個別化医療の開発のための統計的方法論の構築とその実践に関する総合的研究

• 研究課題/領域番号: 16H06299
• 研究種目: 基盤研究(S)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 統計科学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 松井 茂之 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (80305854)
• 研究分担者: 山田 誠 京都大学, 情報学研究科, 准教授 (00581323) ; 角田 達彦 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (10273468) ; 山下 智志 統計数理研究所, データ科学研究系, 教授 (50244108) ; 服部 聡 大阪大学, 医学系研究科, 教授 (50425154)
• 研究期間 (年度): 2016-05-31 – 2021-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 113,750千円 (直接経費: 87,500千円、間接経費: 26,250千円); 2020年度: 24,960千円 (直接経費: 19,200千円、間接経費: 5,760千円); 2019年度: 24,440千円 (直接経費: 18,800千円、間接経費: 5,640千円); 2018年度: 23,010千円 (直接経費: 17,700千円、間接経費: 5,310千円); 2017年度: 20,150千円 (直接経費: 15,500千円、間接経費: 4,650千円); 2016年度: 21,190千円 (直接経費: 16,300千円、間接経費: 4,890千円)
• キーワード: 統計科学 / 生物統計学 / 機械学習 / 個別化医療 / 臨床研究 / 研究デザイン / データ解析 / 社会医学 / 薬剤反応性 / 臨床試験 / 統計解析 / 診断法開発 / 統計数学

研究成果の概要

個々の疾患の分子的特性を踏まえて診断・治療を行う個別化医療の臨床開発のための統計・機械学習の方法・ツールを開発し、同時に幅広い疾患領域を対象とした多くの事例研究を実施した。診断法の開発と評価、診断法に基づく治療法の有効性の検証、診断法に基づく個別化医療のエビデンスの統合、医療現場での治療の意思決定までを包括的に研究対象とすることで、個別化医療の臨床開発の様々な現場で真に役立つ統計・機械学習の方法論を構築した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

個別化医療の臨床開発のための統計・機械学習の方法論の構築は、統計科学・情報学の発展につながり、健康医療領域での統計科学・情報学の応用研究の発展にもつながる。一方、個別化医療の開発に役立つ統計・機械学習の方法論を構築することで、限られた医療資源を用いた個別化医療開発の効率性、成功確率の向上につながり、個別化医療の推進に直接的に貢献する。

評価記号

検証結果 (区分)

A

研究成果

• [国際共同研究] Cancer Research & Biostatistics(米国)
• [国際共同研究] Newcastle University/University of Cambridge(英国)
• [国際共同研究] Cancer Research And Biostatistics/Fred Hutchinson Cancer Research Center/Oregon Health & Science University(米国)
• [国際共同研究] Newcastle University(英国)
• [国際共同研究] Cancer Research And Biostatistics/Fred Hutchinson Cancer Research Center/Oregon Health & Science University(米国)
• [国際共同研究] Cancer Research and Biostatistics/University of Washington/National Cancer Institute(米国)
• [国際共同研究] EORTC(ベルギー)
• [国際共同研究] Gustave Roussy & INSERM CESP(フランス)
• [国際共同研究] Cancer Research and Biostatistics/University of Washington/National Cancer Institute(米国)
• [雑誌論文] Semi-parametric empirical Bayes factor for genome-wide association studies (2021)
  • 著者名/発表者名: Morisawa Junji、Otani Takahiro、Nishino Jo、Emoto Ryo、Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki
  • 雑誌名: European Journal of Human Genetics 巻: 29 号: 5 ページ: 800-807
  • DOI: 10.1038/s41431-020-00800-x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prognostic value of desmoplastic reaction characterisation in stage II colon cancer: prospective validation in a Phase 3 study (SACURA Trial) (2021)
  • 著者名/発表者名: Ueno Hideki、Ishiguro Megumi、Nakatani Eiji、Ishikawa Toshiaki、Uetake Hiroyuki、Murotani Kenta、Matsui Shigeyuki、Teramukai Satoshi、Sugai Tamotsu、Ajioka Yoichi、Maruo Hirotoshi、Kotaka Masahito、Tsujie Masaki、Munemoto Yoshinori、Yamaguchi Takashi、Kuroda Hisashi、Fukunaga Mutsumi、Tomita Naohiro、Sugihara Kenichi
  • 雑誌名: British Journal of Cancer 巻: 124 号: 6 ページ: 1088-1097
  • DOI: 10.1038/s41416-020-01222-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Statistical models in clinical studies (2021)
  • 著者名/発表者名: Matsui S, Le-Rademacher J, Mandrekar SJ
  • 雑誌名: J Thorac Oncol 巻: 16 号: 5 ページ: 734-739
  • DOI: 10.1016/j.jtho.2021.02.021
  • NAID: 120007178398
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] A large-scale multi-institutional study evaluating prognostic aspects of positive ascites cytology and effects of therapeutic interventions in epithelial ovarian cancer (2021)
  • 著者名/発表者名: Yoshihara Masato、Emoto Ryo、Kitami Kazuhisa、Iyoshi Shohei、Uno Kaname、Mogi Kazumasa、Tano Sho、Yoshikawa Nobuhisa、Matsui Shigeyuki、Kajiyama Hiroaki
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 15154-15154
  • DOI: 10.1038/s41598-021-93718-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] DeepFeature: feature selection in nonimage data using convolutional neural network (2021)
  • 著者名/発表者名: Sharma Alok、Lysenko Artem、Boroevich Keith A、Vans Edwin、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Briefings in Bioinformatics 巻: 22 号: 6
  • DOI: 10.1093/bib/bbab297
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Blinded sample size re-estimation in comparative clinical trials with overdispersed count data: Incorporation of misspecification of the variance function (2021)
  • 著者名/発表者名: Igeta M, Matsui S
  • 雑誌名: Stat Biopharm Res 巻: 13 号: 2 ページ: 170-180
  • DOI: 10.1080/19466315.2020.1835711
  • 査読あり
• [雑誌論文] Outcome related to level of targeted temperature management in postcardiac arrest syndrome of low, moderate, and high severities: A nationwide multicenter prospective registry (2021)
  • 著者名/発表者名: Nishikimi M, Ogura T, Nishida K, Hayashida K, Emoto R, Matsui S, Matsuda N, Iwami T
  • 雑誌名: Crit Care Med 巻: 49 号: 8 ページ: e741-e750
  • DOI: 10.1097/ccm.0000000000005025
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect-size estimation using semiparametric hierarchical mixture models in disease-association studies with neuroimaging data (2020)
  • 著者名/発表者名: Emoto R, Kawaguchi A, Takahashi K, Matsui S.
  • 雑誌名: Computational and Mathematical Methods in Medicine 巻: - ページ: 7482403-7482403
  • DOI: 10.1155/2020/7482403
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Optimal Criteria for G3 (Poorly Differentiated) Stage II Colon Cancer (2020)
  • 著者名/発表者名: Ueno Hideki、Ishiguro Megumi、Nakatani Eiji、Ishikawa Toshiaki、Uetake Hiroyuki、Matsui Shigeyuki、Teramukai Satoshi、Murotani Kenta、Ajioka Yoichi、Shimazaki Hideyuki、Maeda Atsuyuki、Takuma Kunio、Yoshida Takefumi、Kambara Takeshi、Matsuda Keiji、Takagane Akinori、Tomita Naohiro、Sugihara Kenichi
  • 雑誌名: American Journal of Surgical Pathology 巻: 44 号: 12 ページ: 1685-1698
  • DOI: 10.1097/pas.0000000000001570
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The PD-1 expression balance between effector and regulatory T cells predicts the clinical efficacy of PD-1 blockade therapies (2020)
  • 著者名/発表者名: Kumagai S,Togashi Y,Kamada T,Sugiyama E,Nishinakamura H,Takeuchi Y,Vitaly K,Itahashi K,Maeda Y,Matsui S,Shibahara T,Yamashita Y,Irie T,Tsuge A,Fukuoka S,Kawazoe A,Udagawa H,Kirita K,Aokage K,Ishii G,Kuwata T,Nakama K,Kawazu M,Ueno T,Yamazaki N,Goto K,Tsuboi M,Mano H,Doi T,Shitara K,Nishikawa H
  • 雑誌名: Nature Immunology 巻: 21 号: 11 ページ: 1346-1358
  • DOI: 10.1038/s41590-020-0769-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Impact of uterus‐preserving surgery on Stage I primary mucinous epithelial ovarian carcinoma: A multi‐institutional study with propensity score‐weighted analysis (2020)
  • 著者名/発表者名: Yoshihara Masato、Kajiyama Hiroaki、Tamauchi Satoshi、Iyoshi Shohei、Yokoi Akira、Suzuki Shiro、Kawai Michiyasu、Nagasaka Tetsuro、Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki、Kikkawa Fumitaka
  • 雑誌名: International Journal of Gynecology & Obstetrics 巻: 150 号: 2 ページ: 177-183
  • DOI: 10.1002/ijgo.13244
  • 査読あり
• [雑誌論文] Doubly robust inference procedure for relative survival ratio in population‐based cancer registry data (2020)
  • 著者名/発表者名: Komukai Sho、Hattori Satoshi
  • 雑誌名: Statistics in Medicine 巻: - 号: 13 ページ: 1884-1900
  • DOI: 10.1002/sim.8521
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prognostic impact of pelvic and para-aortic lymphadenectomy on clinically-apparent stage I primary mucinous epithelial ovarian carcinoma: a multi-institutional study with propensity score-weighted analysis (2020)
  • 著者名/発表者名: Yoshihara Masato、Kajiyama Hiroaki、Tamauchi Satoshi、Iyoshi Shohei、Yokoi Akira、Suzuki Shiro、Kawai Michiyasu、Nagasaka Tetsuro、Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki、Kikkawa Fumitaka
  • 雑誌名: Japanese Journal of Clinical Oncology 巻: 50 ページ: 145-151
  • DOI: 10.1093/jjco/hyz163
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantification of multicellular colonization in tumor metastasis using exome‐sequencing data (2020)
  • 著者名/発表者名: Nishino Jo、Watanabe Shuichi、Miya Fuyuki、Kamatani Takashi、Sugawara Toshitaka、Boroevich Keith A.、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: International Journal of Cancer 巻: 146 号: 9 ページ: 2488-2497
  • DOI: 10.1002/ijc.32910
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Statistical testing strategies for assessing treatment efficacy and marker accuracy in phase III trials (2019)
  • 著者名/発表者名: Nonaka Takahiro、Igeta Masataka、Matsui Shigeyuki
  • 雑誌名: Pharmaceutical Statistics 巻: 18 号: 4 ページ: 459-475
  • DOI: 10.1002/pst.1937
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of novel diagnostic system for pancreatic cancer, including early stages, measuring mRNA of whole blood cells (2019)
  • 著者名/発表者名: Sakai Yoshio、Honda Masao、Matsui Shigeyuki、Komori Osamu、Murayama Toshinori、Fujiwara Tadami、Mizuno Masaaki、Imai Yasuhito、Yoshimura Kenichi、Nasti Alessandro、Wada Takashi、Iida Noriho、Kitahara Masaaki、Horii Rika、Toshikatsu Tamai、Nishikawa Masashi、Okafuji Hirofumi、Mizukoshi Eishiro、et al
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 110 号: 4 ページ: 1364-1388
  • DOI: 10.1111/cas.13971
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Two‐stage analysis for selecting fixed numbers of features in omics association studies (2019)
  • 著者名/発表者名: Kawabata Takanori、Emoto Ryo、Nishino Jo、Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki
  • 雑誌名: Statistics in Medicine 巻: 38 号: 16 ページ: 2956-2971
  • DOI: 10.1002/sim.8150
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clinical Frailty Scale Score Before ICU Admission Is Associated With Mobility Disability in Septic Patients Receiving Early Rehabilitation (2019)
  • 著者名/発表者名: Nakajima Hiroki、Nishikimi Mitsuaki、Shimizu Miho、Hayashi Kazuhiro、Inoue Takayuki、Nishida Kazuki、Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki、Nishida Yoshihiro、Matsuda Naoyuki
  • 雑誌名: Critical Care Explorations 巻: 1 号: 12 ページ: e0066-e0066
  • DOI: 10.1097/cce.0000000000000066
  • 査読あり
• [雑誌論文] A randomised controlled trial of pectoral nerve‐2 (PECS2) block vs. serratus plane block for chronic pain after mastectomy (2019)
  • 著者名/発表者名: Fujii Tasuku、Shibata Yasuyuki、Akane Akiko、Aoki Wakana、Sekiguchi Akiko、 Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki、Nishiwaki Kimitoshi
  • 雑誌名: Anaesthesia 巻: 74 号: 12 ページ: 1558-1562
  • DOI: 10.1111/anae.14856
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prognostic factors and effects of fertility-sparing surgery in women of reproductive age with ovarian clear-cell carcinoma: a propensity score analysis (2019)
  • 著者名/発表者名: Yoshihara Masato、Kajiyama Hiroaki、Tamauchi Satoshi、Suzuki Shiro、Takahashi Kunihiko、Matsui Shigeyuki、Kikkawa Fumitaka
  • 雑誌名: Journal of Gynecologic Oncology 巻: 30 号: 6
  • DOI: 10.3802/jgo.2019.30.e102
  • 査読あり
• [雑誌論文] Steeper Macular Curvature in Eyes With Non-Highly Myopic Retinitis Pigmentosa. (2019)
  • 著者名/発表者名: Komori S, Ueno S, Ito Y, Sayo A, Meinert M, Kominami T, Inooka D, Kitagawa M, Nishida K, Takahashi K, Matsui S, Terasaki H.
  • 雑誌名: Investigative Ophthalmology & Visual Science 巻: 60 号: 8 ページ: 3135-3141
  • DOI: 10.1167/iovs.19-27334
  • 査読あり
• [雑誌論文] External validation of a risk classification at the emergency department of post-cardiac arrest syndrome patients undergoing targeted temperature management (2019)
  • 著者名/発表者名: Nishikimi Mitsuaki、Ogura Takayuki、Nishida Kazuki、Takahashi Kunihiko、Nakamura Mitsunobu、Matsui Shigeyuki、Matsuda Naoyuki、Iwami Taku
  • 雑誌名: Resuscitation 巻: 140 ページ: 135-141
  • DOI: 10.1016/j.resuscitation.2019.05.028
  • NAID: 120006645293
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Prospective Multicenter Study on the Prognostic and Predictive Impact of Tumor Budding in Stage II Colon Cancer: Results From the SACURA Trial (2019)
  • 著者名/発表者名: Ueno Hideki、Ishiguro Megumi、Nakatani Eiji、Ishikawa Toshiaki、Uetake Hiroyuki、Matsuda Chu、Nakamoto Yoshihiko、Kotake Masanori、Kurachi Kiyotaka、Egawa Tomohisa、Yasumasa Keigo、Murata Kohei、Ikawa Osamu、Shinji Seiichi、Murotani Kenta、Matsui Shigeyuki、Teramukai Satoshi、Tomita Naohiro、Sugihara Kenichi
  • 雑誌名: Journal of Clinical Oncology 巻: 37 号: 22 ページ: 1886-1894
  • DOI: 10.1200/jco.18.02059
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bigram-PGK: phosphoglycerylation prediction using the technique of bigram probabilities of position specific scoring matrix (2019)
  • 著者名/発表者名: Chandra Abel、Sharma Alok、Dehzangi Abdollah、Shigemizu Daichi、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: BMC Molecular and Cell Biology 巻: 20 号: S2 ページ: 57-57
  • DOI: 10.1186/s12860-019-0240-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A comparison of machine learning classifiers for dementia with Lewy bodies using miRNA expression data (2019)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu Daichi、Akiyama Shintaro、Asanomi Yuya、Boroevich Keith A.、Sharma Alok、Tsunoda Tatsuhiko、Sakurai Takashi、Ozaki Kouichi、Ochiya Takahiro、Niida Shumpei
  • 雑誌名: BMC Medical Genomics 巻: 12 号: 1 ページ: 150-150
  • DOI: 10.1186/s12920-019-0607-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] DeepInsight: A methodology to transform a non-image data to an image for convolution neural network architecture (2019)
  • 著者名/発表者名: Sharma Alok、Vans Edwin、Shigemizu Daichi、Boroevich Keith A.、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 11399-11399
  • DOI: 10.1038/s41598-019-47765-6
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Brain wave classification using long short-term memory network based OPTICAL predictor (2019)
  • 著者名/発表者名: Kumar Shiu、Sharma Alok、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1
  • DOI: 10.1038/s41598-019-45605-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] HseSUMO: Sumoylation site prediction using half-sphere exposures of amino acids residues (2019)
  • 著者名/発表者名: Sharma Alok、Lysenko Artem、L?pez Yosvany、Dehzangi Abdollah、Sharma Ronesh、Reddy Hamendra、Sattar Abdul、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 19 号: S9 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1186/s12864-018-5206-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] EvolStruct-Phogly: incorporating structural properties and evolutionary information from profile bigrams for the phosphoglycerylation prediction (2019)
  • 著者名/発表者名: Chandra Abel Avitesh、Sharma Alok、Dehzangi Abdollah、Tsunoda Tatushiko
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 19 号: S9 ページ: 984-984
  • DOI: 10.1186/s12864-018-5383-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Risk prediction models for dementia constructed by supervised principal component analysis using miRNA expression data (2019)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu D, Akiyama S, Asanomi Y, Boroevich KA, Sharma A, Tsunoda T, Matsukuma K, Ichikawa M, Sudo H, Takizawa S, Sakurai T, Ozaki K, Ochiya T, Niida S.
  • 雑誌名: Communication Biology 巻: 2 号: 1 ページ: 77-77
  • DOI: 10.1038/s42003-019-0324-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Block HSIC Lasso: model-free biomarker detection for ultra-high dimensional data (2019)
  • 著者名/発表者名: Climente-Gonzlez Hctor、Azencott Chlo-Agathe、Kaski Samuel、Yamada Makoto
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 35 号: 14 ページ: i427-i435
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btz333
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] compound.Cox: univariate feature selection and compound covariate for predicting survival (2019)
  • 著者名/発表者名: Emura T, Matsui S, Chen HY.
  • 雑誌名: Computer Methods and Programs in Biomedicine 巻: 168 ページ: 21-37
  • DOI: 10.1016/j.cmpb.2018.10.020
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Robust sample-specific stability selection with effective reror control (2019)
  • 著者名/発表者名: Park H, Yamada M, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: J Comput Biol 巻: 26(3) 号: 3 ページ: 202-217
  • DOI: 10.1089/cmb.2018.0180
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Discovering MoRFs by trisecting intrinsically disordered protein sequence into terminals and middle regions (2019)
  • 著者名/発表者名: Sharma Ronesh、Sharma Alok、Patil Ashwini、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 19 号: S13
  • DOI: 10.1186/s12859-018-2396-7
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] GlyStruct: glycation prediction using structural properties of amino acid residues (2019)
  • 著者名/発表者名: Reddy Hamendra Manhar、Sharma Alok、Dehzangi Abdollah、Shigemizu Daichi、Chandra Abel Avitesh、Tsunoda Tatushiko
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 19 号: S13
  • DOI: 10.1186/s12859-018-2547-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Navigating the disease landscape: knowledge representations for contextualizing molecular signatures. (2018)
  • 著者名/発表者名: Mansoor Saqi, Artem Lysenko, Yi-Ke Guo, Tatsuhiko Tsunoda, Charles Auffray
  • 雑誌名: Briefings In Bioinformatics 巻: - 号: 2 ページ: 609-623
  • DOI: 10.1093/bib/bby025
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Exploring predictive biomarkers from clinical genome-wide association studies via multidimensional hierarchical mixture models (2018)
  • 著者名/発表者名: Otani Takahiro、Noma Hisashi、Sugasawa Shonosuke、Kuchiba Aya、Goto Atsushi、Yamaji Taiki、Kochi Yuta、Iwasaki Motoki、Matsui Shigeyuki、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: European Journal of Human Genetics 巻: 27 号: 1 ページ: 140
  • DOI: 10.1038/s41431-018-0251-y
  • NAID: 120006628002
  • 査読あり
• [雑誌論文] Power and sample size calculation incorporating misspecifications of the variance function in comparative clinical trials with over-dispersed count data (2018)
  • 著者名/発表者名: Igeta M, Takahashi K, Matsui S.
  • 雑誌名: Biometrics 巻: 印刷中 号: 4 ページ: 1459-1467
  • DOI: 10.1111/biom.12878
  • 査読あり
• [雑誌論文] Empirical Bayes estimation of semi-parametric hierarchical mixture models for unbiased characterization of polygenic disease architectures (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishino J, Kochi Y, Shigemizu D, Kato M, Ikari K, Ochi H, Noma H, Matsui K, Morizono T, Boroevich K, Tsunoda T, Matsui S.
  • 雑誌名: Frontiers in Genetics 巻: 9 ページ: 115-115
  • DOI: 10.3389/fgene.2018.00115
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Sample Size for Successful Genome-Wide Association Study of Major Depressive Disorder (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishino Jo、Ochi Hidenori、Kochi Yuta、Tsunoda Tatsuhiko、Matsui Shigeyuki
  • 雑誌名: Frontiers in Genetics 巻: 9
  • DOI: 10.3389/fgene.2018.00227
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Re-assessment of multiple testing strategies for more efficient genome-wide association studies (2018)
  • 著者名/発表者名: Otani, T., Noma, H., Nishino, J., Matsui, S.
  • 雑誌名: European Journal of Human Genetics 巻: 26 号: 7 ページ: 1038-1048
  • DOI: 10.1038/s41431-018-0125-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Treatment of patients with sepsis in a closed intensive care unit is associated with improved survival: a nationwide observational study in Japan (2018)
  • 著者名/発表者名: Ogura Takayuki、Nakamura Yoshihiko、Takahashi Kunihiko、Nishida Kazuki、Kobashi Daisuke、Matsui Shigeyuki
  • 雑誌名: Journal of Intensive Care 巻: 6 号: 1
  • DOI: 10.1186/s40560-018-0322-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Multiple-cluster detection test for purely temporal disease clustering: Integration of scan statistics and generalized linear models (2018)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Kunihiko、Shimadzu Hideyasu
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 13 号: 11 ページ: e0207821-e0207821
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0207821
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] An integrative machine learning approach for prediction of toxicity-related drug safety (2018)
  • 著者名/発表者名: Lysenko Artem、Sharma Alok、Boroevich Keith A、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Life Science Alliance 巻: 1 号: 6 ページ: 1-14
  • DOI: 10.26508/lsa.201800098
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] PhoglyStruct: Prediction of phosphoglycerylated lysine residues using structural properties of amino acids (2018)
  • 著者名/発表者名: Chandra Abel、Sharma Alok、Dehzangi Abdollah、Ranganathan Shoba、Jokhan Anjeela、Chou Kuo-Chen、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 17923-17923
  • DOI: 10.1038/s41598-018-36203-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] IMSindel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu Daichi、Miya Fuyuki、Akiyama Shintaro、Okuda Shujiro、Boroevich Keith A、Fujimoto Akihiro、Nakagawa Hidewaki、Ozaki Kouichi、Niida Shumpei、Kanemura Yonehiro、Okamoto Nobuhiko、Saitoh Shinji、Kato Mitsuhiro、Yamasaki Mami、Matsunaga Tatsuo、Mutai Hideki、Kosaki Kenjiro、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 5608-5608
  • DOI: 10.1038/s41598-018-23978-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Improving succinylation prediction accuracy by incorporating the secondary structure via helix, strand and coil, and evolutionary information from profile bigrams (2018)
  • 著者名/発表者名: Dehzangi Abdollah、Lopez Yosvany、Lal Sunil Pranit、Taherzadeh Ghazaleh、Sattar Abdul、Tsunoda Tatsuhiko、Sharma Alok
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 13 号: 2 ページ: e0191900-e0191900
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0191900
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Success: evolutionary and structural properties of amino acids prove effective for succinylation site prediction (2018)
  • 著者名/発表者名: Lopez Yosvany、Sharma Alok、Dehzangi Abdollah、Lal Sunil Pranit、Taherzadeh Ghazaleh、Sattar Abdul、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 19(Suppl 1) 号: S1 ページ: 923-923
  • DOI: 10.1186/s12864-017-4336-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] OPAL: prediction of MoRF regions in intrinsically disordered protein sequences (2018)
  • 著者名/発表者名: Sharma Ronesh、Raicar Gaurav、Tsunoda Tatsuhiko、Patil Ashwini、Sharma Alok
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 34 号: 11 ページ: 1850-1858
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bty032
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] SumSec: Accurate Prediction of Sumoylation Sites Using Predicted Secondary Structure (2018)
  • 著者名/発表者名: Dehzangi Abdollah、Lopez Yosvany、Taherzadeh Ghazaleh、Sharma Alok、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Molecules 巻: 23 号: 12 ページ: 3260-3260
  • DOI: 10.3390/molecules23123260
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] MoRFPred-plus: Computational Identification of MoRFs in Protein Sequences using Physicochemical Properties and HMM profiles (2018)
  • 著者名/発表者名: Sharma Ronesh、Bayarjargal Maitsetseg、Tsunoda Tatsuhiko、Patil Ashwini、Sharma Alok
  • 雑誌名: Journal of Theoretical Biology 巻: 437 ページ: 9-16
  • DOI: 10.1016/j.jtbi.2017.10.015
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Estimation of the average causal effect vis multiple propensity score stratification (2018)
  • 著者名/発表者名: Nomura T, Hattori S
  • 雑誌名: Communications in Statistics, Simulation and Computation 巻: 47 号: 1 ページ: 48-62
  • DOI: 10.1080/03610918.2016.1208230
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Goodness-of-fit test for the parametric proportional hazard regression model with interval-censored data (2018)
  • 著者名/発表者名: Sakurai Rieko、Hattori Satoshi
  • 雑誌名: Biostatistics & Epidemiology 巻: 2 号: 1 ページ: 115-131
  • DOI: 10.1080/24709360.2018.1529347
  • 査読あり
• [雑誌論文] B-スプライン及びAdaptive Group LASSOに基づく正則化非線形ロジットモデルによるデフォルト確率の推定 (2018)
  • 著者名/発表者名: 高部勲, 山下智志
  • 雑誌名: 統計数理 巻: 66 ページ: 295-317
  • NAID: 120006727398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Empirical Bayes estimation of semi-parametric hierarchical mixture models for unbiased characterization of polygenic disease architectures (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishino J, Kochi Y, Shigemizu D, Kato M, Ikari K, Ochi H, Noma H, Matsui K, Morizono T, Boroevich K, Tsunoda T, Matsui S.
  • 雑誌名: Frontiers in Genetics 巻: 印刷中
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] オミクス研究における検証的解析と探索的解析：多重検定とP値を中心に (2018)
  • 著者名/発表者名: 松井茂之
  • 雑誌名: 計量生物学 巻: 38 ページ: 127-139
  • NAID: 130006742188
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Effect of administration of ramelteon, a melatonin receptor agonist, on the duration of stay in the ICU: A single-center randomized placebo-controlled trial (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishikimi M, Numaguchi A, Takahashi K, Miyagawa Y, Matsui K, Higashi M, Makishi G, Matsui S, Matsuda N
  • 雑誌名: Critical Care Medicine 巻: 印刷中 号: 7 ページ: 1099-1105
  • DOI: 10.1097/ccm.0000000000003132
  • 査読あり
• [雑誌論文] Two-stage approach based on zone and dose findings for two-agent combination phase I/II trials (2018)
  • 著者名/発表者名: Shimamura F, Hamada C, Matsui S, Hirakawa A
  • 雑誌名: Journal of Biopharmaceutical Statistics 巻: 印刷中 号: 6 ページ: 999-999
  • DOI: 10.1080/10543406.2018.1434190
  • 査読あり
• [雑誌論文] A dose-response meta-analysis to coffee consumption and colorectal cancer risk in the Japanese population: Application of a cubic-spline model (2018)
  • 著者名/発表者名: Horisaki K, Takahashi K, Ito H, Matsui S
  • 雑誌名: Journal of Epidemiology 巻: 印刷中
  • NAID: 130007534681
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biomarker-stratified phase III clinical trials: Enhancement with a subgroup-focused sequential design (2018)
  • 著者名/発表者名: Matsui S, Crowley J
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 巻: 24 号: 5 ページ: 994-1001
  • DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-17-1552
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Multi-subgroup gene screening using semi-parametric hierarchical mixture models and the optimal discovery procedure: Application to a randomized clinical trial in multiple myeloma (2018)
  • 著者名/発表者名: Matsui S, Noma H, Qu P, Sakai Y, Matsui K, Heuck C, Crowley J
  • 雑誌名: Biometrics 巻: 74 号: 1 ページ: 313-320
  • DOI: 10.1111/biom.12716
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Sensitivity analysis for publication bias of diagnostic studies for a continuous biomarker (2018)
  • 著者名/発表者名: Hattori S, Zhou XH
  • 雑誌名: Statistics in Medicine 巻: 37 号: 3 ページ: 327-342
  • DOI: 10.1002/sim.7510
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Personalized dynamic prediction of death according to tumour progression (2017)
  • 著者名/発表者名: Emura T, Nakatochi M, Matsui S, Michimae H, Rondeau V.
  • 雑誌名: Statistical Methods in Medical Research 巻: In press 号: 9 ページ: 2842-2858
  • DOI: 10.1177/0962280216688032
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] An efficient and flexible test for rare variant effects (2017)
  • 著者名/発表者名: Sugasawa, S., Noma, H., Otani, T., Nishino, J. and Matsui, S.
  • 雑誌名: European Journal of Human Genetics 巻: 印刷中 号: 6 ページ: 19-35
  • DOI: 10.1038/ejhg.2017.43
  • 査読あり
• [雑誌論文] Correcting estimation bias in randomized clinical trials with a test of treatment-by-biomarker interaction (2017)
  • 著者名/発表者名: Toyoizumi K, Matsui S
  • 雑誌名: Statistics in Biopharmaceutical Research 巻: 9 号: 2 ページ: 172-179
  • DOI: 10.1080/19466315.2016.1255252
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spatial analysis for regional behavior of patients with mental disorders in Japan (2017)
  • 著者名/発表者名: Takahashi K, Tachimori H, Kan C, Nishi D, Okumura Y, Kato N, Takeshima T
  • 雑誌名: Psychiatry and Clinical Neurosciences 巻: 71 号: 4 ページ: 254-261
  • DOI: 10.1111/pcn.12488
  • NAID: 120006328987
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epidemiology of overdose episodes from the period prior to hospitalization for drug poisoning until discharge in Japan: An exploratory descriptive study using a nationwide claims database (2017)
  • 著者名/発表者名: Okumura Y, Sakata N, Takahashi K, Nishi D, Tachimori H
  • 雑誌名: Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ 巻: 27 号: 8 ページ: 373-380
  • DOI: 10.1016/j.je.2016.08.010
  • NAID: 130005906915
  • ISSN: 0917-5040, 1349-9092
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 2D-EM clustering approach for high-dimensional data through folding feature vectors (2017)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Kamola PJ, Tsunoda T
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 18 号: S16 ページ: 547-547
  • DOI: 10.1186/s12859-017-1970-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Divisive hierarchical maximum likelihood clustering (2017)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Lopez Y, Tsunoda T
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 18 号: S16 ページ: 546-546
  • DOI: 10.1186/s12859-017-1965-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Arete - candidate gene prioritization using biological network topology with additional evidence types (2017)
  • 著者名/発表者名: Lysenko A, Boroevich KA, Tsunoda T
  • 雑誌名: BioData Mining 巻: 10 号: 1 ページ: 22-22
  • DOI: 10.1186/s13040-017-0141-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The prediction models for postoperative overall survival and disease-free survival in patients with breast cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Shigemizu Daichi、Iwase Takuji、Yoshimoto Masataka、Suzuki Yasuyo、Miya Fuyuki、Boroevich Keith A、Katagiri Toyomasa、Zembutsu Hitoshi、Tsunoda Tatsuhiko
  • 雑誌名: Cancer Medicine 巻: 6 号: 7 ページ: 1627-1638
  • DOI: 10.1002/cam4.1092
  • NAID: 120006894608
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Meta-analysis of prognostic studies evaluating time-dependent diagnostic and predictive capacities of biomarkers (2017)
  • 著者名/発表者名: Hattori S, Zhou XH
  • 雑誌名: Frontiers of Biostatistical Methods and Applications in Clinical Oncology (Matsui S. and Crowley J. J., editors), Springer Monograph 巻: - ページ: 257-276
  • DOI: 10.1007/978-981-10-0126-0_16
  • ISBN: 9789811001246, 9789811001260
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Phase III clinical trial designs incorporating predictive biomarkers: an overview (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsui S
  • 雑誌名: Frontiers of Biostatistical Methods and Applications in Clinical Oncology (Matsui S. and Crowley J. J., editors), Springer Monograph 巻: - ページ: 85-104
  • DOI: 10.1007/978-981-10-0126-0_7
  • ISBN: 9789811001246, 9789811001260
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Efficient study designs and semiparametric inference methods for developing genomic biomarkers in cancer clinical research (2017)
  • 著者名/発表者名: Noma H
  • 雑誌名: Frontiers of Biostatistical Methods and Applications in Clinical Oncology (Matsui S. and Crowley J. J., editors), Springer Monograph 巻: - ページ: 381-400
  • DOI: 10.1007/978-981-10-0126-0_23
  • ISBN: 9789811001246, 9789811001260
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Hierarchical Maximum Likelihood Clustering Approach. (2017)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Boroevich KA, Shigemizu D, Kamatani Y, Kubo M, Tsunoda T.
  • 雑誌名: IEEE Transactions on Biomedical Engineering 巻: 64 号: 1 ページ: 112-122
  • DOI: 10.1109/tbme.2016.2542212
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Doubly robust estimators for net survival rates in analyses of cancer registry data (2017)
  • 著者名/発表者名: Komukai S, Hattori S
  • 雑誌名: Biometrics 巻: 73 号: 1 ページ: 124-133
  • DOI: 10.1111/biom.12568
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] CAST: a new score for early prediction of neurological outcomes after cardiac arrest before therapeutic hypothermia with high accuracy. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nishikimi M, Matsuda N, Matsui K, Takahashi K, Ejima T, Liu K, Ogura T,
  • 雑誌名: Intensive Care Med. 巻: 42 号: 12 ページ: 2106-2107
  • DOI: 10.1007/s00134-016-4492-3
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Genome-wide DNA Copy-number Analysis in ACTS-CC Trial of Adjuvant Chemotherapy for Stage III Colonic Cancer. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa T, Uetake H, Murotani K, Kobunai T, Ishiguro M, Matsui S, Sugihara K.
  • 雑誌名: Anticancer Res. 巻: 36 ページ: 853-860
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stepwise iterative maximum likelihood clustering approach (2016)
  • 著者名/発表者名: Alok Sharma, Daichi Shigemizu, Keith A. Boroevich, Yosvany Lopez, Yoichiro Kamatani, Michiaki Kubo, Tatsuhiko Tsunoda
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 17 号: 1 ページ: 319-319
  • DOI: 10.1186/s12859-016-1184-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Time-dependent summary receiver operating characteristics for meta-analyses of prognostic studies (2016)
  • 著者名/発表者名: Hattori S and Zhou XH
  • 雑誌名: Statistics in Medicine 巻: 35 号: 26 ページ: 4746-4763
  • DOI: 10.1002/sim.7029
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Evaluation of predictive capacities of biomarkers based on research synthesis. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hattori S and Zhou XH
  • 雑誌名: Statistics in Medicine 巻: 35 号: 25 ページ: 4559-4572
  • DOI: 10.1002/sim.7018
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of prognostic studies for a biomarker with a study-specific cutoff value (2016)
  • 著者名/発表者名: Sadashima E, Hattori S, Takahashi K
  • 雑誌名: Research Synthesis Methods 巻: 00 号: 4 ページ: 00-00
  • DOI: 10.1002/jrsm.1201
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] AI医療技術の検証に向けて：現状と課題 (2021)
  • 著者名/発表者名: 松井茂之
  • 学会等名: IBISML 電子情報通信学会
  • 招待講演
• [学会発表] 脳画像を用いた疾患関連解析における神経学的，機能的領域を考慮した多重検定 (2020)
  • 著者名/発表者名: 江本 遼, 松井茂之
  • 学会等名: 2020年度統計関連学会連合大会
• [学会発表] 重み付き尤度関数を用いた治療効果のバイアス補正 (2020)
  • 著者名/発表者名: 豊泉樹一郎, 松井茂之
  • 学会等名: 2020年度統計関連学会連合大会
• [学会発表] Incorporating follow-up lengths in sample size re-estimation to compare over-dispersed count data. (2020)
  • 著者名/発表者名: Masataka Igeta, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: ISCB 2020 International Society of Clinical Biostatistics
  • 国際学会
• [学会発表] Topological Bayesian optimization with persistence diagrams (2020)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Shiraishi, Tam Le, Hisashi Kashima, Makoto Yamada
  • 学会等名: ECAI 2020 24th European Conference on Artificial Intelligence
  • 国際学会
• [学会発表] More powerful selective kernel tests for feature selection (2020)
  • 著者名/発表者名: Jen Ning Lim, Makoto Yamada, Wittawat Jitkrittum, Yoshikazu Terada, Shigeyuki Matsui, Hidetoshi Shimodaira
  • 学会等名: AISTAT2020 International Conference on Artificial Intelligence and Statistics
  • 国際学会
• [学会発表] Sparse Hilbert-Schmidt independence criterion regression (2020)
  • 著者名/発表者名: Benjamin Poignard, Makoto Yamada
  • 学会等名: AISTAT2020 International Conference on Artificial Intelligence and Statistics
  • 国際学会
• [学会発表] Unsupervised nonlinear feature selection from high-dimensional signed networks (2020)
  • 著者名/発表者名: Qiang Huang, Tingyu Xia, Huiyan Sun, Makoto Yamada, Y. Chang
  • 学会等名: 34th AAAI Conference on Artificial Intelligence
  • 国際学会
• [学会発表] New directions in statistical methodology for precision medicine clinical studies. (2020)
  • 著者名/発表者名: Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Royal Statistical Society North Eastern Local Group Seminar
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Personalized Cancer Medicine with Heterogeneity and Immunological Analysis. (2020)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: CREST International Symposium on Big Data Application
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Unsupervised Nonlinear Feature Selection from High-dimensional Signed Networks. (2020)
  • 著者名/発表者名: Qiang Huang, Tingyu Xia, Huiyan Sun, Makoto Yamada, Y. Chang
  • 学会等名: 34th AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI)
  • 国際学会
• [学会発表] A model-based framework for voxel and region level inferences in neuroimaging disease-association studies. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryo Emoto, Atsushi Kawaguchi, Takahiro Otani, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: 16th International Conference on Information Technology : New Generations (ITNG 2019)
  • 国際学会
• [学会発表] Application of the multi-dimensional hierarchical mixture model to cross-disorder genome-wide association studies. (2019)
  • 著者名/発表者名: Takahiro Otani, Jo Nishino, Ryo Emoto, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: 16th International Conference on Information Technology: New Generations (ITNG 2019)
  • 国際学会
• [学会発表] オミクス関連解析における選択マーカー数を固定した二段階スクリーニング法. (2019)
  • 著者名/発表者名: 川端 孝典，江本 遼，西野 穣，高橋 邦彦，松井 茂之
  • 学会等名: 日本計量生物学会2019年会
• [学会発表] ゲノムワイド関連研究におけるセミパラメトリックベイズ因子解析. (2019)
  • 著者名/発表者名: 森澤 淳司，大谷 隆浩，西野 穣，高橋 邦彦，松井 茂之
  • 学会等名: 日本計量生物学会2019年会
• [学会発表] Blinded Sample Size Re-estimation with Over-Dispersed Count Data under Incorrect Specification of the Working Variance Function. (2019)
  • 著者名/発表者名: Masataka Igeta, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Annual Meeting, Western North American Region of The International Biometric Society
  • 国際学会
• [学会発表] Screening Fixed Numbers of Genomic Features for Validation Studies Incorporating Statistical and Biological Consideration. (2019)
  • 著者名/発表者名: Takanori Kawabata, Ryo Emoto, Jo Nishino, Kunihiko Takahashi, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Annual Meeting, Western North American Region of The International Biometric Society
  • 国際学会
• [学会発表] Bias-Correction in Estimating Treatment Effect in Fallback Analysis: An Approach Based on Randomized Test with Smooth Rejection Functions. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kiichiro Toyoizumi, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Joint Statistical Meeting 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Data-driven Medical Sciences with Omic Analysis. (2019)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: Moonshot International Symposium 2019
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Kernel Stein Tests for Multiple Model Comparison. (2019)
  • 著者名/発表者名: Jen Ning Lim, Makoto Yamada, Bernhard Schölkopf, Wittawat Jitkrittum
  • 学会等名: NeurIPS 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Approximation Ratios of Graph Neural Networks for Combinatorial Problems (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Sato, Makoto Yamada, Hisashi Kashima
  • 学会等名: NeurIPS 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Learning to Sample Hard Instances for Graph Algorithms. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryoma Sato, Makoto Yamada, Hisashi Kashima
  • 学会等名: ACML 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Post Selection Inference with Incomplete Maximum Mean Discrepancy Estimator. (2019)
  • 著者名/発表者名: Makoto Yamada, Denny Wu, Yao-Hung Hubert Tsai, Hirofumi Ohta, Ruslan Salakhutdinov, Ichiro Takeuchi, Kenji Fukumizu
  • 学会等名: ICLR 2019
  • 国際学会
• [学会発表] Factorization Machinesを用いたCoxハザードモデル. (2019)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 哉太, 山田 誠, 松井 孝太, 松井 茂之, 鹿島 久嗣
  • 学会等名: 2019年度人工知能学会全国大会（第33回）.
• [学会発表] Bayesian sensitivity analysis for publication bias in meta-analysis of diagnostic studies. (2019)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Hattori
  • 学会等名: The 3rd International Conference on Econometrics and Statistics (EcoSta 2019).
  • 国際学会
• [学会発表] 要約concordance indexによる予後因子研究のメタアナリシス. (2019)
  • 著者名/発表者名: 服部聡
  • 学会等名: 2019年統計関連学会連合大会
• [学会発表] 臨床試験登録システムを用いたCopas選択モデルの推測. (2019)
  • 著者名/発表者名: 黄傲、小向翔、服部聡
  • 学会等名: 2019年統計関連学会連合大会.
• [学会発表] Multiple testing and estimation of disease associations based on semi-parametric hierarchical mixture models, possibly incorporating brain areas. (2019)
  • 著者名/発表者名: Ryo Emoto, Takahiro Otani, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Eastern North American Region International Biometric Society 2019 Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Blinded sample size re-estimation in comparative clinical trials with over-dispersed count data: Incorporation of misspecification of the variance function. (2019)
  • 著者名/発表者名: Masataka Igeta, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Eastern North American Region International Biometric Society 2019 Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Phase III Clinical trial design for targeted therapies with uncertain biomarker evidence: controversies and solutions (2018)
  • 著者名/発表者名: Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: OHSU Cancer Biostatistics Workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 生物・医学分野の新たな展開：データを中心とした拡がり/繋がり (2018)
  • 著者名/発表者名: 松井茂之
  • 学会等名: 2018年度統計関連学会連合大会日本計量生物学会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Trans-omic Analysis strategy for precision medicine. (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: The 2nd International Symposium for Trans-Omics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Omic big data analysis drives precision medicine. (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: The 8th Annual Translational Bioinformatics Conference/2018 Annual Conference of Korean Society for Bioinformatics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Public big data accelerate medical science research. (2018)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: The 63rd Annual Meeting of the Japan Society of Human Genetics.
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Sensitivity analysis for publication bias in meta-analysis of diagnostic studies for a continuous biomarker. (2018)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Hattori
  • 学会等名: The 2nd International Conference on Econometrics and Statistics (EcoSta2018)
  • 国際学会
• [学会発表] AIと機械学習の直感的理解と金融への応用. (2018)
  • 著者名/発表者名: 山下智志
  • 学会等名: 日本銀行金融機構局金融高度化センターWS
• [学会発表] 信用リスクの基礎，応用，最近の話題. (2018)
  • 著者名/発表者名: 山下智志
  • 学会等名: 国際協力銀行信用リスクセミナー
• [学会発表] Hierarchical mixture modeling for multiple testing and effect size estimation in voxel-level inference of neuroimaging data (2018)
  • 著者名/発表者名: Ryo Emoto, Atsushi Kawaguchi, Hisako Yoshida, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Joint Statistical Meeting 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Bias-corrected estimation of treatment effects in biomarker-based adaptive subgroup analysis: New approach based on randomized tests with smooth rejection function. (2018)
  • 著者名/発表者名: Kiichiro Toyoizumi, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Joint Statistical Meeting 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Two-stage analysis for selecting fixed numbers of features in omics association studies. (2018)
  • 著者名/発表者名: Takanori Kawabata, Ryo Emoto, Jo Nishino J, Kunihiko Takahashi, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: XXIX International Biometric Conference
  • 国際学会
• [学会発表] A transfer learning method for multi-center prognostic prediction analysis. (2018)
  • 著者名/発表者名: Kota Matsui, Kenta Kanamori, Wataru Kumagai, Mitsuaki Nishikimi, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: 3rd International Workshop on Biomedical Informatics with Optimization and Machine Learning in conjunction with 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI 2018)
  • 国際学会
• [学会発表] Multiple Testing Based on Semi-Parametric Hierarchical Mixture Models under Dependency in Disease-Association Studies with Neuroimaging Data (2018)
  • 著者名/発表者名: Ryo Emoto, Atsushi Kawaguchi, Hisako Yoshida, Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Eastern North American Region International Biometric Society 2018 Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Evaluating Sample Sizes in Comparing Over-Dispersed Count Data Under Incorrect Variance Structure (2018)
  • 著者名/発表者名: Masataka Igeta, Kunihiko Takahashi and Shigeyuki Matsui
  • 学会等名: Eastern North American Region International Biometric Society 2018 Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] 治療効果予測マーカーを用いた第三相試験： マーカー層別デザインの改良 (2018)
  • 著者名/発表者名: 松井茂之, John Crowley
  • 学会等名: 2018年日本計量生物学会年会
• [学会発表] 日本人におけるコーヒー摂取量と大腸がん発生リスクの用量反応関係メタアナリシス (2018)
  • 著者名/発表者名: 堀崎健，高橋邦彦，伊藤秀美，松井茂之
  • 学会等名: 第28回日本疫学会学術総会
• [学会発表] Prognostic impact of MSI in stage II colon cancers: An additional translational study of the SACURA trial (2017)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa T, Ishiguro M, Nakatani E, Uetake H, Ueno H, Murotani K, Matsui S, Tomita N, Shimada Y, Takahashi K, Kotake K, Watanabe M, Mochizuki H, Teramukai S, Sugihara K
  • 学会等名: American Society of Clinical Oncology (ASCO) 2017 Annual Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Prognostic impact of tumor budding in Stage II colon cancer: A Prospective study (SACURA trial). (2017)
  • 著者名/発表者名: Ueno H, Ishiguro M, Nakatani E, Ishikawa T, Uetake H, Murotani K, Matsui S, Tomita N, Shimada Y, Takahashi K, Kotake K, Watanabe M, Mochizuki H, Tramukai S, Sugihara K
  • 学会等名: American Society of Clinical Oncology (ASCO) 2017 Annual Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Omics 研究における検証的解析と探索的解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 松井茂之
  • 学会等名: 2017年度統計関連学会連合大会
  • 招待講演
• [学会発表] Two-level simple recourse programming problems with discrete random variables (2017)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Yano, Ichiro Nishizaki, Kota Matsui
  • 学会等名: Modeling Decisions for Artificial Intelligence (MDAI).
  • 招待講演
• [学会発表] Exploring etiologies, sub-classification, and risk prediction of diseases based on big-data analysis of clinical and whole omics data in medicine (2017)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: CREST Big Data Fields Joint Meeting 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Trans-omic analysis drives precision medicine (2017)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: The 1st International Symposium for Trans-Omics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Multi-omic analysis for precision cancer medicine (2017)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: DNA sequencing technologies and their application in practice WS
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Omic analysis drives precision medicine (2017)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: International Conference for Precision Cancer Medicine 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Multiomics and clinical analysis of cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Tsunoda
  • 学会等名: CREST International Symposium on Big Data Application 2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 医学・医療ビッグデータによるマルチオミックス解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 角田達彦
  • 学会等名: 東京医科歯科大学‐早稲田大学連携ワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノムビッグデータと人工知能による未来の医療 (2017)
  • 著者名/発表者名: 角田達彦
  • 学会等名: 市民公開講座 2017
  • 招待講演
• [学会発表] Issue of selection bias in statistical analysis of observational studies (2017)
  • 著者名/発表者名: 服部聡
  • 学会等名: 日本循環器学会
  • 招待講演
• [学会発表] Doubly robust estimator for net survival rate in analyses of cancer registry data (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Hattori
  • 学会等名: EcoSta2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 時間依存性要約ROC 解析によるバイオマーカーの評価 (2017)
  • 著者名/発表者名: 服部聡
  • 学会等名: 日本計算機統計学会
  • 招待講演
• [学会発表] Time-dependent summary ROC analysis for meta-analysis of prognostic studies (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Hattori
  • 学会等名: CMstatistics2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 国際ミクロ統計データベースの整備と利用 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岡本基, 山下智志
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
• [学会発表] 多項ロジットモデル及び主成分分析を用いた統計的マッチング手法の提案 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高部勲, 山下智志
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
• [学会発表] A new statistical matching methodology using multinomial logistic regression and multivariate analysis (2017)
  • 著者名/発表者名: Takabe I, Yamashita S
  • 学会等名: International Federation of Classification Societies
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] セミパラメトリック階層混合モデルによる複雑疾患GWASの解析 - 多遺伝因子構造の理解に向けて (2017)
  • 著者名/発表者名: 西野穣, 高地雄太, 重水大智, 加藤護, 猪狩勝則, 越智秀典, 野間久史, 松井孝太, 大谷隆浩, 森園隆, Keith A Boroevich, 角田達彦, 松井茂之
  • 学会等名: 第27回日本疫学会学術総会
• [学会発表] 個別化医療に向けて進化する臨床試験デザイン (2017)
  • 著者名/発表者名: 松井茂之
  • 学会等名: 科研費シンポジウム「統計科学が切り拓く個別化医療：方法論・実践のフロンティア」
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノムワイド関連解析における多重検定手法の効率性評価 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大谷隆浩，野間久史，西野穣，松井茂之
  • 学会等名: 科研費シンポジウム「統計科学が切り拓く個別化医療：方法論・実践のフロンティア」
• [学会発表] オミックス解析によるゲノム医療の新たな展開 (2017)
  • 著者名/発表者名: 角田達彦
  • 学会等名: 科研費シンポジウム「統計科学が切り拓く個別化医療：方法論・実践のフロンティア」
  • 招待講演
• [学会発表] Cancer outlier analysis based on a nested two-way clustering. (2016)
  • 著者名/発表者名: Oura T, Matsui K, Matsui S
  • 学会等名: XXVIIIth International Biometric Conference
  • 国際学会
• [学会発表] A comparison of multiple testing methods for effective strategies in genome-wide association studies (2016)
  • 著者名/発表者名: Otani T, Noma H, Nishino J, Matsui K, Matsui S
  • 学会等名: XXVIIIth International Biometric Conference
  • 国際学会
• [学会発表] A multiple cluster detection test for disease clustering based on scan statistics (2016)
  • 著者名/発表者名: Takahashi K, Shimadzu H
  • 学会等名: XXVIIIth International Biometric Conference
  • 国際学会
• [学会発表] Spatial epidemiology: risk assessment of spatio-temporal events (2016)
  • 著者名/発表者名: Takahashi K
  • 学会等名: 13th DIA JAPAN Anuual Meeting 2016
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Socioeconomic impacts of policy on Rx-to-OTC switch to prescription of wthcal drugs in Japan (2016)
  • 著者名/発表者名: Shimazaki K, Takano Y, Mochizuki M, Takahashi K, Urushihara H
  • 学会等名: 32rd International Conference on Pharmacoepidemiology and Therapeutic Risk Management
  • 国際学会
• [学会発表] 複雑疾患GWASデータのセミパラメトリック階層混合モデル解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西野穣, 高地雄太, 重水大智, 加藤護, 猪狩勝則, 越智秀典, 野間久史, 松井孝太, 森園隆, Keith A Boroevich, 角田達彦, 松井茂之
  • 学会等名: 第22回国際個別化医療学会学術集会
• [学会発表] Heterogeneous Transfer Learning Based on Sparse Coding (2016)
  • 著者名/発表者名: 松井孝太，熊谷亘，金森敬文
  • 学会等名: 第19回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2016)
• [学会発表] Exploring etiologies, sub-classification, and risk prediction of diseases based on big-data analysis of clinical and whole omics data in medicine (2016)
  • 著者名/発表者名: T.Tsunoda
  • 学会等名: CREST Big Data Fields Joint Meeting 2016
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Strategies for discovering disease-associated modules in integrated biological networks (2016)
  • 著者名/発表者名: A.Lysenko, P.J.Kamola, K.A.Boroevich, T.Tsunoda.
  • 学会等名: 9th Annual RECOMB/ISCB Conference on Regulatory & Systems Genomics 2016
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Trans-omic analysis strategy for precision medicine (2016)
  • 著者名/発表者名: T.Tsunoda
  • 学会等名: The 26th Hot Spring Harbor International Symposium - Trans-omics: New Approaches in Biology and Medicine 2016
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Exploring etiologies, sub-classification, and risk prediction of diseases based on big-data analysis of clinical and whole omics data in medicine (2016)
  • 著者名/発表者名: T.Tsunoda
  • 学会等名: CREST Big Data Field Joint Symposium 2016
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 医学・医療ビッグデータ解析による個別化医療と先制医療 (2016)
  • 著者名/発表者名: 角田達彦
  • 学会等名: 日本遺伝子診療学会大会シンポジウム「遺伝統計学の基礎と臨床応用」
  • 招待講演
• [学会発表] メタアナリシスに基づくバイオマーカーの予測値曲線の推定 (2016)
  • 著者名/発表者名: 服部聡
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
• [学会発表] 公的統計ミクロデータ研究コンソーシアムによる高等教育研究支援 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山下智志, 岡本基
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
• [学会発表] 「国際ミクロ統計データベース」の利活用について (2016)
  • 著者名/発表者名: 岡本基, 山下智志
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
• [学会発表] リスク科学と目的・データ・統計的方法論 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山下智志
  • 学会等名: 統計関連学会連合大会
• [学会発表] A new approach of micro-data analysis through international cooperation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Yamashita
  • 学会等名: The 8th International Workshop on Analysis of Micro Data of Official Statistics
  • 国際学会 / 招待講演
• [図書] Dose-Finding Designs for Early-Phase Cancer Clinical Trials: A Brief Guidebook to Theory and Practice (2019)
  • 著者名/発表者名: Daimon T, Hirakawa A, Matsui S
  • 総ページ数: 133
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9784431555858
• [図書] Survival Analysis with Correlated Endpoints: Joint Frailty-Copula Models (2019)
  • 著者名/発表者名: Emura T, Chen YH, Matsui S, Rondeau V
  • 総ページ数: 118
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9789811335150
• [図書] Biomarker-based phase II and III clinical trials in oncology. In Textbook of Clinical Trials in Oncology. (eds. S. Halabi and S. Michiels). (2019)
  • 著者名/発表者名: Matsui S, Igeta M, Toyoizumi K
  • 総ページ数: 24
  • 出版者: CRC Press
  • ISBN: 9781315112084
• [図書] Genome-Wide Association Studies, (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsunoda T, Tanaka T, Nakamura Y
  • 総ページ数: 209
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9789811381775
• [図書] Subject-Specific-Frequency-Band for Motor Imagery EEG Signal Recognition Based on Common Spatial Spectral Pattern. In: Nayak A., Sharma A. (eds) PRICAI 2019: Trends in Artificial Intelligence. PRICAI 2019. Lecture Notes in Computer Science, vol 11671 (2019)
  • 著者名/発表者名: Kumar S, Sharma A, Tsunoda T
  • 総ページ数: 10
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9783030299118
• [図書] Modern Dose-Finding Designs for Cancer Phase I Trials: Drug Combination and Molecularly Targeted Agents (2018)
  • 著者名/発表者名: Hirakawa A, Sato H, Daimon T, Matsui S
  • 総ページ数: 89
  • 出版者: Springer
• [図書] Frontiers of Biostatistical Methods and Applications in Clinical Oncology (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsui S, Crowley J.
  • 総ページ数: 438
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9789811001246
• [図書] Modern Dose-Finding Designs for Cancer Phase I Trials: Drug Combination and Molecularly Targeted Agents. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hirakawa A, Sato H, Daimon T, Matsui S.
  • 総ページ数: 89
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9784431555735
• [備考] 名古屋大学医学系研究科生物統計学分野
  • URL: http://nagoya-biostat.jp/
• [備考] 個別化医療のための統計的方法論の構築と実践に関する総合的研究
  • URL: http://nagoya-biostat.jp/kaken-s/
• [備考] 個別化医療のための統計的方法論の構築と実践に関する研究
  • URL: http://nagoya-biostat.jp/kaken-s/
• [備考] 個別化医療の開発のための統計的方法論の構築とその実践に関する総合的研究
  • URL: http://www.nagoya-biostat.jp/kaken-s/index.html
• [学会・シンポジウム開催] 3rd Pacific Rim Cancer Biostatistics Workshop (2019)
• [学会・シンポジウム開催] Second Pacific Rim Cancer Biostatistics Workshop (2017)