Inaoka, Y.Fukuoka, I.S.Kohane
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics in press

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Local and systemic expression of inducible nitric oxide synthase in comparison with that of cyclooxygenase-2 in rat carrageenin-induced pleurisy2005

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa H, Nakagawa S, Onkubo Y, Matsui M, Yamaguchi S, Kawamura M, Hatanaka K, Kawakubo Y, Hiramoto Y, Kobayashi H, Harada Y
    • 雑誌名

      Nitric Oxide-Biol Chem 12

      ページ: 80-88

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 血圧ガスと酸塩基平衡の新しい視点2005

    • 著者名/発表者名
      小林弘祐, 小久保謙一
    • 雑誌名

      呼吸 24

      ページ: 680-685

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 低酸素の意味2005

    • 著者名/発表者名
      小林弘祐, 廣瀬 稔
    • 雑誌名

      呼吸と循環 53・11

      ページ: 1111-1118

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Invasive meningioma is associated with a low expression of E-cadherin and β-catenin2005

    • 著者名/発表者名
      Utsugi S, Oka H, Sato Y, Kawano N, Tsucniya B, Kobayashi I, Fujii K.
    • 雑誌名

      Clin Neuropathol 24

      ページ: 8-12

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Nitric oxide generated by iNOS reduces deformability of Lewis lung carcinoma cell.2004

    • 著者名/発表者名
      Igawa S, Kobayashi H et al.
    • 雑誌名

      Cancer Science 94

      ページ: 342-347

    • NAID

      10013722547

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Local and systemic expression of inducible nitric oxide synthase in comparison with that of cyclooxygenase-2 in rat carrageenin-induced pleurisy

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa H, Kobayashi H, Harada Y et al.
    • 雑誌名

      Nitric Oxide:Biol.Chem. (accepted, in press)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Inter-species differences of co-expression of neighboring genes in eukarvotic venomes

    • 著者名/発表者名
      Fukuoka Y, Inaoka H, Kohane IS
    • 雑誌名

      BMC Genomics

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] Medical diagnosis and prognosis based on the DNA microarray technology(B.G.Silverman, A.Jain A.Ichalkaranje, L.C.Jain eds.)Intelligent Paradigms in Healthcare Enterprisis2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Fukuoka, H.Inaoka, I.S.Kohane
    • 出版者
      Springer-Verlag
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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