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ミトコンドリア呼吸鎖における電子伝達複合体の動的構造解析と電子伝達制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16H04173
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関北海道大学

研究代表者

石森 浩一郎  北海道大学, 理学研究院, 教授 (20192487)

研究分担者 内田 毅  北海道大学, 理学研究院, 准教授 (30343742)
齋尾 智英  北海道大学, 理学研究院, 助教 (80740802)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
2018年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2017年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2016年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
キーワードシトクロムc / シトクロムc酸化酵素 / ミトコンドリア呼吸鎖 / ナノディスク / 電子伝達 / TCS / 構造揺らぎ / 電子伝達経路 / 脱水和 / 構造的揺らぎ / 電子伝達複合体
研究成果の概要

細胞内のエネルギー生産に重要な酸素分子の水への還元は、ヘムを含む電子伝達蛋白質であるシトクロムcから膜結合蛋白質であるシトクロムc酸化酵素に電子が伝達されることで進行する。この電子伝達反応の分子機構を生体内に近い環境で検討し、その効率的な反応の進行には、シトクロムc酸化酵素とその周囲の膜構成成分との相互作用や、蛋白質構造の過渡的な変化である「構造的揺らぎ」、少数のアミノ酸残基による特異的な蛋白質間相互作用、さらには電子伝達経路における疎水的な環境が重要であることが明らかとなった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

シトクロムcからシトクロムc酸化酵素への電子伝達が阻害されれば、細胞のエネルギー源であるATPの生産が停止してしまうことから、その電子伝達反応の制御機構の解明は生命の化学的理解には必須であり、また、蛋白質中の電子の流れを制御することができれば、生体分子を利用した電子素子の開発にもつながる。本研究では、複雑な構造である蛋白質間を電子がどのようにして効率的に伝達されていくのかについて、その蛋白質の分子構造に基づいて議論することで、生体分子における電子の流れの制御機構の一端を明らかにしようとするものである。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 5件、 招待講演 4件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Uncovering dehydration in cytochrome <i>c</i> refolding from urea- and guanidine hydrochloride-denatured unfolded state by high pressure spectroscopy2019

    • 著者名/発表者名
      Konno, S., Doi, K., Ishimori, K.
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 16 号: 0 ページ: 18-27

    • DOI

      10.2142/biophysico.16.0_18

    • NAID

      130007585358

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Polyethylene glycol promotes autoxidation of cytochrome c2018

    • 著者名/発表者名
      Sato Wataru、Uchida Takeshi、Saio Tomohide、Ishimori Koichiro
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: 1862 号: 6 ページ: 1339-1349

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2018.03.010

    • NAID

      120006585774

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Electron Transfer Pathway Analysis from Cytochrome c to Cytochrome c Oxidase Under Turnover Conditions2018

    • 著者名/発表者名
      Ishimori, K.
    • 学会等名
      233rd ECS Meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Electron Transfer from Cytochrome c to Cytochrome c Oxidase: Formation of “Breakwater” in Electron Pathway2018

    • 著者名/発表者名
      Ishimori, K.
    • 学会等名
      Supramolecular Chemistry of Nitrogen Ligands
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Entropically essential dehydration upon cytochrome c - cytochrome c oxidase complex formation to prevent electron leaks to the bulk water phase from the protein-protein interface2017

    • 著者名/発表者名
      Ishimori, K.
    • 学会等名
      GRC Metals in Biology
    • 発表場所
      Ventura(U.S.A.)
    • 年月日
      2017-01-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural and Functional Characterization of Electron Transfer Complex Between Cytochrome c and Cytochrome c Oxidase2017

    • 著者名/発表者名
      Ishimori, K.
    • 学会等名
      231st ECS Meeting
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ナノディスクに再構成した Vibrio cholerae 由来シトクロム cbb3 の構造,機能的評価2016

    • 著者名/発表者名
      井上真尚、柴田明宏、今井瑞依、内田毅、村本和優、城宜嗣、吉川信也、石森浩一郎
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Functional significance of trimerization in Cl- pumping properties of halorhodopsin examined by nanodisc reconstitution2016

    • 著者名/発表者名
      橋本江里、鈴木研士郎、山本愛弓、塚本卓、内田毅、菊川峰志、出村誠、石森浩一郎
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Energetic Analysis of Interactions in Electron Transfer Complex Between Cytochrome c and Cytochrome c Oxidase2016

    • 著者名/発表者名
      Ishimori, K.
    • 学会等名
      229th ECS Meeting
    • 発表場所
      San Diego(U.S.A.)
    • 年月日
      2016-05-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 発表論文からpick up

    • URL

      http://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~stchem/pickup/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 発表論文からpickup

    • URL

      http://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~stchem/pickup/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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