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ヒト少量血液からの対象ゲノム領域クローニング新手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 16659091
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 人類遺伝学
研究機関東海大学

研究代表者

木村 穣  東海大学, 医学部, 教授 (10146706)

研究分担者 大塚 正人  東海大学, 医学部, 助手 (90372945)
研究期間 (年度) 2004 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
2005年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2004年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワードDNA抽出 / ETクローニング / 制限酵素 / TAR法 / 疾患感受性領域 / BAC / 血液 / 相同組換え / 微量DNA / II型制限酵素 / 巨大DNA領域
研究概要

本年度は以下の成果を得た。
1)血液からのDNA抽出法の検討
昨年度はDNA抽出法を中心に検討し、多くの研究室で使用されるQuiagen社のDNA抽出キットに比べ、膜を利用したDNA抽出器は操作時間が約5-10分/検体と非常に短時間ですみ、一年程度冷蔵保存の血液からでも50-100KbのDNAを回収できた。本年度はこれを実践的に応用し、研究室のメンバー10人で再現性のよい結果を得た。医の倫理委員会ですでに承認を受けた研究計画について患者群のDNAについても今後検討する。
2)クローニング条件の検討件については、昨年度、大腸菌のETクローニング法におけるクローニング条件の検討し、大腸菌株の選定を行った。当初、非常に期待していた方法であったが、この方法は対象領域が10Kb以上になってくると組換え率が非常に低くなることが判明した。これではETクローニング法のよさが活かせないため、次いで非対称的なcohesive末端を生じる制限酵素を用いる方法をモデルゲノムとして酵母を対象に検討した。約10KbまでのDNA断片について、ゲノムからのdirect cloningを試みたところ、回収したクローンはほぼ全例目的の領域を含んでいた。ヒトゲノムの際はcomplexityが高いため、分子量によるDNA分画等を行わねばならないと思われるが、極めて期待が持てる方法と言える。
以上をもとに、今後ますます実用化への道を目指したい。

報告書

(2件)
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2005 2004

すべて 雑誌論文 (4件)

  • [雑誌論文] Whole genome association study of rheumatoid arthritis using 27,039 microsatellites2005

    • 著者名/発表者名
      Tamiya G. et al.
    • 雑誌名

      Hum Mol Genet. 14(16)

      ページ: 2305-2321

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A Novel Method for Constructing Murine cDNA Library Enriched with Maternal mRNAs Exhibiting De Novo Independent Post-Fertilization Polyadenylation.2005

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, T., et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Comm. 327(3)

      ページ: 688-699

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Possible roles of zic1 and zic4, identified within the medaka Double anal fin(Da)locus, in dorsoventral patterning of the trunk-tail region(related to the phenotypes of the Da mutant).2004

    • 著者名/発表者名
      Otsuka, M., et al.
    • 雑誌名

      Mechanism of Development 121

      ページ: 873-882

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] CHOP : visualization of ‘wobbling' and isolation of highly conserved regions from aligned DNA sequences.2004

    • 著者名/発表者名
      Otsuka, M., et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acid Research 32

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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