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ネパールにおけるロタウイルスの進化とワクチン導入が及ぼす影響の評価

研究課題

研究課題/領域番号 16H05831
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 衛生学・公衆衛生学
研究機関長崎大学

研究代表者

ゴウチャン プニータ  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 客員研究員 (20721038)

研究分担者 金子 美穂 (後藤美穂)  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 助教 (50599909)
研究期間 (年度) 2016 – 2019
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2019年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2018年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2017年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワードロタウイルス / G12P[6]型 / ネパール / ワクチン / 分子疫学 / ウイルス進化 / Rotavirus / G12P[6] / Molecular Epiedmiology / Nepal / Sequencing / Rotavirus A / Gastroenteritis / Children under 5 years / Genotyping / Electropherotyping / Whole genome sequencing / Rotavirus Nepal / Molecular Epidemiology / Genotype / Electropherotype / Strain / G12P[6]ロタウイルス
研究実績の概要

ネパールでは2017年に予定されていたロタウイルスワクチンの定期接種への導入が2020年6月に延期されたが、本研究ではワクチン導入がネパールにおけるロタウイルス下痢症の発生状況および流行株変異に与える影響を評価することを目的としており、ワクチン導入前の流行動態のサーベイランスを継続することが必要不可欠であることから、2019年度もこれまでと同様の調査を実施した。2019年に急性下痢症によりカトマンズ市内のカンティ小児病院を受診した5歳未満の下痢症患児から便検体を採取し、ELISA(免疫学的測定法)により126のロタウイルス陽性検体を同定した。これらの検体からロタウイルスゲノムRNAを抽出し、ポリアクリルアミドゲル電気泳動に供した。126検体のうち68検体について、ロタウイルスゲノムに由来する11本のバンドが明瞭に観察され、バンドパターンによる株の分類(electropherotyping)が可能であった。Long RNAパターンをもつ株は10種類、Short RNAパターンをもつ株は1種類の計11種類のパターンに分類された。これらのバンドパターンを過去に同地域で優勢を占めたG12P[6]株の複数のバンドパターンと比較したが、一致するものは見られなかった。本研究のこれまでの結果と合わせると、ネパールでは現行のロタウイルスワクチン株とは異型であり世界的にはまれなG12P[6]株が依然としてロタウイルス流行株の優勢を占めているとともに、それらは同じG12P[6]型をもつものの遺伝学的には異なる複数の株から構成されており、常に優勢株の置き換わりが起きているということが示唆された。

現在までの達成度 (段落)

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2019 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] トリブバン大学(ネパール)

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Changing trend in Rotavirus A observed among Nepali children under 5 years in the most recent years2019

    • 著者名/発表者名
      Punita Gauchan
    • 学会等名
      第67回 日本ウイルス学会学術集会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Anticipating rotavirus vaccine introduction in the national immunization programme in Nepal2017

    • 著者名/発表者名
      Punita Gauchan
    • 学会等名
      グローバルヘルス合同大会2017(第58回日本熱帯医学会大会・第32回日本国際保健医療学会学術大会・第21回日本渡航医学会学術集会 合同大会)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ネパールにおけるG12P[6]遺伝子型ロタウイルスA の持続的流行の基盤にある株交代 現象の全ゲノム解析による検証2017

    • 著者名/発表者名
      Punita Gauchan
    • 学会等名
      第70 回 日本細菌学会九州支部総会 第54 回 日本ウイルス学会九州支部総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Molecular epidemiology of Rotavirus A strains in Nepal, 2005-2011, and whole genome analysis of the predominant G12P[6] strains2017

    • 著者名/発表者名
      Punita Gauchan
    • 学会等名
      The 64th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Molecular epidemiology of Rotavirus A strains in Nepal, 2005-2011, and whole genome analysis of the predominant G12P[6] strains2016

    • 著者名/発表者名
      Punita Gauchan
    • 学会等名
      The 64th annual meeting of the Japanese Society for Virology,
    • 発表場所
      Sapporo Convention Center (Hokkaido, Sapporo)
    • 年月日
      2016-10-23
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2023-03-30  

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