物理刺激で制御される膜蛋白質の分子機構の解明

• 研究課題/領域番号: 16H06294
• 研究種目: 特別推進研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 濡木 理 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (10272460)
• 研究分担者: 伊藤 耕一 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (10262073) ; MATURANA ANDRES 名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (10452004) ; 加藤 英明 東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (80805961) ; 石谷 隆一郎 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任教授 (90361568)
• 研究期間 (年度): 2016-04-26 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2021年度)
• 配分額: 563,290千円 (直接経費: 433,300千円、間接経費: 129,990千円); 2020年度: 87,100千円 (直接経費: 67,000千円、間接経費: 20,100千円); 2019年度: 99,710千円 (直接経費: 76,700千円、間接経費: 23,010千円); 2018年度: 124,800千円 (直接経費: 96,000千円、間接経費: 28,800千円); 2017年度: 111,670千円 (直接経費: 85,900千円、間接経費: 25,770千円); 2016年度: 140,010千円 (直接経費: 107,700千円、間接経費: 32,310千円)
• キーワード: 生物物理 / 電子顕微鏡 / X線 / 蛋白質 / Ｘ線

研究成果の概要

物理刺激（光・音・熱・膜電位・浸透圧）によって制御される膜蛋白質の分子機構を解明した。光受容体に関しては、時分割構造解析によりChRの構造変化を解明した他、Chrimson, HeR, SzR, Rh-PDEといったロドプシンタンパク質の結晶構造を決定し、機能発現の分子機構を解明した。また、音の増幅に関わるPrestin、熱を感受するTRPV3、膜電位を感受するKv4と制御サブユニットの複合体、ATPチャネルCALHM、Cl-チャネルVCCN1、浸透圧を感受するLRRC8の立体構造をクライオ電顕単粒子解析により解明し、それらが機能する分子機構を解明した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

研究開始当初ほぼ未解決であった物理的刺激が膜蛋白質を活性化するメカニズムを解明したことにより、膜蛋白質における輸送制御機構の解明に大きく貢献した。また膜蛋白質は生理学的に重要な機能を持ち、膜蛋白質の変異は重篤な疾病を惹起する。実際、創薬のターゲットの約半数は、膜受容体や膜輸送体であることから、本研究成果は解明した構造に基づいた疾患の治療薬の設計や開発に寄与することが期待される。

評価記号

検証結果 (区分)

A

研究成果

• [国際共同研究] Humboldt-University of Berlin(ドイツ)
• [国際共同研究] 復旦大学(中国)
• [国際共同研究] Vanderbilt University Medical Center(米国)
• [雑誌論文] Structural basis for channel conduction in the pump-like channelrhodopsin ChRmine. (2022)
  • 著者名/発表者名: Koichiro E. Kishi et al.
  • 雑誌名: Cell 巻: 185 号: 4 ページ: 672-689
  • DOI: 10.1016/j.cell.2022.01.007
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cryo-EM reveals mechanistic insights into lipid-facilitated polyamine export by human ATP13A2. (2021)
  • 著者名/発表者名: Tomita, A., Daiho, T., Kusakizako, T., Yamashita, K., Ogasawara, S., Murata, T., Nishizawa, T. and Nureki, O.
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 81 号: 23 ページ: 4799-4809
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2021.11.001
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural basis of gating modulation of Kv4 channel complexes. (2021)
  • 著者名/発表者名: Kise Y, Kasuya G, Okamoto HH, Yamanouchi D, Kobayashi K, Kusakizako T, Nishizawa T, Nakajo K, Nureki O.
  • 雑誌名: Nature 巻: 599 号: 7883 ページ: 158-164
  • DOI: 10.1038/s41586-021-03935-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-EM structure of the human MT1-Gi signaling complex. (2021)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, H. H., Miyauchi, H., Inoue, A., Raimondi, F., Tsujimoto, H., Kusakizako, T., Shihoya, W., Yamashita, K., Suno, R., Nomura, N., Kobayashi, T., Iwata, S., Nishizawa, T. and Nureki, O.
  • 雑誌名: Nat. Struct. Mol. Biol. 巻: 28 号: 8 ページ: 694-701
  • DOI: 10.1038/s41594-021-00634-1
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Cryo-EM structure of the β3-adrenergic receptor reveals the molecular basis of subtype selectivity. (2021)
  • 著者名/発表者名: Nagiri, C., Kobayashi, K., Tomita, A., Kato, M., Kobayashi, K., Yamashita, K., Nishizawa, T., Inoue, A., Shihoya, W. and Nureki, O.
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 81 号: 15 ページ: 3205-3215
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2021.06.024
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Time-resolved serial femtosecond crystallography reveals early structural changes in channelrhodopsin (2021)
  • 著者名/発表者名: Oda Kazumasa、Nomura Takashi、Nakane Takanori、Yamashita Keitaro、Inoue Keiichi、Ito Shota、Vierock Johannes、Hirata Kunio、Maturana Andres D、Katayama Kota、( 32 authers )、Kandori Hideki、Hegemann Peter、Iwata So、Kubo Minoru、Nishizawa Tomohiro、Nureki Osamu
  • 雑誌名: eLife 巻: 10 ページ: 1-21
  • DOI: 10.7554/elife.62389
  • NAID: 120006996980
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural insights into the mechanism of rhodopsin phosphodiesterase (2020)
  • 著者名/発表者名: Ikuta T, Shihoya W, Sugiura M, Yoshida K, Watari M, Tokano T, Yamashita K, Katayama K, Tsunoda SP, Uchihashi T, Kandori H and Nureki O.
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 11 号: 1 ページ: 5605-5605
  • DOI: 10.1038/s41467-020-19376-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis for unique color tuning mechanism in heliorhodopsin (2020)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Tatsuki、Singh Manish、Shihoya Wataru、Yamashita Keitaro、Kandori Hideki、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 533 号: 3 ページ: 262-267
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.06.124
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cryo-EM structures of calcium homeostasis modulator channels in diverse oligomeric assemblies (2020)
  • 著者名/発表者名: Demura Kanae*、Kusakizako Tsukasa*、Shihoya Wataru*、Hiraizumi Masahiro*、Nomura Kengo、Shimada Hiroto、Yamashita Keitaro、Nishizawa Tomohiro、Taruno Akiyuki、Nureki Osamu (*equal contribution)
  • 雑誌名: Science Advances 巻: 6 号: 29
  • DOI: 10.1126/sciadv.aba8105
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The structure of lipid nanodisc-reconstituted TRPV3 reveals the gating mechanism (2020)
  • 著者名/発表者名: Shimada Hiroto*、Kusakizako Tsukasa*、Dung Nguyen T. H.、Nishizawa Tomohiro、Hino Tomoya、Tominaga Makoto、Nureki Osamu (*equal contribution)
  • 雑誌名: Nature Structural & Molecular Biology 巻: 27 号: 7 ページ: 645-652
  • DOI: 10.1038/s41594-020-0439-z
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Cryo-EM structure of the volume-regulated anion channel LRRC8D isoform identifies features important for substrate permeation (2020)
  • 著者名/発表者名: Nakamura Ryoki、Numata Tomohiro、Kasuya Go、Yokoyama Takeshi、Nishizawa Tomohiro、Kusakizako Tsukasa、Kato Takafumi、Hagino Tatsuya、Dohmae Naoshi、Inoue Masato、Watanabe Kengo、Ichijo Hidenori、Kikkawa Masahide、Shirouzu Mikako、Jentsch Thomas J.、Ishitani Ryuichiro、Okada Yasunobu、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 3 号: 1 ページ: 240-240
  • DOI: 10.1038/s42003-020-0951-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural insights into tetraspanin CD9 function (2020)
  • 著者名/発表者名: Umeda Rie、Satouh Yuhkoh、Takemoto Mizuki、Nakada-Nakura Yoshiko、Liu Kehong、Yokoyama Takeshi、Shirouzu Mikako、Iwata So、Nomura Norimichi、Sato Ken、Ikawa Masahito、Nishizawa Tomohiro、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 11 号: 1 ページ: 643-651
  • DOI: 10.1038/s41467-020-15459-7
  • NAID: 120006957458
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Crystal structure of human endothelin ETB receptor in complex with sarafotoxin S6b (2020)
  • 著者名/発表者名: T. Izume, H. Miyauchi, W. Shihoya and O. Nureki.
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 528(2) 号: 2 ページ: 383-388
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.12.091
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ultrafast Dynamics of Heliorhodopsins (2019)
  • 著者名/発表者名: Tahara Shinya、Singh Manish、Kuramochi Hikaru、Shihoya Wataru、Inoue Keiichi、Nureki Osamu、B?j? Oded、Mizutani Yasuhisa、Kandori Hideki、Tahara Tahei
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: 123 号: 11 ページ: 2507-2512
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b00887
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Crystallization of the human tetraspanin protein CD9 (2019)
  • 著者名/発表者名: R. Umeda, T. Nishizawa, O. Nureki.
  • 雑誌名: Acta. Crystallogr. F. Struct. Biol. Commun. 巻: 75 号: 4 ページ: 254-259
  • DOI: 10.1107/s2053230x1801840x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for oligomerization of the prokaryotic peptide transporter PepTSo2 (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagamura Reina、Fukuda Masahiro、Kawamoto Akihiro、Matoba Kyoko、Dohmae Naoshi、Ishitani Ryuichiro、Takagi Junichi、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 巻: 75 号: 5 ページ: 348-358
  • DOI: 10.1107/s2053230x19003546
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-EM structure of the human L-type amino acid transporter 1 in complex with glycoprotein CD98hc (2019)
  • 著者名/発表者名: Lee Yongchan、Wiriyasermkul Pattama、Jin Chunhuan、Quan Lili、Ohgaki Ryuichi、Okuda Suguru、Kusakizako Tsukasa、Nishizawa Tomohiro、Oda Kazumasa、Ishitani Ryuichiro、Yokoyama Takeshi、Nakane Takanori、Shirouzu Mikako、Endou Hitoshi、Nagamori Shushi、Kanai Yoshikatsu、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature Structural & Molecular Biology 巻: 26 号: 6 ページ: 510-517
  • DOI: 10.1038/s41594-019-0237-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of human endothelin ETB receptor in complex with peptide inverse agonist IRL2500 (2019)
  • 著者名/発表者名: Nagiri Chisae、Shihoya Wataru、Inoue Asuka、Kadji Francois Marie Ngako、Aoki Junken、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 2 号: 1 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1038/s42003-019-0482-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cryo-EM structures capture the transport cycle of the P4-ATPase flippase (2019)
  • 著者名/発表者名: M. Hiraizumi, K. Yamashita, T. Nishizawa and O. Nureki.
  • 雑誌名: Science 巻: 365 号: 6458 ページ: 1149-1155
  • DOI: 10.1126/science.aay3353
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of heliorhodopsin (2019)
  • 著者名/発表者名: W. Shihoya, K. Inoue, M. Singh, M. Konno, S. Hososhima, K. Yamashita, K. Ikeda, A. Higuchi, T. Izume, Okazaki S, Hashimoto M, Mizutori R, Tomida S, Yamauchi Y, Abe-Yoshizumi R, K. Katayama, SP. Tsunoda, M. Shibata, Y. Furutani, A. Pushkarev, O. Béjà, T. Uchihashi, H. Kandori, O. Nureki
  • 雑誌名: Nature 巻: 574 号: 7776 ページ: 132-136
  • DOI: 10.1038/s41586-019-1604-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The bacterial protein YidC accelerates MPIase-dependent integration of membrane proteins (2019)
  • 著者名/発表者名: Sasaki Masaru、Nishikawa Hanako、Suzuki Sonomi、Moser Michael、Huber Maria、Sawasato Katsuhiro、Matsubayashi Hideaki T.、Kumazaki Kaoru、Tsukazaki Tomoya、Kuruma Yutetsu、Nureki Osamu、Ueda Takuya、Nishiyama Ken-ichi
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 294 号: 49 ページ: 18898-18908
  • DOI: 10.1074/jbc.ra119.011248
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] TMC1 and TMC2 Proteins Are Pore-Forming Subunits of Mechanosensitive Ion Channels (2019)
  • 著者名/発表者名: Y, Jia, Y. Zhao, T. Kusakizako, Y. Wang, C. Pan, Y. Zhang, O. Nureki, M. Hattori and Z. Yan.
  • 雑誌名: Neuron 巻: 105 号: 2 ページ: 310-321
  • DOI: 10.1016/j.neuron.2019.10.017
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Structural Basis of H+-Dependent Conformational Change in a Bacterial MATE Transporter (2019)
  • 著者名/発表者名: Kusakizako Tsukasa、Claxton Derek P.、Tanaka Yoshiki、Maturana Andrs D.、Kuroda Teruo、Ishitani Ryuichiro、Mchaourab Hassane S.、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Structure 巻: 27 号: 2 ページ: 293-301
  • DOI: 10.1016/j.str.2018.10.004
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Spectroscopic study of the transmembrane domain of a rhodopsin-phosphodiesterase fusion protein from a unicellular eukaryote (2019)
  • 著者名/発表者名: M. Watari, T. Ikuta, D. Yamada, W. Shihoya, K. Yoshida, S. P. Tsunoda, O. Nureki, and H. Kandori
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 294 号: 10 ページ: 3432-3443
  • DOI: 10.1074/jbc.ra118.006277
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of the Agrobacterium tumefaciens type VI effector-immunity complex. (2018)
  • 著者名/発表者名: Fukuhara S, Nakane T, Yamashita K, Ishii R, Ishitani R, Nureki O
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun. 巻: 74 号: 3 ページ: 810-816
  • DOI: 10.1038/s41477-019-0367-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cap-specific terminal N6-methylation of RNA by an RNA polymerase II?associated methyltransferase (2018)
  • 著者名/発表者名: Akichika Shinichiro、Hirano Seiichi、Shichino Yuichi、Suzuki Takeo、Nishimasu Hiroshi、Ishitani Ryuichiro、Sugita Ai、Hirose Yutaka、Iwasaki Shintaro、Nureki Osamu、Suzuki Tsutomu
  • 雑誌名: Science 巻: 363 号: 363 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1126/science.aav0080
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Crystal structures of human ETB receptor provide mechanistic insight into receptor activation and partial activation (2018)
  • 著者名/発表者名: Shihoya Wataru、Izume Tamaki、Inoue Asuka、Yamashita Keitaro、Kadji Francois Marie Ngako、Hirata Kunio、Aoki Junken、Nishizawa Tomohiro、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 9 号: 1 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1038/s41467-018-07094-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-EM structures of the human volume-regulated anion channel LRRC8 (2018)
  • 著者名/発表者名: Kasuya G, Nakane T, Yokoyama T, Jia Y, Inoue M, Watanabe K, Nakamura R, Nishizawa T, Kusakizako T, Tsutsumi A, Yanagisawa H, Dohmae N, Hattori M, Ichijo H, Yan Z, Kikkawa M, Shirouzu M, Ishitani R, Nureki O
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol. 巻: 25 号: 9 ページ: 797-804
  • DOI: 10.1038/s41594-018-0109-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Crystallographic Analysis of MATE-Type Multidrug Exporter with Its Inhibitors. (2018)
  • 著者名/発表者名: Kusakizako T, Tanaka Y, Hipolito CJ, Suga H, Nureki O.
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 1700 ページ: 37-57
  • DOI: 10.1007/978-1-4939-7454-2_3
  • ISBN: 9781493974528, 9781493974542
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Functional roles of Mg2+ binding sites in ion-dependent gating of a Mg2+ channel, MgtE, revealed by solution NMR (2018)
  • 著者名/発表者名: Maruyama Tatsuro、Imai Shunsuke、Kusakizako Tsukasa、Hattori Motoyuki、Ishitani Ryuichiro、Nureki Osamu、Ito Koichi、Maturana Andr?s D、Shimada Ichio、Osawa Masanori
  • 雑誌名: eLife 巻: 7
  • DOI: 10.7554/elife.31596
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Free Energy Landscape for the Entire Transport Cycle of Triose-Phosphate/Phosphate Translocator (2018)
  • 著者名/発表者名: Takemoto M, Lee Y, Ishitani R, Nureki O
  • 雑誌名: Structure 巻: 26 号: 9 ページ: 1284-1296
  • DOI: 10.1016/j.str.2018.05.012
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An Atomistic Model of a Precursor State of Light-Induced Channel Opening of Channelrhodopsin (2018)
  • 著者名/発表者名: Cheng Cheng, Motoshi Kamiya, Mizuki Takemoto, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki, *Norio Yoshida, and *Shigehiko Hayashi
  • 雑誌名: Biophysical Journal 巻: 115 号: 7 ページ: 1281-1291
  • DOI: 10.1016/j.bpj.2018.08.024
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Vibrational and Molecular Properties of Mg2+ Binding and Ion Selectivity in the Magnesium Channel MgtE (2018)
  • 著者名/発表者名: Kimura Tetsunari、Lorenz-Fonfria Victor A.、Douki Shintaro、Motoki Hideyoshi、Ishitani Ryuichiro、Nureki Osamu、Higashi Masahiro、Furutani Yuji
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: 122 号: 42 ページ: 9681-9696
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b07967
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of the red light-activated channelrhodopsin Chrimson (2018)
  • 著者名/発表者名: Oda Kazumasa、Vierock Johannes、Oishi Satomi、Rodriguez-Rozada Silvia、Taniguchi Reiya、Yamashita Keitaro、Wiegert J. Simon、Nishizawa Tomohiro、Hegemann Peter、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 9 号: 1 ページ: 3949-3949
  • DOI: 10.1038/s41467-018-06421-9
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Resonance Raman Investigation of the Chromophore Structure of Heliorhodopsins (2018)
  • 著者名/発表者名: Otomo Akihiro、Mizuno Misao、Singh Manish、Shihoya Wataru、Inoue Keiichi、Nureki Osamu、B?j? Oded、Kandori Hideki、Mizutani Yasuhisa
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry Letters 巻: 9 号: 22 ページ: 6431-6436
  • DOI: 10.1021/acs.jpclett.8b02741
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Structural insights into the nucleotide base specificity of P2X receptors. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kasuya G, Fujiwara Y, Tsukamoto H, Morinaga S, Ryu S, Touhara K, Ishitani R, Furutani Y, Hattori M, Nureki O.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 7 号: 1 ページ: 45208-45208
  • DOI: 10.1038/srep45208
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] ATP-dependent modulation of MgtE in Mg2+ homeostasis (2017)
  • 著者名/発表者名: Tomita Atsuhiro、Zhang Mingfeng、Jin Fei、Zhuang Wenhui、Takeda Hironori、Maruyama Tatsuro、Osawa Masanori、Hashimoto Ken-ichi、Kawasaki Hisashi、Ito Koichi、Dohmae Naoshi、Ishitani Ryuichiro、Shimada Ichio、Yan Zhiqiang、Hattori Motoyuki、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 8 号: 1 ページ: 148-148
  • DOI: 10.1038/s41467-017-00082-w
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural insights into ligand recognition by the lysophosphatidic acid receptor LPA6 (2017)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi Reiya、Inoue Asuka、Sayama Misa、Uwamizu Akiharu、Yamashita Keitaro、Hirata Kunio、Yoshida Masahito、Tanaka Yoshiki、Kato Hideaki E.、Nakada-Nakura Yoshiko、Otani Yuko、Nishizawa Tomohiro、Doi Takayuki、Ohwada Tomohiko、Ishitani Ryuichiro、Aoki Junken、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature 巻: 548 号: 7667 ページ: 356-360
  • DOI: 10.1038/nature23448
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] X-ray structures of endothelin ETB receptor bound to clinical antagonist bosentan and its analog (2017)
  • 著者名/発表者名: Shihoya Wataru、Nishizawa Tomohiro、Yamashita Keitaro、Inoue Asuka、Hirata Kunio、Kadji Francois Marie Ngako、Okuta Akiko、Tani Kazutoshi、Aoki Junken、Fujiyoshi Yoshinori、Doi Tomoko、Nureki Osamu
  • 雑誌名: Nature Structural & Molecular Biology 巻: 24 号: 9 ページ: 758-764
  • DOI: 10.1038/nsmb.3450
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of the triose-phosphate/phosphate translocator reveals the basis of substrate specificity. (2017)
  • 著者名/発表者名: Lee Y, Nishizawa T, Takemoto M, Kumazaki K, Yamashita K, Hirata K, Minoda A, Nagatoishi S, Tsumoto K, Ishitani R and Nureki O.
  • 雑誌名: Nature Plants. 巻: 3 号: 10 ページ: 825-832
  • DOI: 10.1038/s41477-017-0022-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural insights into the competitive inhibition of the ATP-gated P2X receptor channel (2017)
  • 著者名/発表者名: Kasuya G, Yamaura T, Ma XB, Nakamura R, Takemoto M, Nagumo H, Tanaka E, Dohmae N, Nakane T, Yu Y, Ishitani R, Matsuzaki O, Hattori M, Nureki O
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 8 号: 1 ページ: 876-876
  • DOI: 10.1038/s41467-017-00887-9
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis for xenobiotics extrusion by eukaryotic MATE transporter. (2017)
  • 著者名/発表者名: Miyauchi H., Moriyama S., Kusakizako T., Kumazaki K., Ito K., Dohmae N., Nishizawa T., Miyaji T., Moriyama Y., Ishitani R., Nureki O.
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 8 号: 1 ページ: 1633-1633
  • DOI: 10.1038/s41467-017-01541-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural Insights into Divalent Cation Modulations of ATP-Gated P2X Receptor Channels (2016)
  • 著者名/発表者名: Kasuya, G., Y. Fujiwara, M. Takemoto, N. Dohmae, Y. Nakada-Nakura, R. Ishitani, M. Hattori, and O. Nureki
  • 雑誌名: Cell Report 巻: 14 号: 4 ページ: 932-944
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2015.12.087
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structure and biological function of ENPP6, a choline-specific glycerophosphodiester-phosphodiesterase (2016)
  • 著者名/発表者名: Morita J, Kano K, Kato K, Takita H, Skagami H, Yamamoto Y, Mihara E, Ueda H, Sato T, Tokuyama H, Arai H, Asou H, Takagi J, Ishitani R, Nishimasu H, Nureki O, Aoki J
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 20995-20995
  • DOI: 10.1038/srep20995
  • URL: https://localhost/en/publications/d1085467-bb47-4f70-98b0-09d6a10814d8
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Redox-coupled structural changes in nitrite reductase revealed by serial femtosecond and microfocus crystallography. (2016)
  • 著者名/発表者名: Fukuda Y, Tse KM, Suzuki M, Diederichs K, Hirata K, Nakane T, Sugahara M, Nango E, Tono K, Joti Y, Kameshima T, Song C, Hatsui T, Yabashi M, Nureki O, Matsumura H, Inoue T, Iwata S, Mizohata E.
  • 雑誌名: J. Biochem 巻: 未定 号: 5 ページ: 527-538
  • DOI: 10.1093/jb/mvv133
  • NAID: 40020833586
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis for amino-acid export by DMT superfamily transporter YddG (2016)
  • 著者名/発表者名: H. Tsuchiya, S. Doki, M. Takemoto, T. Ikuta, T. Higuchi, K. Fukui, Y. Usuda, E. Tabuchi, S. Nagatoishi, K. Tsumoto, T. Nishizawa, K. Ito, N. Dohmae, R. Ishitani and O. Nureki
  • 雑誌名: Nature 巻: 534 号: 7607 ページ: 417-420
  • DOI: 10.1038/nature17991
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural and functional insights into IZUMO1 recognition by JUNO in mammalian fertilization. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kato K, Satouh Y, Nishimasu H, Kurabayashi A, Morita J, Fujihara Y, Oji A, Ishitani R, Ikawa M, Nureki O.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 7 号: 1 ページ: 12198-12198
  • DOI: 10.1038/ncomms12198
  • NAID: 120006957420
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of the plant receptor-like kinase TDR in complex with the TDIF peptide. (2016)
  • 著者名/発表者名: Morita, J., Kato, K., Nakane, T., Kondo, Y., Fukuda, H., Nishimasu, H., *Ishitani, R. and *Nureki, O.
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 7 号: 1 ページ: 12383-12383
  • DOI: 10.1038/ncomms12383
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Activation mechanism of endothelin ETB receptor by endothelin-1. (2016)
  • 著者名/発表者名: W. Shihoya, T. Nishizawa, A. Okuta, K. Tani, N. Dohmae, Y. Fujiyoshi, O. Nureki and T. Doi
  • 雑誌名: Nature 巻: 537 号: 7620 ページ: 363-368
  • DOI: 10.1038/nature19319
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] "Role of Asn112 in a light-driven sodium ion-pumping rhodopsin" (2016)
  • 著者名/発表者名: R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, H. E. Kato, O. Nureki, H. Kandori*
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 55 号: 41 ページ: 5790-5797
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.6b00741
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal structures of the TRIC trimeric intracellular cation channel orthologues. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kasuya G, Hiraizumi M, Maturana AD, Kumazaki K, Fujiwara Y, Liu K, Nakada-Nakura Y, Iwata S, Tsukada K, Komori T, Uemura S, Goto Y, Nakane T, Takemoto M, Kato HE, Yamashita K, Wada M, Ito K, Ishitani R, Hattori M, Nureki O.
  • 雑誌名: Cell Res. 巻: 26 号: 12 ページ: 1288-1301
  • DOI: 10.1038/cr.2016.140
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡解析で見えてきた膜タンパク質の分子機構 (2021)
  • 著者名/発表者名: 濡木理
  • 学会等名: 横浜NMR研究会オンライン
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡解析で見えてきた膜タンパク質の分子機構 (2020)
  • 著者名/発表者名: 濡木理
  • 学会等名: Science Cafe オンライン
• [学会発表] Structural Basis for Transport Cycle of P4 Flippase (2020)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: 64th Annual Meeting of the Biophysical Society,2/15 (San Diego, USA)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural insight into the ligand recruitment and recognition mechanisms of lysophosphatidic acid receptor LPA6 (2019)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: GPCR Workshop,12/1-5 (Hawaii, USA)
  • 国際学会
• [学会発表] Structural Insights into Tetraspanin Function (2019)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: AsCA2019,12/17-20 (Singapor)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Ligand Recognition and Activation Mechanisms of Peptide and Lipid Recognizing G Protein-Coupled Receptor (2018)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: Gordon Research Conference (California, USA)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cryo-EM structure of the volume-regulated anion channel LRRC8 (2018)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: International Conference of the Korean Society for Structural Biology (Jeju Island)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Ligand Recognition and Activation Mechanisms of Peptide and Lipid Recognizing G Protein-Coupled Receptor (2018)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: Gordon Research Conference: Ligand Recognition and Molecular Gating
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cryo-EM structure of the volume-regulated anion channel LRRC8 (2018)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: International Conference of the Korean Society for Structural Biology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural study of volume-regulated anion channel, LRRC8 (2018)
  • 著者名/発表者名: 濡木理
  • 学会等名: 第41回分子生物学会年会：クライオ電顕が見せる超分子の世界
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Molecular mechanism of Channelrhodopsin and structure-guided development of useful optogenetics tool (2018)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: International Symposium of OptoBioTechnology Research Center
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 新規膜チャネル・トランスポーターの分子機構の構造基盤 (2018)
  • 著者名/発表者名: 濡木理
  • 学会等名: 第92回日本薬理学会年会 特別講演
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular mechanism of Channelrhodopsin and structure-guided development of useful optogenetics tool (2018)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: A decade after “Discovery and Development of GFP”
• [学会発表] High-resolution X-ray Crystallography and Molecular Mechanisms of Membrane Transporters (2017)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: International conference on structural biology 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural basis for molecular mechanisms of new family transporters (2017)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: Biomedical Transporters
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Molecular mechanism of the Mg2+ channel MgtE for Mg2+ and ATP homeostasis (2017)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: IUCr2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Ligand Recognition and Activation Mechanisms of Peptide and Lipid Recognizing G Protein-Coupled Receptor (2017)
  • 著者名/発表者名: Osamu Nureki
  • 学会等名: Gordon Research Conference: Ligand Recognition and Molecular Gating
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] High-resolution X-ray Crystallography of Membrane Proteins and Molecular Mechanisms of Membrane Transporters (2016)
  • 著者名/発表者名: O. Nureki
  • 学会等名: KVA-JSPS seminar
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] High-resolution X-ray Crystallography of Membrane Proteins and Molecular Mechanisms of Membrane Transporters (2016)
  • 著者名/発表者名: O. Nureki
  • 学会等名: 16th International Conference on the Crystallization of Biological MacromoleculesPraha(Praha,Czech Republic)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 薬剤などの輸送に働くトランスポーターの分子機構 (2016)
  • 著者名/発表者名: O. Nureki
  • 学会等名: 千里ライフサイエンスセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Structure and function, and structure-based drug design of ATX-ENPP2 signaling axis (2016)
  • 著者名/発表者名: O. Nureki
  • 学会等名: 第89回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] Light driven dosium ion pump KR2: emerging new player in the field of rhodopsin research (2016)
  • 著者名/発表者名: O. Nureki
  • 学会等名: EMBO Conference: 17th International Conference on Retinal Proteins
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] 濡木研究室HP
  • URL: http://www.nurekilab.net/index.php/ja?FrontPage
• [備考] 濡木研究室
  • URL: http://www.nurekilab.net/
• [備考] 東大、光駆動型イオンチャネルであるチャネルロドプシンの吸収波長シフトのしくみを解明
  • URL: http://release.nikkei.co.jp/attach_file/0491524_01.pdf
• [備考] 細胞の体積調節に関わる膜輸送体の構造を解明
  • URL: https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2018/6007/
• [備考]
  • URL: http://www.nurekilab.net/