• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

反応性Py-Imポリアミドによる遺伝子機能解析法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 16681019
研究種目

若手研究(A)

配分区分補助金
研究分野 生物分子科学
研究機関京都大学

研究代表者

板東 俊和  京都大学, 大学院理学研究科, 助教授 (20345284)

研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
23,530千円 (直接経費: 18,100千円、間接経費: 5,430千円)
2006年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2005年度: 12,610千円 (直接経費: 9,700千円、間接経費: 2,910千円)
2004年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
キーワードPy-Imポリアミド / 遺伝子発現制御 / 塩基配列認識 / 配列特異的アルキル化 / ピロール・イミダゾールポリアミド / 配列特異的DNAアルキル化 / ピロール-イミダゾールポリアミド / 特定遺伝子発現制御
研究概要

本研究期間を通して、様々な反応性Py(N-メチルピロール)-Im(N-メチルイミダゾール)ポリアミドを合成し、効率的な配列特異的アルキル化能と生物学的機能評価の研究を進めた。具体的には、反応性と配列認識能を高いレベルで両立した反応性Py-Imポリアミドを特定遺伝子発現制御ツールとして、あるいは、生物化学的な薬剤として実用化するために(1)分子設計と合成基盤の確立(2)特定遺伝子発現制御(3)細胞増殖阻害に関する機能評価を行った。
(1)DNA配列認識能をもつPy-Imポリアミドとseco-CBIアルキル化部をインドール基で結合させ、任意の塩基配列でDNAを効率的にアルキル化する機能性分子の設計を確立した。Py-Imポリアミドの合成に関しても、固相自動ペプチド合成機によって多品種の配列特異的アルキル化剤を安定して供給することが可能になった。テロメア二本鎖配列に対して特異的アルキル化能を有するPy-Imポリアミドの合成及び、機能評価にも成功した。
(2)反応性Py-Imポリアミドを用いて、塩基配列特異的アルキル化が遺伝子機能に与える影響をヒト細胞系にて評価・検討した。その結果、標的とする塩基配列を、プロモーター領域のみに限らず、コード領域へ拡張することに成功した。さらに、GFP蛋白コード領域に存在する特定塩基配列を標的として、細胞内でGFP発現を阻害することが可能であることを示した。
(3)様々な配列認識能を有するインドールリンカーを有する反応性Py-Imポリアミドを合成し、細胞増殖阻害活性に与える影響をヒトがん細胞系において評価を進めた。Fmoc固相合成によるDNA結合性ヘアピン型Py-Imポリアミドの生物実験への供給が確立し、実用化に向けた共同研究も進んだ。その結果、TGF-b遺伝子を標的としたPy-ImポリアミドのTGF-b遺伝子発現に与える抑制効果に関する評価が進んだ。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (14件)

  • [雑誌論文] Efficient DNA Alkylation by a Pyrrole-Imidazole CBI Conjugate with an Indole Linker : Sequence Specific Alkylation with Nine-Base-Pair Recognition2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chem. 17・3

      ページ: 715-720

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Discrimination or Hairpin Polyamides with an Aipha-Substituted-Gamma-Aminobutyric Acid as a 5'-TG-3' Reader in DNA Minor Grooye2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 128・27

      ページ: 8766-8776

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Sequence-Specific Alkylation of Double-Strand Human Telomere Repeat Sequence by Pyrrole-Imidazole Polyamides with Indole Linkers.2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 128・37

      ページ: 12162-12168

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthesis and Biological Properties of Sequence-Specific DNA-Alkylating Pyrrole-Imidazole Polyamides2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Acc.Chem.Res. 39・12

      ページ: 935-944

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Alkylation of template strand of coding region causes effective gene silencing.2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34・4

      ページ: 1189-1195

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Development of Gene Silencing Pyrrole-Imidazole Polyamide Targeting the TGF-β1 Promoter for Treatment of Progressive Renal Diseases.2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H., N.Fukuda
    • 雑誌名

      J.Am.Soc.Nephr. 17・Feb

      ページ: 422-432

    • NAID

      10024923283

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Antitumor Activity of Sequence-specific Alkylating Agents : Pyrrole-imidazole CBI conjugates with Indole linker2006

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Cancer Science 97・3

      ページ: 219-225

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Specific Adenine Alkylation by Pyrrole-Imidazole CBI Conjugates2005

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127・40

      ページ: 13890-13895

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthetic Pyrrole-Imidazole Polyamide Inhibits Expression of the Human Transforming Growth Factor-β1 Gene.2005

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H., N.Fukuda
    • 雑誌名

      J.Pharmacol.Exp.Ther. 315・2

      ページ: 571-575

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The Possibility of Sequence-specific DNA Alkylation toward Therapeutic Drugs2005

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      Pharm.Regul.Sci. 36・1

      ページ: 1-12

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The Chemical Biology That Controls DNA Function and Structure2005

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      有機合成化学協会誌 63・10

      ページ: 1016-1027

    • NAID

      130000928679

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] C-H to N Substitution Dramatically Alters the Sequence-Specific DNA Alkylation, Cytotoxicity, and Expression of Human Cancer Cell Lines2004

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 126・11

      ページ: 3406-3407

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Sequence-Specific Gene Silencing in Mammalian Cells by Alkylating Pyrrole-imidazole Polyamides2004

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 126・16

      ページ: 5113-5118

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Enantioselective DNA Alkylation by a Pyrrole-Imidazole S-CBI Conjugate2004

    • 著者名/発表者名
      Bando, T., Sugiyama H.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 126・29

      ページ: 8948-8955

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書

URL: 

公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi