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マイクロアレイとBACコンティグを用いた神経芽腫発症の分子機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 16790568
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 小児科学
研究機関東京大学

研究代表者

滝田 順子  東京大学, 医学部附属病院, 講師 (00359621)

研究期間 (年度) 2004 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2006年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2005年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2004年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
キーワード神経芽腫 / がん抑制遺伝子 / 遺伝子増幅 / LOH / DNAアレイ / MYCN遺伝子 / 1p36ホモ欠失 / 発現プロファイル / API2 / p19INK4D / BAF60c
研究概要

神経芽腫(NB)は脳腫瘍に次いで頻度の高い小児固形腫瘍であるが、その発症の機序は十分に解明されていない。一方、腫瘍細胞で高頻度に観察されるゲノムの増幅・欠失などの変化は、しばしば腫瘍の発症機序と密接な関連を有することが知られており、これらの異常を網羅的に解析することは腫瘍の多様な分子機構を解明する上で有力な手段と考えられる。そこで本年度はNB細胞株25株、新鮮腫瘍30例にっき、12〜25万個のSNP特異的オリゴヌクレオチドプローブを搭載した(Affymetrix【○!R】Gene Chip【○!R】 50k、250k array)を用いて、NBにおけるmolecular allelo-karyotyping解析を行った。アレイ解析の結果は、HSH解析、PCR-SSCP法、直接塩基配列決定法およびreal-time PCR法を用いて検証を行った。解析した細胞株25株中20株と新鮮腫瘍の30例中10例で従来より知られているMYCN領域の増幅を確認し、このうち18株でMYCNの近傍に新たな増幅シグナルを検出した。またこれまでに報告のない7q、11q、15qなどの高度増幅も検出された。また同様に従来より報告のある17qの増幅も細胞株20株中12株、新鮮腫瘍30例中21例で検出され、この領域内に約700kbの新規高度増幅領域を計7例の検体で検出した。この700kbの領域内には唯一の構造遺伝子が存在することが判明し、この遺伝子の発現解析を行ったところ、ゲノムの増幅のみられる症例では有意な高発現が観察された。これ以外にもLOHやアレル不均衡、およびホモ欠失が多数検出された。以上より、NBで最も頻度の高いゲノム変異である17qの増幅領域内に新規高度増幅遺伝子(NBA17)を同定したが、複数の検体でこの遺伝子の高発現が観察されたことより、NBA17がNBの発症や進展に関与する新規がん遺伝子であることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2007 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (8件)

  • [雑誌論文] Mutation and expression analyses of the MET CDKN2A genes in rhabdomyosarcoma with emphasis on MET overexpression.2007

    • 著者名/発表者名
      Chen YY
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer. 46・4

      ページ: 348-358

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Mutaitons of the PTPN11 and Ras genes in rhabdomyosarcoma and pediatric hematological malignancies.2006

    • 著者名/発表者名
      Chen YY
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer. 45・6

      ページ: 583-591

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Mutations of the Notch1 gene in T-cell acute lymphoblastic leukemia : analysis in adults and children.2005

    • 著者名/発表者名
      Lee SY
    • 雑誌名

      Leukemia 19・10

      ページ: 1841-1843

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Aberrations of the CHK2 gene are rare in pediatric solid tumors.2005

    • 著者名/発表者名
      Chen YY
    • 雑誌名

      Int J Mol Med 16・1

      ページ: 85-91

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] In vitro drug resistance to imatinib and mutation of ABL gene in childhood Ph+ acute lymphoblastic leukemia.2005

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi H
    • 雑誌名

      Leukemia and Lymphoma 46・2

      ページ: 273-276

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] In vitro drug resistance to imatinib and mutation of ABL gene in childhood Ph+ acute lymphoblastic leukemia.2005

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi H
    • 雑誌名

      Leukemia Lymphoma 46・2

      ページ: 273-276

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Gene expression profiling and identification of novel prognostic marker genes in neuroblastoma.2004

    • 著者名/発表者名
      Takita J
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer. 40・2

      ページ: 120-132

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Mutations of the PTPN11 and RAS Genes in Rhabdomyosarcoma and Pediatric Hematological Malignancies.

    • 著者名/発表者名
      Chen YY
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer. (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2004-04-01   更新日: 2016-04-21  

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