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ナノ地球微生物学:微生物が作り出す酸化鉄ナノ粒子から探る真の元素循環プロセス

研究課題

研究課題/領域番号 16H06180
研究種目

若手研究(A)

配分区分補助金
研究分野 生態・環境
研究機関国立研究開発法人理化学研究所 (2018)
国立研究開発法人海洋研究開発機構 (2016-2017)

研究代表者

加藤 真悟  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 開発研究員 (40554548)

研究協力者 柏原 輝彦  
齋藤 誠史  
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
24,570千円 (直接経費: 18,900千円、間接経費: 5,670千円)
2018年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2017年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2016年度: 15,210千円 (直接経費: 11,700千円、間接経費: 3,510千円)
キーワード鉄酸化菌 / バイオミネラル / ナノ粒子 / 元素循環 / 分離培養 / メタゲノム / バイオ酸化鉄 / バイオミネラリゼーション / ナノ鉱物 / 鉄酸化バクテリア / 酸化鉄ナノ粒子 / ナノバイオ / 微生物 / 生態学 / バイオテクノロジー / 環境分析 / 生理学
研究成果の概要

本研究では、鉄を酸化してエネルギーを得て、その副産物としてナノサイズの酸化鉄を産出するバクテリアに着目して、その生理・生態を明らかにするための研究を行なった。汽水性の鉄酸化細菌を世界で初めて分離培養することに成功し、その存在を明らかにした。淡水・海水性の鉄酸化細菌についても、培養だけでなく、(メタ)ゲノム解析を駆使して、その空間分布や生理機能、多様性について多くの新しい知見を得た。それらの結果に基づいて、鉄酸化菌が産出する酸化鉄が、自然環境中で、鉄、炭素、リンなどの元素循環にどのように寄与しているのかを議論した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ナノサイズの酸化鉄は、膨大な表面積を誇り、そこに銅や鉛など様々な重金属元素を吸着し、自然界では移流によって運ばれることで、吸着した元素のキャリアーとしての役割を果たす。本研究による成果は、自然環境中で、淡水・汽水・海水域のすべてにおいて鉄酸化菌が存在し、そこでの元素循環に関わっていることを示している。ブラックボックス化している自然環境中の元素循環の一端を明らかにしたと言える。また、鉄酸化菌を用いた金属回収や水質浄化技術の基盤構築としても、重要な意義を持つ。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Ferriphaselus amnicola Strain OYT1, a Neutrophilic, Stalk-Forming, Iron-Oxidizing Bacterium2018

    • 著者名/発表者名
      Kato Shingo、Yuki Masahiro、Itoh Takashi、Ohkuma Moriya
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 7 号: 12

    • DOI

      10.1128/mra.00911-18

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genome-enabled metabolic reconstruction of dominant chemosynthetic colonizers in deep-sea massive sulfide deposits2018

    • 著者名/発表者名
      Kato Shingo、Shibuya Takazo、Takaki Yoshihiro、Hirai Miho、Nunoura Takuro、Suzuki Katsuhiko
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology

      巻: 20 号: 2 ページ: 862-877

    • DOI

      10.1111/1462-2920.14032

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-Term Cultivation and Metagenomics Reveal Ecophysiology of Previously Uncultivated Thermophiles Involved in Biogeochemical Nitrogen Cycle2018

    • 著者名/発表者名
      Kato, S., Sakai, S., Hirai, M., Tasumi, E., Nishizawa, M., Suzuki, K. and Takai, K.
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 33 号: 1 ページ: 107-110

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME17165

    • NAID

      130006581753

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Heterogeneity of Microbial Communities on Deep-Sea Ferromanganese Crusts in the Takuyo-Daigo Seamount2018

    • 著者名/発表者名
      S. Kato, T. Okumura, K. Uematsu, M. Hirai, K. Iijima, A. Usui, K. Suzuki
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 33 号: 4 ページ: 366-377

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME18090

    • NAID

      130007553558

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel Pelagic Iron-Oxidizing Zetaproteobacteria from the Chesapeake Bay Oxic-Anoxic Transition Zone2017

    • 著者名/発表者名
      Chiu Beverly K.、Kato Shingo、McAllister Sean M.、Field Erin K.、Chan Clara S.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 8 ページ: 1280-1280

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.01280

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Planktonic marine iron oxidizers drive iron mineralization under low-oxygen conditions2016

    • 著者名/発表者名
      Field EK, Kato S, Findlay AJ, MacDonald DJ, Chiu BK, Luther III GW, Chan CS.
    • 雑誌名

      Geobiology

      巻: 14 号: 5 ページ: 499-508

    • DOI

      10.1111/gbi.12189

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Heterogeneity of microbial life on bathyal and abyssal ferromanganese crusts in the Takuyo-Daigo and Takuyo-Daisan seamounts2018

    • 著者名/発表者名
      加藤 真悟、鈴木 勝彦
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2018年大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 深海環境に生息する磁性細菌の探索と生態と進化の解明2018

    • 著者名/発表者名
      中野 晋作、加藤 真悟、砂村 倫成、幸塚 麻里子、山崎 俊嗣、鈴木 庸平
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2018年大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 中性 pH 付近で生育する微好気性鉄酸化細菌の多様性2018

    • 著者名/発表者名
      加藤真悟,伊藤隆,大熊盛也
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第 25 回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 長期連続培養とメタゲノム解析によって明らかになった未培養性好熱菌の生理生態2018

    • 著者名/発表者名
      Shingo Kato、Sanae Sakai、Miho Hirai、Eiji Tasumi、Manabu Nishizawa、 Katsuhiko Suzuki、Ken Takai
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第32回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 硫化鉱物を「食べる」化学合成生態系が暗くて冷たい深海底に存在する?2017

    • 著者名/発表者名
      加藤 真悟, 鈴木 勝彦
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 深海底熱水域周辺の冷たい海底下環境に存在する「もう一つの化学合成生態系」2017

    • 著者名/発表者名
      加藤真悟
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会 (ConBio2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Novel Fe-oxidizing Zetaproteobacteria floating in the Chesapeake: kinetics and genomic insights into microbial Fe cycling in a stratified marine water column2016

    • 著者名/発表者名
      Chiu B, Field EK, Kato S, Chan CS
    • 学会等名
      AGU Fall Meeting 2016
    • 発表場所
      San Francisco, USA
    • 年月日
      2016-12-12
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] メタゲノム解析により推定した硫化物鉱床に存在する未培養微生物の代謝機能2016

    • 著者名/発表者名
      加藤真悟、鈴木勝彦
    • 学会等名
      第 17 回極限環境生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都目黒区)
    • 年月日
      2016-11-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Metabolic potential of uncultured bacteria in massive sulfide deposits below the deep seafloor revealed by metagenomic analyses2016

    • 著者名/発表者名
      Kato S, Suzuki K
    • 学会等名
      5th International Workshop on Deep-Sea Microbiology
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-09-11
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Nano-sized biogenic iron oxides produced by neutrophilic Fe-oxidizing bacteria and its implications for biogeochemical cycling2016

    • 著者名/発表者名
      加藤真悟
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2016年連合大会
    • 発表場所
      幕張メッセ(千葉県千葉市)
    • 年月日
      2016-05-23
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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