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植物細菌の薬剤耐性機構と薬剤耐性菌の生存適応能に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 16658020
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 植物病理学
研究機関高知大学

研究代表者

曵地 康史  高知大学, 農学部, 教授 (70291507)

研究分担者 木場 章範  高知大学, 農学部, 助教授 (50343314)
大西 浩平  高知大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50211800)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2005年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2004年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードoxolinic acid / Burkholderia glumae / 生存適応能 / DNAジャイレース / 耐性 / 生存適応能力 / キノロン系薬剤
研究概要

イネもみ枯細菌病菌Burkholderia glumaeのキノロン系薬剤oxolinic acid(OA)の耐性機構について網羅的な解析を行い、以下の事項について明らかにした。
1.B.glumae圃場分離株のOA耐性は、いずれもGyrAの83番目のアミノ酸残基(GyrA83)のSerからArgまたはIleへの変異による。
2.GyrAの81(GyrA81)、82(GyrA82)および87番目(GyrA87)のアミノ酸残基の変異によってもB.glumaeはOA耐性となる。
3.B.glumaeのイネ小穂において、GyrA81、GyrA82およびGyrA87にそれぞれ変異を有する株の増殖能は著しく劣り、GyrA83に変異を有する株の、OA処理をした小穂における増殖能は、親株の小穂における増殖能と同等であった。すなわち、OA耐性株のうち、GyrA83に変異を有する株のみがイネ体における生存適応能を示すが、それもOA処理時に限られる。
4.GyrA83のアミノ酸変異によるOA耐性化は、house keeping遺伝子であるgyrBやrpoDの多様性や挿入配列を指標としたゲノムの多様性よりもスピードが速く、ゲノム複製のエラーによりもたらされる。すなわち、OA耐性B.glumae圃場分離株の起源を解析するためには、挿入配列ERICとBOXを用いたrep-PCRとgyrBとrpoDの塩基配列による系統解析とともに、GyrA83のアミノ酸解析とOA耐性度の解析が必要である。
5.GyrA83のアミノ酸に対応した塩基配列を基に、MAMA PCR法によるOA耐性B.glumae感染イネ種子の選抜方法を開発した。

報告書

(2件)
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2006 2004

すべて 雑誌論文 (3件)

  • [雑誌論文] Phylogenetic study and multiplex PCR based detection of Burkholderia plantarii, Burkholderia glumae and Burkholderia gladioli using gyrB and rpoD sequences2006

    • 著者名/発表者名
      Maeda, Y. et al.
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutional Microbiology (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A new method to detect oxolinic acid-resistant Burkholderia glumae infesting rice seeds using a mismatch amplification assay polymerase chain reaction2004

    • 著者名/発表者名
      Maeda, Y., Kiba, A., Ohnishi, K., Hikichi, Y.
    • 雑誌名

      J.Gen.Plant Pathol. 70

      ページ: 215-217

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Implication of amino acid substitutions at position 83 in GyrA on oxolinic acid-resistance in Burkholderia glumae field isolates, a casual agent of bacterial seedling rot and grain rot in rice2004

    • 著者名/発表者名
      Maeda, Y., Kiba, A., Ohnishi, K., Hikichi, Y.
    • 雑誌名

      Appl.Environ.Microbiol. 70

      ページ: 5613-5620

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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