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転写装置の新規機能とネットワーク解析による生存戦略の再評価

研究課題

研究課題/領域番号 16H04903
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関東京農業大学

研究代表者

吉川 博文  東京農業大学, 生命科学部, 教授 (50175676)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2018年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2017年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワードRNA ポリメラーゼ / コア酵素 / 転写開始機構 / プロモーター認識 / 緊縮応答 / 異種遺伝子発現 / 枯草菌 / 耐熱化 / RNAポリメラーゼ / 遺伝子発現 / 機能ネットワーク / 実験進化 / 農芸化学 / 応用微生物 / ゲノム / トレードオフ
研究成果の概要

細胞の対数増殖後期、すなわちライフアフターログに関連するさまざまな機能は、生存戦略を決定する生命現象の基本的ネットワークを形成しており、枯草菌におけるいくつかの現象が転写装置に結びつくことからRNAポリメラーゼを中心として俯瞰する研究を行った。その結果、コア酵素の新機能として、転写レベルの抑制による細胞の耐熱化、転写開始点ヌクレオチドの嗜好性の変化による緊縮応答、およびプロモーター認識の嗜好性変化による異種遺伝子発現、といった分子機構を明らかにすることができた。また、緊縮調節に関する解析からGTP生合成系に関与するSアデノシルメチオニンの機能という新規ネットワークを構築することができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

転写装置に関する知見は多いが、本研究のように対数増殖後期の細胞機能が転写装置と密接な接点を持つことが新たに判明し、特にコア酵素の役割は単なる重合酵素ではなく、さまざまな制御機構に関わっていることを明らかにした。プロモーターや転写開始点認識に関わるコア酵素の役割は、50年近く謎であった現象を解明した点で学術的意義は高い。またメチオニン感受性は不可思議な現象であったが、GTP合成系との関連を解明した点は核酸代謝における大きな学術的成果である。本研究の成果は、転写装置の新しい知見を元に異種遺伝子発現における種の壁を越えるアイデアに発展し、微生物生産という産業レベルでも大きな社会的意義も包括している。

報告書

(4件)
  • 2019 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2020 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Novel (p)ppGpp<sup>0</sup> suppressor mutations reveal an unexpected link between methionine catabolism and GTP synthesis in <i>Bacillus subtilis</i>2020

    • 著者名/発表者名
      Osaka Natsuki、kanesaki Yu、Watanabe Megumi、Watanabe Satoru、Chibazakura Taku、Takada Hiraku、Yoshikawa Hirofumi、Asai Kei
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology

      巻: 00 号: 6 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1111/mmi.14484

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Essentiality of WalRK for growth in Bacillus subtilis and its role during heat stress.2018

    • 著者名/発表者名
      Takada H., Shiwa Y., Takino Y., Osaka N., Ueda S., Watanabe S., Chibazakura T., Su'etsugu M., Utsumi R., Yoshikawa H
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 164 号: 4 ページ: 670-684

    • DOI

      10.1099/mic.0.000625

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Essentiality and function of WalK/WalR two-component system: the past, present, and future of research.2018

    • 著者名/発表者名
      Takada H, Yoshikawa H.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem.

      巻: 印刷中 号: 5 ページ: 741-751

    • DOI

      10.1080/09168451.2018.1444466

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 枯草菌を用いた遺伝子重複と変異による転写装置の機能分化の解析2020

    • 著者名/発表者名
      石垣 媛菜、吉川 博文、朝井 計
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌細胞内におけるシアノバクテリアRNAポリメラーゼの構築2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤 龍一、美田 知也、渡辺 智、兼崎 友、板谷 光泰、吉川 博文、朝井 計
    • 学会等名
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] メチオニン代謝が関与するGTP生合成の新規な制御機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、兼崎友、門屋亨介、田口精一、渡辺智、千葉櫻拓、吉川博文、朝井計
    • 学会等名
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] IS 256Bsu1 のCRISPR/dCas9 システムによるtransposase発現抑制系の開発2019

    • 著者名/発表者名
      片野 亘、徳山 麻里、朝井 計、吉川 博文
    • 学会等名
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌2-オキソグルタル酸脱水素酵素複合体の遷移期に おける機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      山口将司,吉川博文,朝井 計
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌を用いた分子シャペロンによる変異緩衝作用につ いての検証2019

    • 著者名/発表者名
      加納啓吾,北村夏美,法花津匠,大塚まみ,武井若紗, 小菅是子,朝井 計,吉川博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] メチオニン代謝が関与するGTP生合成の新規な制御機構の解析2019

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、兼崎友、門屋亨介、田口精一、渡辺智、千葉櫻拓、吉川博文、朝井計
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌RNAP のiNTP に対する嗜好性の解析2019

    • 著者名/発表者名
      渡辺愛美,円谷優佑,大坂夏木,吉川博文, 朝井 計,兼崎 友
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 合成生物シアノバチルスにおける合成ゲノム再起動計画2019

    • 著者名/発表者名
      渡辺 智,朝井 計,赤沼元気,千葉櫻拓,河村富士夫,板谷光泰,吉川博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] CRISPR/dCas9 システムを用いたIS 256Bsu1 trasposase の枯草菌168 株への影響の解析2019

    • 著者名/発表者名
      片野 亘,徳山麻里,吉川博文,朝井 計
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of novel suppressor mutations of Bacillus subtilis (p)ppGpp0 strain not involved in GTP biosynthesis.2019

    • 著者名/発表者名
      Natsuki Osaka, Hiraku Takada, Yu Kanesaki, Ryosuke Kadoya, Seiichi Taguchi, Satoru Watanabe, Taku Chibazakura, Hirofumi Yoshikawa, Kei Asai
    • 学会等名
      20th International Conference on Bacilli and Gram-Positive Bacteria.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Novel regulatory mechanism of Methionine metabolism involved in GTP biosynthesis.2019

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、兼崎友、門屋亨介、田口精一、渡辺智、千葉櫻拓、吉川博文、朝井計
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] シグマ因子の in vivo 進化実験2018

    • 著者名/発表者名
      石垣媛菜,朝井計,吉川博文
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会 第12回年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] アミノ酸飢餓への適応に関わる枯草菌 RNA ポリメラーゼの変異解析2018

    • 著者名/発表者名
      渡辺愛美,円谷優佑,大坂夏木,兼崎友,朝井計,吉川博文
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会 第12回年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] プリンヌクレオチド生合成経路初発酵素 Prs による新規アミノ酸飢餓適応経路の解析2018

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木,高田啓,多喜乃雄太,兼崎友,渡辺智,千葉櫻拓,吉川博文、朝井 計
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会 第12回年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌における(p)ppGpp に依存しないアミノ酸飢餓適応機構の解析2018

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木,高田啓,多喜乃雄太,兼崎友,渡辺智,千葉櫻拓,吉川博文,朝井計
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌における異種プロモーター認識能拡張の取り組み2018

    • 著者名/発表者名
      渡辺葵,山下園加,井上拓也,吉川博文,朝井計
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌RNAP コア酵素の変異による耐熱化と高温適応に対するトレードオフ2017

    • 著者名/発表者名
      高松美沙樹、兼崎 友、朝井 計、吉川博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都市)
    • 年月日
      2017-03-19
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌二成分制御系WalRK の熱ストレス応答と生育必須性に関する解析2017

    • 著者名/発表者名
      高田 啓、植田 修平、志波 優、渡辺 智、千葉櫻 拓、内海 龍太郎、吉川 博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌における栄養状態に応じた新規GTP 制御機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、高田啓、多喜乃雄太、兼崎友、渡辺智、千葉櫻拓、 吉川博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] SigI とWalKR による枯草菌の増殖維持の制御ネットワークの解析2017

    • 著者名/発表者名
      朝井 計、清水 葉子、廣澤 早香、高田 啓、吉川 博文
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      京都女子大学(京都市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] アミノ酸飢餓への適応に関与する枯草菌RNAポリメラーゼの変異解析2017

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木、円谷優佑、高田啓、多喜乃雄太、兼崎友、渡辺智、千葉櫻拓、 吉川博文
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス(藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-02
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌RNAPコア酵素の変異による耐熱化と高温適応に対するトレードオフ2017

    • 著者名/発表者名
      高松美沙樹、兼崎 友、朝井 計、吉川博文
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス(藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-02
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Essentiality of WalRK for growth in Bacillus subtilis and its role under heat stress.2017

    • 著者名/発表者名
      Takada H., Osaka N., Su’etsugu M., Yoshikawa H.
    • 学会等名
      19th International Conference on Bacilli & Gram-Positive Bacteria
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 枯草菌における(p)ppGppに依存しないアミノ酸飢餓適応機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      大坂夏木,高田啓,多喜乃雄太,兼崎友,渡辺智,千葉櫻拓,朝井計,吉川博文
    • 学会等名
      日本遺伝学会 89回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2021-02-19  

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