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オセアニア地域に適応進化したイネ属の分布と適応機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 16H05777
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 遺伝育種科学
研究機関弘前大学

研究代表者

石川 隆二  弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (90202978)

研究分担者 一谷 勝之  鹿児島大学, 農水産獣医学域農学系, 准教授 (10305162)
齊藤 大樹  国立研究開発法人国際農林水産業研究センター, 熱帯・島嶼研究拠点, 任期付研究員 (10536238)
佐藤 洋一郎  京都府立大学, 和食文化研究センター, 特任教授 (20145113)
中村 郁郎  千葉大学, 大学院園芸学研究科, 教授 (50207867)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
15,730千円 (直接経費: 12,100千円、間接経費: 3,630千円)
2018年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2017年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2016年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
キーワード野生イネ / ゲノム分析 / 種間交雑 / 雑種形成 / ゲノム / 適応 / 生殖隔離 / オセアニア / 種間雑種 / 葉緑体置換 / イネ系統進化 / ゲノム解析 / 多様性評価 / Oryza / イネ系統分化 / 野生集団 / ルフィポゴン / オーストラリエンシス / イネの系統分化 / ゲノム再編成 / 適応性と進化 / 育種 / ゲノム進化 / 遺伝資源 / 自生地保全 / ゲノム倍数化 / 雄性不稔 / 育種遺伝科学 / 地理的隔離と生殖隔離 / 野生イネ自生地保全
研究成果の概要

オーストラリアにおける野生イネにおいてAAゲノムの種分化と分布について明らかにした。特にこれまで報告されていた2種であるrufipogon種とmeridionalis種以外にTaxon Bと(GOD採取地名としてJpn2)を見出した。生殖隔離機構については両種に対して発達させており,新種として定義される。ゲノムとしてはmeridionalisに類似するが生活史特性としては多年生を示した。さらに形態的に小穂サイズが大型であり,統計的に有意な差が見られた.

研究成果の学術的意義や社会的意義

種間交雑が生じている集団を見出したことと,他殖による戻し交雑が稔性を回復原因であることを遺伝的なマーカーから確認された。この様な種間交雑が多年生であり,かつmeridionalis的なゲノムを有する新種形成につながったものと結論された。形態的な特徴として見出された顕著な大粒については栽培種に戻し交雑により導入でき,2割程度の種子サイズの増加がみられた。このような野生種からの栽培化形質を導入できたことは育種事業を拡大させる社会的な意義がある。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 6件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 6件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (19件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of Queensland, QAFFI(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Genetic diversity among perennial wild rice Oryza rufipogon Griff., in the Mekong Delta. Ecology and Evolution2019

    • 著者名/発表者名
      Lam, DT,B C Buu, TL Lang, K Toriyama, I Nakamura and R Ishikawa
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 1 号: 5 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1002/ece3.4978

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular discrimination of landraces of Citrus species in the Okinawa,Japan.2018

    • 著者名/発表者名
      Dinh Thi Lam and Ryuji Ishikawa
    • 雑誌名

      Genet. Resour. Crop Evol.

      巻: 66 号: 2 ページ: 321-333

    • DOI

      10.1007/s10722-018-0710-x

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Diverse genetic variation in maternal lineages with high heterogeneity among <i>in situ</i>-conserved wild rice (<i>Oryza rufipogon</i> Griff.) developed in Thailand2018

    • 著者名/発表者名
      Kaewcheenchai R, U Promnart, K Soontrajarn, S Chotechuen,S Chitrakon, H Yuki, S Saito, Y-I Sato and R Ishikawa
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 68 号: 5 ページ: 614-621

    • DOI

      10.1270/jsbbs.16105

    • NAID

      130007544022

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] High-resolution mapping and characterization of <i>xa42</i>, a resistance gene against multiple <i>Xanthomonas oryzae</i> pv. <i>oryzae</i> races in rice (<i>Oryza sativa</i> L.)2018

    • 著者名/発表者名
      Busungu C, S Taura, JI Sakagami, T Anai, K Ichitani
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 68 号: 2 ページ: 188-199

    • DOI

      10.1270/jsbbs.17094

    • NAID

      130006743988

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genotyping of the SiDREB2 gene in worldwide foxtail millet (Setaria italica (L.) P. Beauv.) genetic resources with special attention to Indian landraces.2018

    • 著者名/発表者名
      Suehiro S, K Ichitani . E Domon,. K Fukunaga
    • 雑誌名

      enet Resour Crop Evol

      巻: 65 号: 6 ページ: 1559-1564

    • DOI

      10.1007/s10722-018-0645-2

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 和食とその文化の地理的多様性2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤洋一郎
    • 雑誌名

      科学

      巻: 88

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Sequencing of Australian wild rice genomes reveals ancestral relationships with domesticated rice2017

    • 著者名/発表者名
      Brozynska,M., D. Copetti, A. Furtado, R. A. Wing, D. Crayn, G. Fox, R. Ishikawa, R. J. Henry
    • 雑誌名

      Plant Biot. Jour

      巻: 15 号: 6 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1111/pbi.12674

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic diversity of the <i>wx</i> flanking region in rice landraces in northern Laos2016

    • 著者名/発表者名
      Muto, C., R. Ishikawa, K.M. Olsen, K. Kawano, C. Bounphanousay, T. Matoh, Y-I. Sato
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 66 号: 4 ページ: 580-590

    • DOI

      10.1270/jsbbs.16032

    • NAID

      130005266034

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 葉緑体ゲノムからみたヒシの進化.2019

    • 著者名/発表者名
      石川隆二・Dinh Thi Lam・山岸洋貴・片岡太郎
    • 学会等名
      日本育種学会第134回春季大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] オーストラリア野生イネ集団における自然交雑の検証と種特異的形質である葯長の連関解析.2019

    • 著者名/発表者名
      三島木 隆弘,菅原 魁人,一谷勝之,石川隆二
    • 学会等名
      日本育種学会第134回春季大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Genetic resources for breeding from wild relatives to landraces2018

    • 著者名/発表者名
      Ryuji Ishikawa
    • 学会等名
      3rd IPFS-FAFU 2018 International Symposium,Fuzhou China
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Grain Size in Australian wild rice.2018

    • 著者名/発表者名
      Ryuji Ishikawa
    • 学会等名
      he 3rd Australian Wild Rice Symposium, 27June
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Studies on the Domestication Process of Chinese Edible Plants,Water Chestnut (Trapa bispinosa).2018

    • 著者名/発表者名
      ISHIKAWA R., T. KATAOKA, L. TANG
    • 学会等名
      The eighth International Conference of the Society for East Asian Archaeology.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genetic diversity and variation for blast resistance in rice cultivars from Ethiopia2018

    • 著者名/発表者名
      Taddesse Lakew・Yoshimichi Fukuta ・Ryuji Ishikawa
    • 学会等名
      日本育種学会第13回東北育種研究集会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] オーストラリア野生イネ集団における自然交雑の検証と種特異的形質である葯長の連関解析.2018

    • 著者名/発表者名
      三島木 隆広,菅原 魁人,一谷勝之,石川隆二
    • 学会等名
      日本育種学会第13回東北育種研究集会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] アジア栽培イネOryza sativaとオーストラリア野生イネO. meridionalisの交雑後代に見られた半不稔現象の遺伝解析2018

    • 著者名/発表者名
      市川 真,田浦 悟,石川 隆二,一谷 勝之
    • 学会等名
      日本育種学会第13回九州育種談話会,日本育種学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] イネ雑種弱勢の遺伝と病徴2018

    • 著者名/発表者名
      一谷勝之,久保山勉,手塚孝弘
    • 学会等名
      日本育種学会第134回講演会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] プラント・オパール形状を利用した野生イネの分化と変遷に関する基礎的研究2018

    • 著者名/発表者名
      宇田津徹朗,右田晋太郎,石川隆二,一谷勝之
    • 学会等名
      日本文化財科学会第25回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Two ancestral lineages of melon cultivars revealed by the analysis of PolA1 gene2018

    • 著者名/発表者名
      Miku Sato, Arisa Tsuchiya, Katunori Tanaka, Daisuke Ogawa, Kenji Kato, Ikuo Nakamura
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XXVI Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Practical molecular classification unit (IPSUM) to define species border of eukaryote and to friendly augment Linnaeus classification2018

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, I.
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XXVI Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 栽培メロン(Cucumis melo)は、2つの祖先系譜(IPSUM)からなる複合種である2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤文紅・小川大輔・田中克典・中村郁郎
    • 学会等名
      DNA多型学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 真核生物5000種の種特異的Ptag配列のデータベース- 分子的な種の分類単位 IPSUM の提案 -2018

    • 著者名/発表者名
      中村郁郎・高橋弘子・中村晃一・森泉俊幸
    • 学会等名
      DNA多型学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation of genetic diversity in Ethiopian rice cultivars based on nuclear and cytoplasmic DNA molecular markers2018

    • 著者名/発表者名
      Taddesse Lakew, Ryuji Ishikawa
    • 学会等名
      第133回日本育種学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] アジア栽培イネO. sativa とオーストラリア野生イネO. meridionalis の交雑後代に見出された部分不稔現象の遺伝子分析.2017

    • 著者名/発表者名
      菅原 魁人, 一谷 勝之, 石川 隆二
    • 学会等名
      第132回日本育種学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シークエンス情報によりベトナム野生イネからAS996 に導入した領域の推定.2017

    • 著者名/発表者名
      ディン ティ ラム, Chi Buu Bui, 石川 隆二
    • 学会等名
      第132回日本育種学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Surveying genetic diversity in Ethiopian rice cultivars as inferred by SSR markers2017

    • 著者名/発表者名
      Taddesse Lakew, Ryuji Ishikawa
    • 学会等名
      第13回東北育種研究集会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Screening and characterizing Cytoplasmic Male Sterile (CMS) in perennial wild rice populations (Oryza rufipogon)2017

    • 著者名/発表者名
      Dinh Thi Lam, Ryuji Ishikawa
    • 学会等名
      第13回東北育種研究集会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] Rice and Genetics

    • URL

      http://nature.cc.hirosaki-u.ac.jp/lab/1/plantbrd/genetics.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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